CuGenDBv2

Gene ID	IVF0005003
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Tubulin beta chain
Genome location	chr04:31546484..31548820
RNA-Seq Expression	IVF0005003
Synteny	IVF0005003
Gene Ontology terms	GO:0000278 - mitotic cell cycle (biological process) GO:0000226 - microtubule cytoskeleton organization (biological process) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0005874 - microtubule (cellular component) GO:0005525 - GTP binding (molecular function) GO:0005200 - structural constituent of cytoskeleton (molecular function) GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR037103 - Tubulin/FtsZ-like, C-terminal domain IPR036525 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain superfamily IPR023123 - Tubulin, C-terminal IPR018316 - Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain IPR017975 - Tubulin, conserved site IPR013838 - Beta tubulin, autoregulation binding site IPR008280 - Tubulin/FtsZ, C-terminal IPR003008 - Tubulin/FtsZ, GTPase domain IPR002453 - Beta tubulin IPR000217 - Tubulin

Homology

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AT5G23860.2 tubulin beta 8

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AT5G62700.1 tubulin beta chain 3

7.9e-255

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Sequences

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CDS sequence

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ATGAGATGGAGTTCACTGAGGCTGAAAGCAATATGAATGATTTGGTTTCTGAGTATCAGCAGTATCAAGACGCTACGGCTGAAGATGATGAATACTACGATGAAGATGAT
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mRNA sequence

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CTTTTTTTCTGTTTTCTCTCTCGTTTTCAGTTTCGATTTCAATTTCACTTCCCATTTCTTGTAAAGATGCGTGAGATTCTTCACATCCAAGGTGGACAATGTGGCAACCA
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ATGAAGCCAGTTGCGGTCGATTTGTTCCTCGTGCTGTGCTTATGGATCTTGAGCCTGGTGTTATGGACAGTATCAGATCTGGACCTTACGGTCAGGTTTTCAGACCTGAT
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CGATATCTTACTGCCTCTGCTATGTTTAGGGGTAAGATGAGCACCAAGGAAGTTGATGAACAGATGATCAATGTTCAAAACAAGAACTCTTCATACTTTGTAGAATGGAT
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Protein sequence

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INVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFLGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEDDEYYDEDD
VADQDE

IVF0005003 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome