; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0003878 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0003878
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationchr10:3263720..3266788
RNA-Seq ExpressionIVF0003878
SyntenyIVF0003878
Gene Ontology termsGO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0034290.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]2.16e-29099.76Show/hide
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XP_004135263.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770 isoform X1 [Cucumis sativus]6.28e-31591.04Show/hide
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XP_016900303.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770 isoform X2 [Cucumis melo]3.74e-291100Show/hide
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XP_038893310.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770 isoform X1 [Benincasa hispida]2.02e-29986.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS91 Uncharacterized protein1.1e-24991.04Show/hide
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A0A1S3BF94 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770 isoform X18.2e-277100Show/hide
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A0A1S4DWF5 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g60770 isoform X21.7e-229100Show/hide
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A0A5A7STI9 Pentatricopeptide repeat-containing protein6.3e-22999.76Show/hide
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A0A5D3CZL9 Pentatricopeptide repeat-containing protein1.7e-229100Show/hide
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Query:  KVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLK
        KVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLK
Subjt:  KVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLK

Query:  NGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACK
        NGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACK
Subjt:  NGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACK

Query:  KLLNEISIE
        KLLNEISIE
Subjt:  KLLNEISIE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22714 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g607701.6e-18967.62Show/hide
Query:  LPLRKFKPSKDLAKRSTEKYLEEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLV
        + +R    S+D+ KRST+KY+EE LY RLFKDGG+E  VR QLN+F+K  K VFKWEVGDT+KKLR+R LYYPALKLSE M +RGMNKTVSDQAIHLDLV
Subjt:  LPLRKFKPSKDLAKRSTEKYLEEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLV

Query:  AKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWM
        AKAR I A ENYFV LPE+SK  L+Y SLLNCYCKELLTEKAE L  KMKELN+  +SM  N LMTLYTK G+ +KVP++IQE+KA NV  DSYTY VWM
Subjt:  AKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWM

Query:  RALAALNDISGVERVIDEMKRDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANI
        RALAA NDISGVERVI+EM RDG V  DWTTYSN+ASIYV+A + +KA KAL +LE  NT RD  A+QFLITLYG++G L +VY +WRSLRLA P+T+N+
Subjt:  RALAALNDISGVERVIDEMKRDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANI

Query:  SYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGK
        +YLNMIQ L+KL DLPGAE  FKEW++ CSTYDIRI N LIGAY +EGL++KA  LKE+A +RG + NAKTWEIF+DYY+K+G+   A +C++KAVS GK
Subjt:  SYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGK

Query:  GDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEIS
        GDGGKW+PSPE +++ MS+FEQ+KDV+GAE+ LEI+K   D++ +E+FE LIRTY+AAG++  +M RRLKMENVEV+EA KKLL+E+S
Subjt:  GDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEIS

Q8LPS6 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g021509.6e-6533.98Show/hide
Query:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRG--MNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTE
        LN++ K+ +++ KWE+   +K+LR  K    AL++ + M  RG     + SD AI LDL+ K RGI  AE +F+ LPE+ K+   Y SLLN Y +    E
Subjt:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRG--MNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTE

Query:  KAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRD-GVKGDWTTYSNLASIYV
        KAE+L   M++    L  +P N +MTLY  + + DKV +++ EMK  ++  D Y+Y +W+ +  +L  +  +E V  +MK D  +  +WTT+S +A++Y+
Subjt:  KAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRD-GVKGDWTTYSNLASIYV

Query:  NANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANAL
             EKA  AL  +E   T R+   + +L++LYG +G+  ++Y VW   +   P   N+ Y  ++ +L+++ D+ GAEK ++EW    S+YD RI N L
Subjt:  NANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANAL

Query:  IGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTV
        + AY K   LE A  L +  ++ G +P++ TWEI    + +      A  C+  A S        W P   ++  F    E+E DV   E+ LE+++++ 
Subjt:  IGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTV

Query:  DSLESEVFESLI
        D LE + + +LI
Subjt:  DSLESEVFESLI

Q93WC5 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g01990, mitochondrial1.8e-7939.69Show/hide
Query:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKA
        LN+F+     V K ++    K LR  +    AL++ E M ++ +  T SD AI L+L+AK++G+ AAE YF SL +S KN  +Y SLLNCYC E    KA
Subjt:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKA

Query:  ESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKG--DWTTYSNLASIYVN
        ++ FE M +LN    S+P N LM +Y  +GQP+KVP+++  MK  ++T    TY +W+++  +L D+ GVE+V+DEMK +G +G   W T++NLA+IY+ 
Subjt:  ESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKG--DWTTYSNLASIYVN

Query:  ANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALI
          ++ KA +AL  LE          + FLI LY  I +  +VY VW  L+  +P   N SYL M++ L KL D+ G +K F EWES C TYD+R+AN  I
Subjt:  ANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALI

Query:  GAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVD
         +Y K+ + E+A A+   A+K+     +K  ++ + + LKN    LA      AV         W  S E+I SF  HFE+ KDVDGAE F + + K   
Subjt:  GAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVD

Query:  SLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI
         L SE +  L++TY AAG+    M +RL+ + + V E  + LL++I
Subjt:  SLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI

Q9FZ24 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g02370, mitochondrial6.8e-8740.04Show/hide
Query:  EEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSK
        +  LY +L     +  +V   LN+FI     V K ++    K LR  +    A ++ + M KR M  +VSD AI LDL+ K +G+ AAENYF +L  S+K
Subjt:  EEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSK

Query:  NHLS-YSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMK
        NH S Y +L+NCYC EL  EKA++ FE M ELN    S+P N +M++Y ++ QP+KVP ++  MK   ++    TY +WM++  +LND+ G+E++IDEM 
Subjt:  NHLS-YSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMK

Query:  RDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEK
        +D   K  W T+SNLA+IY  A ++EKA  AL  +E+     +  +  FL++LY  I    +VY VW SL+ A P   N+SYL M+Q + KL DL G +K
Subjt:  RDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEK

Query:  CFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHF
         F EWES C  YD+R+AN  I  Y K  + E+A  + + A+K+   P +K  ++ + + L+N    LA   +  AVS    +  +W  S E++  F  HF
Subjt:  CFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHF

Query:  EQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI
        E+ KDVDGAE F +I+      L+SE    LI+TY+AA +TS  M  RL  + +EVSE  + LL  +
Subjt:  EQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI

Q9SY07 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02820, mitochondrial7.8e-6731.78Show/hide
Query:  SEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETM-AKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCY
        +++S  + + K+ +    V K+E+   +++LR  K Y  AL++ E M  +  +     D A+HLDL++K RG+ +AE +F  +P+  + H + +SLL+ Y
Subjt:  SEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETM-AKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCY

Query:  CKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKGDWTTYSN
         +  L++KAE+LFEKM E     + +P N ++++Y   GQ +KVP +I+E+K    + D  TY +W+ A A+ ND+ G E+V  + K + +  DW TYS 
Subjt:  CKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKGDWTTYSN

Query:  LASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDI
        L ++Y   +  EKA  AL ++EK+ + ++  A+  LI+L+  +GD   V   W+ ++ +F +  +  YL+MI  ++KL +   A+  + EWES   T D 
Subjt:  LASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDI

Query:  RIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLE
        RI N ++  Y     +       ER +++G  P+  TWEI    YLK  + +   DC  KA+   K    KW  +  ++K      E++ +V GAE  + 
Subjt:  RIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLE

Query:  IVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLL
        +++K    + ++++ SL+RTY+ AG  +  +  R+  +NVE+ E  K+L+
Subjt:  IVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02150.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein6.8e-6633.98Show/hide
Query:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRG--MNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTE
        LN++ K+ +++ KWE+   +K+LR  K    AL++ + M  RG     + SD AI LDL+ K RGI  AE +F+ LPE+ K+   Y SLLN Y +    E
Subjt:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRG--MNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTE

Query:  KAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRD-GVKGDWTTYSNLASIYV
        KAE+L   M++    L  +P N +MTLY  + + DKV +++ EMK  ++  D Y+Y +W+ +  +L  +  +E V  +MK D  +  +WTT+S +A++Y+
Subjt:  KAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRD-GVKGDWTTYSNLASIYV

Query:  NANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANAL
             EKA  AL  +E   T R+   + +L++LYG +G+  ++Y VW   +   P   N+ Y  ++ +L+++ D+ GAEK ++EW    S+YD RI N L
Subjt:  NANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANAL

Query:  IGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTV
        + AY K   LE A  L +  ++ G +P++ TWEI    + +      A  C+  A S        W P   ++  F    E+E DV   E+ LE+++++ 
Subjt:  IGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTV

Query:  DSLESEVFESLI
        D LE + + +LI
Subjt:  DSLESEVFESLI

AT1G02370.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.8e-8840.04Show/hide
Query:  EEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSK
        +  LY +L     +  +V   LN+FI     V K ++    K LR  +    A ++ + M KR M  +VSD AI LDL+ K +G+ AAENYF +L  S+K
Subjt:  EEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSK

Query:  NHLS-YSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMK
        NH S Y +L+NCYC EL  EKA++ FE M ELN    S+P N +M++Y ++ QP+KVP ++  MK   ++    TY +WM++  +LND+ G+E++IDEM 
Subjt:  NHLS-YSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMK

Query:  RDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEK
        +D   K  W T+SNLA+IY  A ++EKA  AL  +E+     +  +  FL++LY  I    +VY VW SL+ A P   N+SYL M+Q + KL DL G +K
Subjt:  RDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEK

Query:  CFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHF
         F EWES C  YD+R+AN  I  Y K  + E+A  + + A+K+   P +K  ++ + + L+N    LA   +  AVS    +  +W  S E++  F  HF
Subjt:  CFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHF

Query:  EQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI
        E+ KDVDGAE F +I+      L+SE    LI+TY+AA +TS  M  RL  + +EVSE  + LL  +
Subjt:  EQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI

AT1G60770.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.2e-19067.62Show/hide
Query:  LPLRKFKPSKDLAKRSTEKYLEEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLV
        + +R    S+D+ KRST+KY+EE LY RLFKDGG+E  VR QLN+F+K  K VFKWEVGDT+KKLR+R LYYPALKLSE M +RGMNKTVSDQAIHLDLV
Subjt:  LPLRKFKPSKDLAKRSTEKYLEEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLV

Query:  AKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWM
        AKAR I A ENYFV LPE+SK  L+Y SLLNCYCKELLTEKAE L  KMKELN+  +SM  N LMTLYTK G+ +KVP++IQE+KA NV  DSYTY VWM
Subjt:  AKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWM

Query:  RALAALNDISGVERVIDEMKRDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANI
        RALAA NDISGVERVI+EM RDG V  DWTTYSN+ASIYV+A + +KA KAL +LE  NT RD  A+QFLITLYG++G L +VY +WRSLRLA P+T+N+
Subjt:  RALAALNDISGVERVIDEMKRDG-VKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANI

Query:  SYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGK
        +YLNMIQ L+KL DLPGAE  FKEW++ CSTYDIRI N LIGAY +EGL++KA  LKE+A +RG + NAKTWEIF+DYY+K+G+   A +C++KAVS GK
Subjt:  SYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGK

Query:  GDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEIS
        GDGGKW+PSPE +++ MS+FEQ+KDV+GAE+ LEI+K   D++ +E+FE LIRTY+AAG++  +M RRLKMENVEV+EA KKLL+E+S
Subjt:  GDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEIS

AT4G01990.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.3e-8039.69Show/hide
Query:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKA
        LN+F+     V K ++    K LR  +    AL++ E M ++ +  T SD AI L+L+AK++G+ AAE YF SL +S KN  +Y SLLNCYC E    KA
Subjt:  LNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKA

Query:  ESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKG--DWTTYSNLASIYVN
        ++ FE M +LN    S+P N LM +Y  +GQP+KVP+++  MK  ++T    TY +W+++  +L D+ GVE+V+DEMK +G +G   W T++NLA+IY+ 
Subjt:  ESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKG--DWTTYSNLASIYVN

Query:  ANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALI
          ++ KA +AL  LE          + FLI LY  I +  +VY VW  L+  +P   N SYL M++ L KL D+ G +K F EWES C TYD+R+AN  I
Subjt:  ANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDIRIANALI

Query:  GAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVD
         +Y K+ + E+A A+   A+K+     +K  ++ + + LKN    LA      AV         W  S E+I SF  HFE+ KDVDGAE F + + K   
Subjt:  GAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLEIVKKTVD

Query:  SLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEI
         L SE +  L++TY AAG+    M +RL+ + + V E  + LL++I
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AT4G02820.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein5.6e-6831.78Show/hide
Query:  SEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETM-AKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCY
        +++S  + + K+ +    V K+E+   +++LR  K Y  AL++ E M  +  +     D A+HLDL++K RG+ +AE +F  +P+  + H + +SLL+ Y
Subjt:  SEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETM-AKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAAAENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCY

Query:  CKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKGDWTTYSN
         +  L++KAE+LFEKM E     + +P N ++++Y   GQ +KVP +I+E+K    + D  TY +W+ A A+ ND+ G E+V  + K + +  DW TYS 
Subjt:  CKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDEMKRDGVKGDWTTYSN

Query:  LASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDI
        L ++Y   +  EKA  AL ++EK+ + ++  A+  LI+L+  +GD   V   W+ ++ +F +  +  YL+MI  ++KL +   A+  + EWES   T D 
Subjt:  LASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGCSTYDI

Query:  RIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLE
        RI N ++  Y     +       ER +++G  P+  TWEI    YLK  + +   DC  KA+   K    KW  +  ++K      E++ +V GAE  + 
Subjt:  RIANALIGAYTKEGLLEKAMALKERALKRGARPNAKTWEIFLDYYLKNGNFKLAGDCVAKAVSRGKGDGGKWMPSPEIIKSFMSHFEQEKDVDGAESFLE

Query:  IVKKTVDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLL
        +++K    + ++++ SL+RTY+ AG  +  +  R+  +NVE+ E  K+L+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTGCCGTTACGGAAGTTCAAACCCAGCAAGGATTTGGCGAAGAGGTCGACGGAGAAGTATCTGGAAGAAGCACTGTACATCAGGCTTTTTAAAGATGGTGGCTC
AGAGAAGAGCGTCCGGCTGCAGTTGAATAAGTTCATCAAGAGTCGCAAGCGAGTTTTCAAATGGGAAGTTGGAGATACACTCAAAAAGCTTCGTGATAGGAAGCTGTACT
ATCCTGCTCTCAAGCTTTCAGAAACAATGGCCAAAAGGGGCATGAACAAGACAGTAAGTGATCAAGCAATACATCTTGATTTAGTAGCCAAGGCTCGAGGAATTGCTGCT
GCTGAGAATTACTTTGTCAGTCTTCCTGAATCATCAAAAAATCATCTTTCCTATTCCTCTCTTCTCAACTGTTACTGCAAGGAATTATTGACTGAAAAGGCTGAATCTCT
CTTCGAAAAGATGAAGGAACTCAATCTACCGCTGACCTCTATGCCATGTAATTGCCTTATGACCCTATACACGAAGATTGGGCAGCCGGATAAAGTTCCTTCAATCATAC
AGGAAATGAAGGCTGCCAATGTAACGTTTGATTCCTATACATACGTAGTGTGGATGAGGGCACTTGCTGCTTTAAATGATATTTCTGGTGTGGAACGGGTTATTGATGAG
ATGAAGAGGGATGGAGTTAAGGGAGATTGGACAACATATAGCAATTTAGCCTCAATTTATGTTAATGCAAACATGTTCGAGAAGGCAGCTAAGGCGCTGATGGACTTGGA
GAAGATAAATACTTCCCGAGATCTCTTTGCTTTCCAGTTCCTCATTACGTTGTATGGACAAATTGGTGACCTGATTAAAGTTTATAGCGTTTGGCGCTCATTAAGGTTGG
CCTTTCCAAGAACTGCAAATATAAGCTATCTCAATATGATTCAAACACTGTTGAAATTGAAAGATTTACCTGGTGCGGAGAAATGTTTCAAGGAATGGGAATCGGGGTGC
TCAACTTACGATATTAGGATTGCAAATGCTCTTATAGGAGCTTATACCAAGGAGGGTTTACTAGAGAAAGCTATGGCGCTCAAGGAACGAGCCCTAAAAAGAGGAGCTAG
ACCTAATGCGAAAACTTGGGAAATTTTTCTGGACTATTATCTTAAAAATGGCAACTTTAAACTGGCAGGTGATTGTGTTGCCAAAGCAGTATCTAGAGGTAAAGGAGATG
GTGGGAAATGGATGCCTTCTCCTGAGATCATTAAATCATTCATGAGCCATTTCGAGCAAGAAAAAGATGTTGATGGAGCAGAGAGTTTTCTTGAAATCGTGAAGAAGACA
GTTGACAGTTTAGAGTCCGAAGTTTTTGAATCATTGATTAGAACATACTCTGCAGCAGGAAGGACAAGTTCCTCGATGAATCGCCGGTTGAAAATGGAGAATGTGGAGGT
CAGTGAGGCTTGCAAGAAGTTACTTAACGAAATATCTATTGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTAGACTCTGGATCAGTCCTAAAACCATTTCTGCTCTGCCACCACTGTGAGAAGTGCCGGAAAATGGCGTTGCCGTTACGGAAGTTCAAACCCAGCAAGGATTTGGCGA
AGAGGTCGACGGAGAAGTATCTGGAAGAAGCACTGTACATCAGGCTTTTTAAAGATGGTGGCTCAGAGAAGAGCGTCCGGCTGCAGTTGAATAAGTTCATCAAGAGTCGC
AAGCGAGTTTTCAAATGGGAAGTTGGAGATACACTCAAAAAGCTTCGTGATAGGAAGCTGTACTATCCTGCTCTCAAGCTTTCAGAAACAATGGCCAAAAGGGGCATGAA
CAAGACAGTAAGTGATCAAGCAATACATCTTGATTTAGTAGCCAAGGCTCGAGGAATTGCTGCTGCTGAGAATTACTTTGTCAGTCTTCCTGAATCATCAAAAAATCATC
TTTCCTATTCCTCTCTTCTCAACTGTTACTGCAAGGAATTATTGACTGAAAAGGCTGAATCTCTCTTCGAAAAGATGAAGGAACTCAATCTACCGCTGACCTCTATGCCA
TGTAATTGCCTTATGACCCTATACACGAAGATTGGGCAGCCGGATAAAGTTCCTTCAATCATACAGGAAATGAAGGCTGCCAATGTAACGTTTGATTCCTATACATACGT
AGTGTGGATGAGGGCACTTGCTGCTTTAAATGATATTTCTGGTGTGGAACGGGTTATTGATGAGATGAAGAGGGATGGAGTTAAGGGAGATTGGACAACATATAGCAATT
TAGCCTCAATTTATGTTAATGCAAACATGTTCGAGAAGGCAGCTAAGGCGCTGATGGACTTGGAGAAGATAAATACTTCCCGAGATCTCTTTGCTTTCCAGTTCCTCATT
ACGTTGTATGGACAAATTGGTGACCTGATTAAAGTTTATAGCGTTTGGCGCTCATTAAGGTTGGCCTTTCCAAGAACTGCAAATATAAGCTATCTCAATATGATTCAAAC
ACTGTTGAAATTGAAAGATTTACCTGGTGCGGAGAAATGTTTCAAGGAATGGGAATCGGGGTGCTCAACTTACGATATTAGGATTGCAAATGCTCTTATAGGAGCTTATA
CCAAGGAGGGTTTACTAGAGAAAGCTATGGCGCTCAAGGAACGAGCCCTAAAAAGAGGAGCTAGACCTAATGCGAAAACTTGGGAAATTTTTCTGGACTATTATCTTAAA
AATGGCAACTTTAAACTGGCAGGTGATTGTGTTGCCAAAGCAGTATCTAGAGGTAAAGGAGATGGTGGGAAATGGATGCCTTCTCCTGAGATCATTAAATCATTCATGAG
CCATTTCGAGCAAGAAAAAGATGTTGATGGAGCAGAGAGTTTTCTTGAAATCGTGAAGAAGACAGTTGACAGTTTAGAGTCCGAAGTTTTTGAATCATTGATTAGAACAT
ACTCTGCAGCAGGAAGGACAAGTTCCTCGATGAATCGCCGGTTGAAAATGGAGAATGTGGAGGTCAGTGAGGCTTGCAAGAAGTTACTTAACGAAATATCTATTGAATGA
GCTTTTGTTGTATCACTTTTCTTTTGAAATTCCAAGCTCAGGGGGGAAATGATTTTTTTCAATGGTTATTTAATTTTAAATAAAGTCACTTTTCCTTCTGTCCTTGTCAA
ATACTCACAACAGCACCACCTCTTGTTGGTTGCTGAAAAATGAAGTTCATATGCAAATTGTATTGAACTTCTTTCCCATTTACATCTTTTCGGTTGGTAGTTGCCAAGCT
CCTGTACTTCATATACTTTTCTTTCAGTAAGTAGACTAGTTAACACTTACCTTATTGTTCGTCTTCAGAGGTGTCGTTGTAGTTTTGAATTCAGTCCGTAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALPLRKFKPSKDLAKRSTEKYLEEALYIRLFKDGGSEKSVRLQLNKFIKSRKRVFKWEVGDTLKKLRDRKLYYPALKLSETMAKRGMNKTVSDQAIHLDLVAKARGIAA
AENYFVSLPESSKNHLSYSSLLNCYCKELLTEKAESLFEKMKELNLPLTSMPCNCLMTLYTKIGQPDKVPSIIQEMKAANVTFDSYTYVVWMRALAALNDISGVERVIDE
MKRDGVKGDWTTYSNLASIYVNANMFEKAAKALMDLEKINTSRDLFAFQFLITLYGQIGDLIKVYSVWRSLRLAFPRTANISYLNMIQTLLKLKDLPGAEKCFKEWESGC
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VDSLESEVFESLIRTYSAAGRTSSSMNRRLKMENVEVSEACKKLLNEISIE