; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0004587 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0004587
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPatatin
Genome locationchr12:22180997..22181380
RNA-Seq ExpressionIVF0004587
SyntenyIVF0004587
Gene Ontology termsGO:0000162 - tryptophan biosynthetic process (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056869.1 hypothetical protein E6C27_scaffold96G00380 [Cucumis melo var. makuwa]1.56e-7399.12Show/hide
Query:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD
        MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD
Subjt:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD

Query:  ASRSNRMNKISGL
        ASRSNRMNKISG+
Subjt:  ASRSNRMNKISGL

KAG7019678.1 hypothetical protein SDJN02_18641, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.04e-5773.85Show/hide
Query:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELE--TSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCST
        MQHNKP+ TF KSH  MAATA VAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELE  +S SSQR Q P+MA+SGC S PPTFW S+MSWRRKKK + +RF+ K+CS+
Subjt:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELE--TSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCST

Query:  -FDASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLHV
         FD S SN+MNKISG +YTILQN+FHSLH+
Subjt:  -FDASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLHV

KGN64543.2 hypothetical protein Csa_013063 [Cucumis sativus]3.25e-6894.59Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAA APVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHV
        ILQNDFHSLH+
Subjt:  ILQNDFHSLHV

XP_011648422.1 uncharacterized protein LOC105434455 [Cucumis sativus]1.64e-6894.59Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAA APVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHV
        ILQNDFHSLH+
Subjt:  ILQNDFHSLHV

XP_016898893.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485409 [Cucumis melo]2.08e-71100Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHV
        ILQNDFHSLHV
Subjt:  ILQNDFHSLHV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LX43 Uncharacterized protein4.5e-6294.49Show/hide
Query:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD
        MQHNKP NTFYKSHYGMAA APVAIGTRGTIGSL+KKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQS+MSWRRK KLTSNRF+TKMCSTFD
Subjt:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD

Query:  ASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLHV
        ASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLH+
Subjt:  ASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLHV

A0A1S4DSE9 uncharacterized protein LOC1034854095.9e-54100Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
        MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISGLSYT

Query:  ILQNDFHSLHV
        ILQNDFHSLHV
Subjt:  ILQNDFHSLHV

A0A314Z3X1 Uncharacterized protein1.0e-2149.57Show/hide
Query:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELET---SISSQRSQGP--EMASSGC-RSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKI
        MAA AP+AIGTRGT+GSL++KEI+YF+K+EL+    S SS++ QG   +M SS C  SS P+FW  IM+W+RKK+ +S RF++ +CS    + +NR+N I
Subjt:  MAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELET---SISSQRSQGP--EMASSGC-RSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKI

Query:  SGLSYTILQNDFHSLHV
         G +Y IL++D ++L +
Subjt:  SGLSYTILQNDFHSLHV

A0A5A7UTL1 Uncharacterized protein3.7e-5699.12Show/hide
Query:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD
        MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD
Subjt:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFD

Query:  ASRSNRMNKISGL
        ASRSNRMNKISG+
Subjt:  ASRSNRMNKISGL

A0A6J1CHB1 uncharacterized protein LOC1110108625.4e-3969.53Show/hide
Query:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCR-SSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTF
        MQH+KP+ TF K    MAATAPVAIGTRGT+GSL+KKEIDYFAKIE E      R  G +MASS  R SSPPTFW ++MSWRRKKK   NRFITK+CS F
Subjt:  MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCR-SSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTF

Query:  DASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLHV
        D S SNR+NKISG +YTILQNDF+SLH+
Subjt:  DASRSNRMNKISGLSYTILQNDFHSLHV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G21780.1 unknown protein1.8e-1038.53Show/hide
Query:  APVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIE-LETSISSQRSQGPEMASS----GCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLT---SNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISG
        AP+AIGTRGTIGSL++KEIDYF            +R    E  ++       SS    W S   WR+KK+ T     +F   MCS  + S  NR   + G
Subjt:  APVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIE-LETSISSQRSQGPEMASS----GCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLT---SNRFITKMCSTFDASRSNRMNKISG

Query:  LSYTILQND
         +Y IL++D
Subjt:  LSYTILQND


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAACATAATAAACCCAACAACACATTCTACAAATCCCATTACGGAATGGCTGCAACTGCTCCTGTTGCCATTGGAACTCGAGGAACCATTGGTTCGCTCATAAAGAA
GGAAATCGATTATTTTGCCAAGATTGAGCTTGAAACCTCCATCAGCTCACAGAGGTCTCAAGGACCTGAAATGGCTTCTTCTGGCTGTAGAAGTTCACCACCCACCTTCT
GGCAATCTATAATGTCATGGCGAAGGAAGAAGAAGCTAACCAGCAATCGCTTCATTACAAAAATGTGCTCGACTTTTGATGCTTCGAGAAGCAATCGCATGAATAAGATT
TCTGGGTTGAGTTATACGATCCTTCAGAATGATTTCCATAGCTTGCACGTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAACATAATAAACCCAACAACACATTCTACAAATCCCATTACGGAATGGCTGCAACTGCTCCTGTTGCCATTGGAACTCGAGGAACCATTGGTTCGCTCATAAAGAA
GGAAATCGATTATTTTGCCAAGATTGAGCTTGAAACCTCCATCAGCTCACAGAGGTCTCAAGGACCTGAAATGGCTTCTTCTGGCTGTAGAAGTTCACCACCCACCTTCT
GGCAATCTATAATGTCATGGCGAAGGAAGAAGAAGCTAACCAGCAATCGCTTCATTACAAAAATGTGCTCGACTTTTGATGCTTCGAGAAGCAATCGCATGAATAAGATT
TCTGGGTTGAGTTATACGATCCTTCAGAATGATTTCCATAGCTTGCACGTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQHNKPNNTFYKSHYGMAATAPVAIGTRGTIGSLIKKEIDYFAKIELETSISSQRSQGPEMASSGCRSSPPTFWQSIMSWRRKKKLTSNRFITKMCSTFDASRSNRMNKI
SGLSYTILQNDFHSLHV