| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0039788.1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like [Cucumis melo var. makuwa] | 6.63e-215 | 92.58 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAV-RESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAV RESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAV-RESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEK
GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNW G+ T+ ++VAEETVNETEK
Subjt: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEK
Query: NVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKE
NVGDEKPIQENDTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKE
Subjt: NVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKE
Query: ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
Subjt: ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| XP_004140509.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A [Cucumis sativus] | 2.51e-205 | 88.52 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNW G+ T+ ++VA ETVNETEKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTR---LEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIAD
VGDEKPIQE+DTSG +N K Q+T EMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+AD
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTR---LEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIAD
Query: KEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
KEERTKKSLSINEFLRPA+GERHY PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFP LGAK
Subjt: KEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| XP_008459799.1 PREDICTED: H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like [Cucumis melo] | 9.50e-217 | 92.84 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNW G+ T+ ++VAEETVNETEKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
VGDEKPIQENDTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Query: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
Subjt: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| XP_022933029.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X2 [Cucurbita moschata] | 7.10e-186 | 82.09 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KKG AQTKP+ S +QQNKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGRGYG RGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRD ANSEN +APEDG GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNW G+ + ++VAEE VNE EKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
VGDEKP+QE DTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRK+L+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Query: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGY GSS+SNVAAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| XP_038874269.1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like [Benincasa hispida] | 1.46e-186 | 83.29 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAA A AP SKKGPAQTKP+ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYG RGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRD AN+E+ NAPEDG GGKT ERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE A+GERPRRAFERHSGTGRGNEFKREG+GRGNW G+ T+ ++V EE VNETEKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRK--PNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADK
VGDEKPIQE+DTSG K + P K EMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNN+IFIKLGSEKDKRKEIADK
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRK--PNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADK
Query: EERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
EERTKKSLSINEFLRPAEGERHY PGGRGRGRGRG RGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: EERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K9Z4 HABP4_PAI-RBP1 domain-containing protein | 4.2e-161 | 88.43 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
M TLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKK PAQTKPLPSGAQ NKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRDS N+ENINAPEDGVGGKT+ERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGE AEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNW G+ T+ ++VA ETVNETEKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
VGDEKPIQE+DTSG K ++ + + EMTLEEYEKLLEDKRK+LLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKE+ADKEE
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Query: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
RTKKSLSINEFLRPA+GERHY PGGRGRGRGRGSRGGYSGS MSNVAAPSI DPGQFP LGAK
Subjt: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| A0A1S3CBH1 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like | 6.4e-170 | 92.84 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNW G+ T+ ++VAEETVNETEKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
VGDEKPIQENDTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Query: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
Subjt: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| A0A5A7TA33 H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like | 1.6e-168 | 92.58 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQA-VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEK
GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNW G+ T+ ++VAEETVNETEK
Subjt: GFNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEK
Query: NVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKE
NVGDEKPIQENDTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKE
Subjt: NVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKE
Query: ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
Subjt: ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| A0A6J1EYL1 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X2 | 2.9e-146 | 82.09 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KKG AQTKP+ S +QQNKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRD ANSEN +APEDG GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNW G+ + ++VAEE VNE EKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
VGDEKP+QE DTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRK+L+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEE
Query: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGY GSS+SNVAAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: RTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| A0A6J1F3H7 RGG repeats nuclear RNA binding protein A-like isoform X1 | 7.2e-145 | 81.87 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MAT+NPFDLLGDDDAEDPSQLIAAK A TAP KKG AQTKP+ S +QQNKPASLPSKPLPP+QAVRE+RNEGSRGGRGSGRGGGR GYGRGREGGG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
FNRD ANSEN +APEDG GKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFN+GE +GERPRR FERHSGTGRGNE KREG+GRGNW G+ + ++VAEE VNE EKN
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGGKTTERRGYGGPRGRGGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKN
Query: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL-GSEKDKRKEIADKE
VGDEKP+QE DTSG K + + + EMTLEEYEKLLEDKRK+L+ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKK+NNDIFIKL GSEKDKRKEIADKE
Subjt: VGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKL-GSEKDKRKEIADKE
Query: ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGY GSS+SNVAAPSIEDPGQFP LGAK
Subjt: ERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23523 RGG repeats nuclear RNA binding protein A | 4.0e-68 | 52.36 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLL DDDAEDPSQL AVA + K K Q LP+ LPSKPLPPAQAVRE+R++ RG GGGRG G+ RGR G
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTN
G+NRD N S P E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ E +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNW
Subjt: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTN
Query: LLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIK
+ ++ ETEK+VG EKP ++ + + + +++P K EMTL+EYEK+LE+K+K+L +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIK
Subjt: LLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIK
Query: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NVAAPSIEDPGQFPILGAK
LGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N AAP+I D QFP LG K
Subjt: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| O23593 RGG repeats nuclear RNA binding protein B | 1.3e-58 | 47.3 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA++NPFDLL DDDAEDPSQ++A+K PL P QT K +P+KP PP+QAVRE+RN G GRG GRG YGRG GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEE
NRDS N++ A E+G GG ++ E G GGP G RG RRG + N G++ + ERPR+ ++RHS T GNE KR+G+GR NW G + ++ V EE
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEE
Query: TVNETEKNVGDEKPIQEND-TSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKD
+ +KN+ EK E + T + + K + KP K EMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F +MQQLSSKK NND +FIKLG+EKD
Subjt: TVNETEKNVGDEKPIQEND-TSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKD
Query: KRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
KR I ++EE+T+KSLSINEFL+PA+G+ +Y P GGR GR G R G + + P+I D QFP LG
Subjt: KRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
|
|
| Q9LVT8 RGG repeats nuclear RNA binding protein C | 1.1e-54 | 48.55 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA+LNPFDLLG DDAEDPSQL AVA + +K A +P K A P+KP PP+QAVRESRN +GGRG GGRG G+ RGR GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLS
+NRD+ N++ N N G + + G GG R GG RRGG +GE+ + ERP R ++RHS TG G KR G GRGNW G + +
Subjt: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLS
Query: KVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDT-SGRTQMTL-LKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIK
+EE E EK+ EK E++T + ++T K Q++ + EMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F SMQQLS+KK+ + +IFIK
Subjt: KVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDT-SGRTQMTL-LKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIK
Query: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
LGS+K+KRK D E+ KKSLSINEFL+PA+G+R+ GG RGR GRG RG G + AAP+I D QFP LG
Subjt: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
|
|
| Q9SQ56 RGG repeats nuclear RNA binding protein A (Fragment) | 3.4e-59 | 55.84 | Show/hide |
Query: GGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSANSEN-----------INAPEDGVGGKTTERR-GYGGPRG--RGGRRGGFNDGENA--EGERPRRAFERHSG
GGRG RGGGRG G GRGR GFN++SA+ EN EDG GK +ERR GYGGPRG GGRRGGFN+G+ A EGERPRR F+R SG
Subjt: GGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSANSEN-----------INAPEDGVGGKTTERR-GYGGPRG--RGGRRGGFNDGENA--EGERPRRAFERHSG
Query: TGRGNEF-KREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKNVGDEKPI--QENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEE
TGRGNE+ KREGSGRGNW G + +++ E VN+ EK V EK +E + + + +++P +K EMTLEEYEKL+E+KRK+LLALK EE
Subjt: TGRGNEF-KREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKNVGDEKPI--QENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEE
Query: RKVD-PKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN--VAAPSIEDPG
RKV+ KE SMQ LS+KK++++IFIKLGSEK+KRKE +K +T+ SINEFL+PAEGE + GGRGRG GRG RGG+ G N +APSIED G
Subjt: RKVD-PKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMSN--VAAPSIEDPG
Query: QFPILGAK
QFP L AK
Subjt: QFPILGAK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT4G16830.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 2.8e-69 | 52.36 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
MATLNPFDLL DDDAEDPSQL AVA + K K Q LP+ LPSKPLPPAQAVRE+R++ RG GGGRG G+ RGR G
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSK-KGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGG
Query: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTN
G+NRD N S P E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ E +GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNW
Subjt: GFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTN
Query: LLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIK
+ ++ ETEK+VG EKP ++ + + + +++P K EMTL+EYEK+LE+K+K+L +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIK
Subjt: LLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIK
Query: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NVAAPSIEDPGQFPILGAK
LGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N AAP+I D QFP LG K
Subjt: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| AT4G16830.2 Hyaluronan / mRNA binding family | 4.7e-48 | 54.34 | Show/hide |
Query: EGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDK
+GERPRRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNW + ++ ETEK+VG EKP ++ + + + +++P K EMTL+EYEK+LE+K
Subjt: EGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDK
Query: RKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---
+K+L +L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKLGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S
Subjt: RKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---
Query: NVAAPSIEDPGQFPILGAK
N AAP+I D QFP LG K
Subjt: NVAAPSIEDPGQFPILGAK
|
|
| AT4G16830.3 Hyaluronan / mRNA binding family | 4.0e-55 | 51.27 | Show/hide |
Query: VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERP
VRE+R++ RG GGGRG G+ RGR GG+NRD N S P E V + ERRG GG PRG GGRRGGF++ E +GERP
Subjt: VRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGGFNRDSAN---SENINAP--EDGVGGKTTERRGYGG-PRGR---------GGRRGGFNDGENAEGERP
Query: RRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLL
RRAFER SGTGRG++FKR+GSGRGNW + ++ ETEK+VG EKP ++ + + + +++P K EMTL+EYEK+LE+K+K+L
Subjt: RRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDTSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLL
Query: ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NVAAP
+L T ERKVD K F SMQQLS+KK N++IFIKLGS+KDKRK+ DKEE+ KK++SINEFL+PAEG +Y G GRGRG RGG S N AAP
Subjt: ALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNNDIFIKLGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGRGRGSRGGYSGSSMS---NVAAP
Query: SIEDPGQFPILGAK
+I D QFP LG K
Subjt: SIEDPGQFPILGAK
|
|
| AT4G17520.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 9.2e-60 | 47.3 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA++NPFDLL DDDAEDPSQ++A+K PL P QT K +P+KP PP+QAVRE+RN G GRG GRG YGRG GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEE
NRDS N++ A E+G GG ++ E G GGP G RG RRG + N G++ + ERPR+ ++RHS T GNE KR+G+GR NW G + ++ V EE
Subjt: FNRDSANSENINAPEDGVGG---KTTERRG--YGGPRG--RGGRRGGF-NDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLSKVAEE
Query: TVNETEKNVGDEKPIQEND-TSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKD
+ +KN+ EK E + T + + K + KP K EMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F +MQQLSSKK NND +FIKLG+EKD
Subjt: TVNETEKNVGDEKPIQEND-TSGRTQMTLLKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKDNND-IFIKLGSEKD
Query: KRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
KR I ++EE+T+KSLSINEFL+PA+G+ +Y P GGR GR G R G + + P+I D QFP LG
Subjt: KRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTP-----GGR-------------GRGRGRGSRGGYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
|
|
| AT5G47210.1 Hyaluronan / mRNA binding family | 8.0e-56 | 48.55 | Show/hide |
Query: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
MA+LNPFDLLG DDAEDPSQL AVA + +K A +P K A P+KP PP+QAVRESRN +GGRG GGRG G+ RGR GG
Subjt: MATLNPFDLLGDDDAEDPSQLIAAKVAAVATAPLSKKGPAQTKPLPSGAQQNKPASLPSKPLPPAQAVRESRNEGSRGGRGSGRGGGRGYGYGRGREGGG
Query: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLS
+NRD+ N++ N N G + + G GG R GG RRGG +GE+ + ERP R ++RHS TG G KR G GRGNW G + +
Subjt: FNRDSANSE---NINAPEDGVGGKTTERRG------YGGPRGRGG----RRGGFNDGENAEGERPRRAFERHSGTGRGNEFKREGSGRGNWEGQLTNLLS
Query: KVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDT-SGRTQMTL-LKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIK
+EE E EK+ EK E++T + ++T K Q++ + EMTLEEYEK+LE+K+K+L A K EERKVD K F SMQQLS+KK+ + +IFIK
Subjt: KVAEETVNETEKNVGDEKPIQENDT-SGRTQMTL-LKNQRKPNQKTRLEMTLEEYEKLLEDKRKSLLALKTEERKVDPKEFASMQQLSSKKD-NNDIFIK
Query: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
LGS+K+KRK D E+ KKSLSINEFL+PA+G+R+ GG RGR GRG RG G + AAP+I D QFP LG
Subjt: LGSEKDKRKEIADKEERTKKSLSINEFLRPAEGERHYTPGGRGRGR-GRGSRG-GYSGSSMSNVAAPSIEDPGQFPILG
|
|
