| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0039871.1 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [Cucumis melo var. makuwa] | 4.24e-31 | 90.28 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| XP_004140564.3 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [Cucumis sativus] | 4.53e-31 | 90.28 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| XP_008459932.1 PREDICTED: U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [Cucumis melo] | 8.13e-32 | 91.67 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT +SGEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| XP_022960458.1 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [Cucurbita moschata] | 2.29e-29 | 86.11 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKL+S+RVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVE SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| XP_023005060.1 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' [Cucurbita maxima] | 2.29e-29 | 86.11 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKL+S+RVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVE SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K9F1 LRRcap domain-containing protein | 1.6e-24 | 90.28 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| A0A1S3CAU7 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 4.2e-25 | 91.67 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT +SGEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| A0A5D3DMX8 U2 small nuclear ribonucleoprotein A | 1.6e-24 | 90.28 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| A0A6J1KWC8 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 3.0e-23 | 86.11 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKL+S+RVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT + GEVE SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| E5GB46 U2 small nuclear ribonucleoprotein a | 4.2e-25 | 91.67 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
LLDNNI K+PNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEE KKESVKT +SGEVEK SKPV
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLISGEVEKESKPV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P09661 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 3.6e-05 | 52.17 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSK
+L N + + +YRLYVI+K+ VRVLDF+KV+ KER EA +F K
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSK
|
|
| P43333 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 1.2e-13 | 75 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKES
LLDNNI K+ NYRLYVIHKLKS+RVLDF K++ KER EA +LFSSKE EEE KK S
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKES
|
|
| P57784 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 3.6e-05 | 52.17 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSK
+L N + + +YRLYVI+K+ VRVLDF+KV+ KER EA +F K
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSK
|
|
| Q4R8Y8 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 3.6e-05 | 52.17 | Show/hide |
Query: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSK
+L N + + +YRLYVI+K+ VRVLDF+KV+ KER EA +F K
Subjt: LLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSK
|
|
| Q9V4Q8 Probable U2 small nuclear ribonucleoprotein A' | 1.8e-04 | 38.1 | Show/hide |
Query: CLLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLIS
CLL N + +PNYR Y+ +K +R+LDF+K++ K+R A+ F +K+ ++ K+ S K+ +S
Subjt: CLLDNNIMKQPNYRLYVIHKLKSVRVLDFKKVRNKERLEARNLFSSKEVEEEGKKESVKTLIS
|
|
