; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0005418 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0005418
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionglycine-rich protein
Genome locationchr02:6878957..6879606
RNA-Seq ExpressionIVF0005418
SyntenyIVF0005418
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055986.1 GMP synthase [Cucumis melo var. makuwa]1.54e-6798.2Show/hide
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KAA0061509.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold41G00700 [Cucumis melo var. makuwa]5.50e-4098.63Show/hide
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KAA0061742.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold212G001170 [Cucumis melo var. makuwa]2.17e-4198.63Show/hide
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TYK05710.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G001920 [Cucumis melo var. makuwa]3.95e-4398.63Show/hide
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TYK10764.1 uncharacterized protein E5676_scaffold332G00770 [Cucumis melo var. makuwa]5.50e-4098.63Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UNW5 GMP synthase4.3e-5598.2Show/hide
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A0A5A7V0N4 Peptidase A1 domain-containing protein7.1e-3498.63Show/hide
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A0A5A7V766 Uncharacterized protein2.5e-3498.63Show/hide
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A0A5D3C2Z4 Uncharacterized protein2.5e-3498.63Show/hide
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A0A5D3CHT8 Uncharacterized protein2.5e-3498.63Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G32920.1 glycine-rich protein9.2e-2668.92Show/hide
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        + P+LYC+  DCP ELLHP EDCNVNS+LPFTLQICRVED+TVEG I GSVI FH  R + V  SG ISA G+G
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AT4G32920.2 glycine-rich protein9.2e-2668.92Show/hide
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        + P+LYC+  DCP ELLHP EDCNVNS+LPFTLQICRVED+TVEG I GSVI FH  R + V  SG ISA G+G
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AT4G32920.3 glycine-rich protein9.2e-2668.92Show/hide
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        + P+LYC+  DCP ELLHP EDCNVNS+LPFTLQICRVED+TVEG I GSVI FH  R + V  SG ISA G+G
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AT5G11700.1 LOCATED IN: vacuole7.3e-2365.28Show/hide
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        P+LYCE  DCP ELL+P EDCNVN++L FTLQICRVED+ VEG I GSV+HFH  + + +  SG ISASG+G
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AT5G11700.2 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycine-rich protein (TAIR:AT4G32920.3)7.3e-2365.28Show/hide
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        P+LYCE  DCP ELL+P EDCNVN++L FTLQICRVED+ VEG I GSV+HFH  + + +  SG ISASG+G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCAATTCTGTTATAAAGGCAAGTAGCAGCTCCTTTTGTTTCCCATCTATCGAGAGCTATATTTTAGCCAAAAATTATTCTTTGGACTTTCTCAAGAGTGTGTTTCA
TATGAGACCACGACTCTACTGTGAACTTTCTGATTGTCCAGCGGAACTACTTCACCCCTCTGAAGATTGTAACGTGAATTCCACATTGCCCTTCACTCTTCAGATTTGTC
GAGTTGAAGATCTAACAGTTGAAGGCACCATAACTGGATCTGTTATTCACTTTCACTGGGTCAGGGATATATTTGTTTACCTATCTGGTGCAATTAGTGCTTCTGGTCTT
GGTATGCATTTTTCTTCCAATTATTTTGTTCTTACCTGGCAGGTTCAAGTAGTTTTAATGAAAAATTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNSVIKASSSSFCFPSIESYILAKNYSLDFLKSVFHMRPRLYCELSDCPAELLHPSEDCNVNSTLPFTLQICRVEDLTVEGTITGSVIHFHWVRDIFVYLSGAISASGL
GMHFSSNYFVLTWQVQVVLMKNF