; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0004268 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0004268
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRAB6-interacting golgin
Genome locationchr08:7673024..7675139
RNA-Seq ExpressionIVF0004268
SyntenyIVF0004268
Gene Ontology termsGO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
InterPro domainsIPR007033 - RAB6-interacting golgin


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025281.1 putative DNA double-strand break repair Rad50 ATPase isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]1.36e-9496.36Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLG      EKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

XP_004143305.1 uncharacterized protein LOC101209289 [Cucumis sativus]5.22e-9896.97Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQ+DQNPPQQLQ MLENS NLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTEL+NKLQ+RLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

XP_008462544.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103500877 [Cucumis melo]8.06e-102100Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

XP_023543803.1 uncharacterized protein LOC111803564 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.43e-8283.64Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQ +QNP QQLQ ML+NSGNLSFSSKED+EMSKSAL+AFREKEEEI+RMRTEL  KLQ RLGRV+EESRRL+S+REELE I GDP RKEIGQIRK+ID L
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLG  CQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQ ISKLMEMVGESE++RLKRLEELSKHVDN +
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

XP_038882826.1 uncharacterized protein LOC120073968 isoform X1 [Benincasa hispida]5.18e-9190.91Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQ+DQNP QQLQ ML+NS +LSFSSKEDD+MSKSALAAFREKEEEIDRMR +LHNKLQVRLGRVQEESRRL+S+REEL+AI GDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLG+TCQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KHE9 RAB6-interacting golgin1.4e-7696.97Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQ+DQNPPQQLQ MLENS NLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTEL+NKLQ+RLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

A0A1S3CIS0 RAB6-interacting golgin1.8e-79100Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

A0A5A7SM04 RAB6-interacting golgin6.7e-7496.36Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLG      EKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

A0A6J1EJF7 RAB6-interacting golgin1.8e-6383.03Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQ +QN PQQLQ ML+NSGNLSFSSKED+EMSKSAL+AFREKEEEI+RMRTEL  KLQ RLGRV+EESRRL+S+REELE I GDP RKEIGQIRK+ID L
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        NKELKPLG  CQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKV  ISKLMEMVGESE++RLKRLEELSKHVDN +
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS

A0A6J1IS07 RAB6-interacting golgin3.7e-6484.66Show/hide
Query:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL
        MQ +QN PQQLQ ML+NSGNLSFSSKED+EMSKSAL+AFREKEEEI+RMRTEL  KLQ RLGRV+EESRRL+S+REELE I GDP RKEIGQIRK+ID L
Subjt:  MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDAL

Query:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDN
        NKELKPLG  CQKKEKEYKDALD+FNEKNNEKVQ ISKLMEMVGESE++RLKRLEELSKHVDN
Subjt:  NKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36410.1 Family of unknown function (DUF662)1.7e-4560.48Show/hide
Query:  QTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKID
        Q    P QQ   M+ ++G+LSFS   S+ED+EM++SAL+AFR KE+EI++ R E+  ++Q +LGRV++E++RLS++REELE++  DPMRKE+  +RKKID
Subjt:  QTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKID

Query:  ALNKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEM---VGESEKLRLKRLEELSKHVD
        ++NKELKPLG T QKKE+EYK+ALD+FNEKN EKVQLI+KLMEM   VGESEKLR+ +LEELSK ++
Subjt:  ALNKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEM---VGESEKLRLKRLEELSKHVD

AT2G36410.2 Family of unknown function (DUF662)9.0e-4760.98Show/hide
Query:  QTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKID
        Q    P QQ   M+ ++G+LSFS   S+ED+EM++SAL+AFR KE+EI++ R E+  ++Q +LGRV++E++RLS++REELE++  DPMRKE+  +RKKID
Subjt:  QTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKID

Query:  ALNKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVD
        ++NKELKPLG T QKKE+EYK+ALD+FNEKN EKVQLI+KLME+VGESEKLR+ +LEELSK ++
Subjt:  ALNKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVD

AT2G36410.3 Family of unknown function (DUF662)1.3e-4560.37Show/hide
Query:  QTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKID
        Q    P QQ   M+ ++G+LSFS   S+ED+EM++SAL+AFR KE+EI++ R E+  ++Q +LGRV++E++RLS++REELE++  DPMRKE+  +RKKID
Subjt:  QTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKID

Query:  ALNKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVD
        ++NKELKPLG T QKK  EYK+ALD+FNEKN EKVQLI+KLME+VGESEKLR+ +LEELSK ++
Subjt:  ALNKELKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVD

AT3G09980.1 Family of unknown function (DUF662)3.4e-4663.76Show/hide
Query:  SGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDALNKELKPLGVTCQKK
        SG++SFS   SKED+EMS++AL+AFR KEEEI++ + E+  ++Q +LGRV+EE++RL+ +REELE +  DPMRKE+  +RKKID++NKELKPLG T QKK
Subjt:  SGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDALNKELKPLGVTCQKK

Query:  EKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDN
        E+EYK+AL++FNEKN EKVQLI++LME+VGESEK+R+K+LEELSK++D+
Subjt:  EKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDN

AT3G52920.2 Family of unknown function (DUF662)2.6e-4662.35Show/hide
Query:  PPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDALNKE
        PPQQ+        +LSFS   SKED+EM++SAL+AFR KE+EI++ + E+  +++ +LGRV+EE+RRL+S+REELE +  DPMRKE+  +RKKID++NKE
Subjt:  PPQQLQTMLENSGNLSFS---SKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDALNKE

Query:  LKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS
        LKPLG T QKKE+EYK+ALD+FNEKN EKVQLI+KLME+VGESEKLRLK+L+ELS+ +D  S
Subjt:  LKPLGVTCQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGACCGACCAGAATCCACCGCAGCAACTTCAAACAATGTTAGAGAATTCTGGAAATTTGAGTTTCAGTAGTAAAGAAGACGATGAGATGTCCAAATCGGCGCTTGC
TGCTTTTAGGGAAAAGGAAGAAGAGATCGATCGCATGAGGACTGAGCTTCACAACAAACTTCAAGTTCGTCTCGGCCGTGTTCAGGAAGAATCCAGGCGTTTGTCTTCAC
TTCGAGAGGAACTTGAAGCCATAGGAGGAGATCCAATGAGGAAGGAAATTGGACAAATTCGTAAGAAAATTGATGCCCTAAACAAGGAATTGAAGCCTCTTGGAGTAACG
TGCCAAAAGAAGGAGAAAGAGTACAAAGATGCCCTTGATTCTTTTAATGAAAAGAACAACGAAAAAGTACAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTGGTGAAAGTGA
AAAGCTGAGGCTAAAGAGGTTGGAAGAATTGAGTAAGCATGTGGATAACACTTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGAAGACAATTGTTTTAGTATTAGAAGTTAAAATAATTTTTTGCAATTTGGGTTTTATTATTAAAATGAAAAATAGAAAAGTAGAGGGATTAAAATGAGAGGGAGAAAA
TGATATTTTAACCCAATAGAAAAAGAAAGCTAACAGAGCAATAGCCTAAGAAAGAAAAAGGCAGAGGAAAGGAAATAGCGATTCCTTCATTCATTCATAGAAACACAAAC
TAAAGGGGGCGTTGGTTTCAAGAAAAATCAAGATCAAGGACCAAAGGGAAAGATGCAGACCGACCAGAATCCACCGCAGCAACTTCAAACAATGTTAGAGAATTCTGGAA
ATTTGAGTTTCAGTAGTAAAGAAGACGATGAGATGTCCAAATCGGCGCTTGCTGCTTTTAGGGAAAAGGAAGAAGAGATCGATCGCATGAGGACTGAGCTTCACAACAAA
CTTCAAGTTCGTCTCGGCCGTGTTCAGGAAGAATCCAGGCGTTTGTCTTCACTTCGAGAGGAACTTGAAGCCATAGGAGGAGATCCAATGAGGAAGGAAATTGGACAAAT
TCGTAAGAAAATTGATGCCCTAAACAAGGAATTGAAGCCTCTTGGAGTAACGTGCCAAAAGAAGGAGAAAGAGTACAAAGATGCCCTTGATTCTTTTAATGAAAAGAACA
ACGAAAAAGTACAGTTAATATCAAAACTAATGGAGATGGTTGGTGAAAGTGAAAAGCTGAGGCTAAAGAGGTTGGAAGAATTGAGTAAGCATGTGGATAACACTTCCTAA
TTCAATTACTAAATTCAATCAATGAATCAGTTTCTATTAGTTTCCTTTGGGGTTTTTATGTTGTTTTCTTTTTTCTTAAAAATGTTTGTATTGGGTGTTTGAAATTTAAC
CAGGGTCTGTCATATGTTTTTTTATTTCATTTTGGTTTAAATTTACTTTCACTAAACATTCTTATTTTAGGATCATATTTATATATGTGTATGTAGTGCTCTTAACCTTA
CAAATATATCTTGTATCTAAACTTTTCACAATTAGAAGTCTATTACTTAGAAGCTCATCTCTAATTAACTTATATTGCTGATAGAATTGAACTTTATTATTGATATTTAT
GATCAATCATAAACTTGTATTATTGTTAGAACTATATTTGTATTGAAGTCTATCCATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQTDQNPPQQLQTMLENSGNLSFSSKEDDEMSKSALAAFREKEEEIDRMRTELHNKLQVRLGRVQEESRRLSSLREELEAIGGDPMRKEIGQIRKKIDALNKELKPLGVT
CQKKEKEYKDALDSFNEKNNEKVQLISKLMEMVGESEKLRLKRLEELSKHVDNTS