; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0004012 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0004012
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSte24 endopeptidase
Genome locationchr06:13986438..13992133
RNA-Seq ExpressionIVF0004012
SyntenyIVF0004012
Gene Ontology termsGO:0071586 - CAAX-box protein processing (biological process)
GO:1900055 - regulation of leaf senescence (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
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GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001915 - Peptidase M48
IPR027057 - CAAX prenyl protease 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042910.1 protease HtpX isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]1.89e-234100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8A1 Ste24 endopeptidase1.1e-17695.81Show/hide
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A0A1S3BNJ0 Ste24 endopeptidase4.7e-18399.1Show/hide
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A0A5D3C2A3 Ste24 endopeptidase3.2e-184100Show/hide
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A0A6J1EJZ9 Ste24 endopeptidase2.9e-16188.89Show/hide
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A0A6J1JKT7 Ste24 endopeptidase5.9e-16289.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B3QED3 Protease HtpX homolog5.6e-0830.56Show/hide
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         F   N E
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Q2RKK7 Protease HtpX homolog2.8e-0736.08Show/hide
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        VS  +  +LH L+   A + ++  P + +   P+PNA+    +     V V TGL+E LT  EL+AVL HEL H+K      LT A+   TV ++ V
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Q3SW84 Protease HtpX homolog5.6e-0832.32Show/hide
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Q8PSE5 Protease HtpX homolog 27.8e-1028.33Show/hide
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Q8TP15 Protease HtpX homolog 26.4e-1231.67Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27110.1 Peptidase family M48 family protein2.0e-13370.88Show/hide
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AT3G27110.2 Peptidase family M48 family protein2.0e-13370.88Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTGTTTCTGAAAATCAGCTTTCAGATCTTCATAAACTTATGATTGAGGCTGCCAAAGTACTGAATGTTGAGGCTCCAGATCTATATGTCCGTCAAAATCCTGTGCCAAA
TGCTTACACTTTAGCCATAAGTGGTAAAAAGCCGTTTGTTGTTGTTCATACCGGCCTTGTGGAGCTTCTTACAGAAAAAGAATTGCAGGCTGTTTTGGCTCATGAATTGG
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CTCTCTGCTTCCATGGCTTCAATTCCCTTTTCTTCTCTCTGCCTCACCACAAATCCTGTTCCTCGCGGAATCGGATCTTCATCCTCCTACAGATTCAGTTCCACTACCTT
TGGAAACGGATTCGGAATCCAGTCGTCGGTCACTAAGAGAATTAAGTCCTCCGTTTGCGTAGCTGCCTCCCTCGCCTTTCGCGACCTTGATGCCGACGATTTCCGCCATC
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GGAACATCAATTCTTGTTTCTGAAAATCAGCTTTCAGATCTTCATAAACTTATGATTGAGGCTGCCAAAGTACTGAATGTTGAGGCTCCAGATCTATATGTCCGTCAAAA
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AACTTAGAAGAACAGTTATTCCGTTGGCTTCGAGCCGCAGAGCTTACTTGCGATCGTGCTGCCCTTCTTGTTGCACAGGATTCTAAAGTGGTCATCTCTGTTCTGATGAA
ACTAGCTGGGGGCTGTCCATCTATAGCTGATCAACTGAATGTGGATGCCTTTTTGGAGCAAGCTCGCTCTTATGACAGAGCTTCTTCAAGCCCTATAGGATGGTATATAA
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ACAATTACTGTGGTTCTTATTTTATCTCCACAAATAAATAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VEAA