; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0004827 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0004827
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationtig00002755:47578..47997
RNA-Seq ExpressionIVF0004827
SyntenyIVF0004827
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U4I8 Retrotransposon protein6.1e-2866.33Show/hide
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A0A5A7U7C8 Retrotransposon protein1.9e-2979.07Show/hide
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A0A5A7U9D5 Retrotransposon protein6.8e-2770.33Show/hide
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A0A5A7VGC2 Retrotransposon protein2.1e-60100Show/hide
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A0A5D3BQI7 Retrotransposon protein2.7e-3178.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACGATATGGAGTTCTCATCCATGTACAGCTAGGGGATTGACATGTCCCAGAAGGATTTACGCGCATCACAACCTTCTCGCGCGTCAGATGGTAGGCCTGGATCG
AGCGGCTCTAGAGAAAGAGGAGAAGCTAGCGGGAGGTGAGCTTGAGGTGATACATATGGCCCTAGAGTGTATGAATGACCAACTCAGAACCATTGTCAAGTGGCCTACAC
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CATATGGACGACATGCGCGATTTCGTAGAGATGACTGGCGAAGAGAGGAAGGGCTTTCGTAGAGTCCTCCTACGAGACGTCTCAAGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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