; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0005159 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0005159
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionGlycine rich protein
Genome locationchr01:3562260..3563271
RNA-Seq ExpressionIVF0005159
SyntenyIVF0005159
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CEG62450.1 Glycine rich protein [Cucumis sativus]2.83e-5790.16Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGG---GYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGC
        MSSKAFVFLGL LAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG   GYG G   RGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGC
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGG---GYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGC

Query:  RYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

KAA0059138.1 cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo var. makuwa]3.50e-69100Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR

Query:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP
        CGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP

KGN43456.1 hypothetical protein Csa_020456 [Cucumis sativus]1.28e-5790.98Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGG---GYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGC
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG   GYG G   RGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGC
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGG---GYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGC

Query:  RYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

NP_001267708.1 glycine-rich protein-like precursor [Cucumis sativus]6.94e-5890.98Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGG---GYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGC
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG   GYG G   RGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGC
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGG---GYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGC

Query:  RYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_008455506.1 PREDICTED: cold and drought-regulated protein CORA-like [Cucumis melo]2.88e-6899.15Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAET SKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR

Query:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP
        CGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein1.8e-4191.6Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG     G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A0A1IXP4 Glycine rich protein5.4e-4190.76Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGL LAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG     G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A1S3C180 cold and drought-regulated protein CORA-like4.8e-5099.15Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAET SKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR

Query:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP
        CGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like9.7e-51100Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGR

Query:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP
        CGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  CGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0P8W6 Cell wall glycine-rich protein1.8e-4191.6Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG GGYDRGYGGG     G GRGGYGRG YGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYG-GGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYG

Query:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        RCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  RCGYRCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P11898 Glycine-rich protein HC14.6e-0547.66Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYG----GGGY--GRGGYGRGG---YGRGGYGGRGGYGGGR
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++KT+  N      NG      GGGY  G G    GGGY  G GGY  GG    G GGY   GG+  G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYG----GGGY--GRGGYGRGG---YGRGGYGGRGGYGGGR

Query:  GGY--------GRGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY        G G  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGY--------GRGCRYGRCGYRCCSYA

P23137 Glycine-rich protein4.6e-0552.14Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRG-GYGGGRGGYGRGCR
        M SKAF+FLGL LAF  L+SSEV A +LAETS+  K D E  V+ +G       GGY+   GG GY  GG GRGG   GGY  RG  YG  R GY  GC+
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRG-GYGGGRGGYGRGCR

Query:  YGRCGYRCCSYAGEVVE
              RCCSYAGE ++
Subjt:  YGRCGYRCCSYAGEVVE

P37703 Glycine-rich protein DC9.14.6e-0547.66Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYG----GGGY--GRGGYGRGG---YGRGGYGGRGGYGGGR
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++KT+  N      NG      GGGY  G G    GGGY  G GGY  GG    G GGY   GG+  G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTD--NEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYG----GGGY--GRGGYGRGG---YGRGGYGGRGGYGGGR

Query:  GGY--------GRGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY        G G  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGY--------GRGCRYGRCGYRCCSYA

Q07202 Cold and drought-regulated protein CORA1.3e-0450Show/hide
Query:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDR--GYGGGGYGRGG---YGRGGYGRGGYG---GRGGY--GGGRGG
        S KA + L LL   + L+SS ++ARDL ETS+    E   +TN V DAKYGGGY+   GY GGGY  GG   +G GGY  GG G   G GGY  GGG GG
Subjt:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDR--GYGGGGYGRGG---YGRGGYGRGGYG---GRGGY--GGGRGG

Query:  YGRGCRYGRCGY
        +G G   G  G+
Subjt:  YGRGCRYGRCGY

Q09134 Abscisic acid and environmental stress-inducible protein8.3e-0756.04Show/hide
Query:  VLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGY---GRGCRYGRCGY
        VLL+SSEV+ARDL ET+S    E   +TN V DAKYGGGY+  +GGGGY  GGY  GG   GGY   GGY  G GGY   G G  +G  GY
Subjt:  VLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGY---GRGCRYGRCGY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family2.3e-0448.78Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGY-GRGGY-GRGGYGRGGYGGRGGY-GGGRGGYGRGCR
        M+SKA V  GL    VLL+ +EVAA   A  + K+++  TV+ +     +Y GG+    G GGY G GGY G GG+  GGY G GGY GGG GG    CR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGY-GRGGY-GRGGYGRGGYGGRGGY-GGGRGGYGRGCR

Query:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        YG C  GY    RCCSYAGE V+
Subjt:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family1.7e-0750.38Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED--AKYGGGYDRGYGGGGYG---RGGYGR--GGYGR--GGYGGR-GGYGGGRG
        M+SKA +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S++  N    E    E      GGGY  G+ GGGYG    GGYG   GGY    GGYG R GGYG   G
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVED--AKYGGGYDRGYGGGGYG---RGGYGR--GGYGR--GGYGGR-GGYGGGRG

Query:  GYGRGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE
        GY   CRYG C  GY     RCC+YAG+ V+
Subjt:  GYGRGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCTAAAGCCTTTGTTTTCCTTGGCCTTCTTCTCGCCTTCGTTCTTCTCCTCTCGTCTGAGGTGGCCGCAAGAGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGACGGACAA
CGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGAGGGTACGACAGAGGCTATGGCGGTGGTGGTTACGGTCGTGGTGGCTACGGTCGTGGTGGGT
ATGGTCGTGGTGGGTATGGTGGTCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGGTATGGCAGAGGTTGCCGATATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCTGGT
GAAGTAGTAGAGGGTGCAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTCAATTCTCATCTCTTTCTCTCTAGCTTTATGTACCTATAAATACCTGTATAAGAATGTAAATCTTTCTCATCCCCATCTCCTAAAATCAATCTCTTACTAAACACAC
AAAAATGAGTTCTAAAGCCTTTGTTTTCCTTGGCCTTCTTCTCGCCTTCGTTCTTCTCCTCTCGTCTGAGGTGGCCGCAAGAGACCTTGCGGAGACCTCCTCCAAGACGG
ACAACGAGGCCACGGTGGAAACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGAGGGTACGACAGAGGCTATGGCGGTGGTGGTTACGGTCGTGGTGGCTACGGTCGTGGT
GGGTATGGTCGTGGTGGGTATGGTGGTCGTGGAGGCTATGGTGGTGGCCGTGGTGGGTATGGCAGAGGTTGCCGATATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGC
TGGTGAAGTAGTAGAGGGTGCAAAACCCTAAGACAAGGTGTAGAATGGGATGAAATAATAATAAGGTTTAAAGTTTAATTTGTGTTTGGTTAAATGTGTGAACTGTGGAA
GTTTGAGAAGAATAAATACATGGGGAATGGGAGGAGTGGCTTCATCTGTAGTTTTTCTTTTTCCCCATGTTTGGGTTTTAGTATGTTATTGCAAAGATTTGCTTTTTGCA
AATTTTTATAATATCAACAAACGTATTTTCATTTCGTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKTDNEATVETNGVEDAKYGGGYDRGYGGGGYGRGGYGRGGYGRGGYGGRGGYGGGRGGYGRGCRYGRCGYRCCSYAG
EVVEGAKP