; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0005687 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0005687
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionHomeobox-leucine zipper protein HAT22-like
Genome locationchr06:15407355..15409659
RNA-Seq ExpressionIVF0005687
SyntenyIVF0005687
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060358.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Cucumis melo var. makuwa]5.46e-188100Show/hide
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KAE8650751.1 hypothetical protein Csa_017535 [Cucumis sativus]1.16e-18990.07Show/hide
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XP_008450165.1 PREDICTED: homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Cucumis melo]3.15e-18799.62Show/hide
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XP_038903319.1 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like [Benincasa hispida]2.70e-12976.7Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBR7 Homeobox domain-containing protein5.4e-14096.2Show/hide
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A0A1S3BNL6 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like3.9e-14699.62Show/hide
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A0A5D3DEZ1 Homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.0e-146100Show/hide
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A0A6J1FR71 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like3.5e-9473.33Show/hide
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        E+QELKA+KLA P+YM M  ATLT+CPSCERV   G  GV  G+  SKPKFSM P P FYNPFSNPSAAC
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A0A6J1KP81 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like1.5e-9473.13Show/hide
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        QELKA+KLA P+YM M  ATLT+CPSCERV     GGV  G+  SKPKFSM P P FYNPFSNPSAAC
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XE76 Homeobox-leucine zipper protein HOX191.9e-4951.26Show/hide
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         LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQ+E+QEL+A+K A                 P YMQ+  ATLTICPSCERV
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        G             +K          F+NPF++ SAAC
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P46603 Homeobox-leucine zipper protein HAT91.5e-6556.32Show/hide
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        LVLGLG S + ++  +T+++      SS    EP  LTL  S   GDP   V+   G   L RQTS HS     S    VKRERD   E  E E +  RV
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             ED++G  + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DEN RLQKE+QE
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        LK +KL +P YM M  +TLT CPSCER+G GG G    G            S +K  FS+   P F+NPF+NPSAAC
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P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT222.2e-6956.78Show/hide
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        LVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  S   G+ ++          + RQTS H S + S  SG+VKRER++S       +EE   
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Query:  ERVCWRVNDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQ
          VC RV+D+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETLTDENRRLQ
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        KE+Q+LKA+KL++P YM M  ATLT+CPSCER+G GG GG   A     +K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
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Q67UE2 Homeobox-leucine zipper protein HOX113.3e-4952.4Show/hide
Query:  PAPCSSSSLDFEPCVLTLGF-------SGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSA---VCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVNDEDDDGCNNT
        P P SS S   E    T GF       SGGGG       + + V      +SP++SA       FSG      D +      +R C R +DEDD G  + 
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Query:  RKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQM
        RKKLRLSK+QSA LEESFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQKE+ EL+A+K   P YM +
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Query:  SGATLTICPSCERVGTGGHGGVADGNSNS
           TL++CPSCERV +      A   + S
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Q8GRL4 Homeobox-leucine zipper protein HOX191.9e-4951.26Show/hide
Query:  SGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVNDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQ
        SGGGG  H                S  S +V ++ +  VKRER   +EE + ERV       DDD   +TRKKLRL+K+QSALLE+ F+++STLNPKQK 
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         LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCETLT+ENRRLQ+E+QEL+A+K A                 P YMQ+  ATLTICPSCERV
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Query:  GTGGHGGVADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC
        G             +K          F+NPF++ SAAC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22800.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.0e-6656.32Show/hide
Query:  LVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRV
        LVLGLG S + ++  +T+++      SS    EP  LTL  S   GDP   V+   G   L RQTS HS     S    VKRERD   E  E E +  RV
Subjt:  LVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRV

Query:  ---NDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQE
             ED++G  + RKKLRL+KQQSALLEESFK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETL DEN RLQKE+QE
Subjt:  ---NDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQE

Query:  LKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADG-----------NSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC
        LK +KL +P YM M  +TLT CPSCER+G GG G    G            S +K  FS+   P F+NPF+NPSAAC
Subjt:  LKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADG-----------NSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 31.1e-4455.39Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERVCWRV--NDEDDDGCNN----TRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL
        S  +S V S  SGK K ER+L +          E+ E+ER    +    +D+DG  N    +RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK++STLNPKQK  LA+QLNL
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSS----------EEVELERVCWRV--NDEDDDGCNN----TRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNL

Query:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERVG-TGGHGGVADGNSNSKPKFSMP
          RQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE LTDENRRLQKEV EL+A+KL+  +YM M    TLT+CPSCERV  T     VA    NS    S P
Subjt:  LPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERVG-TGGHGGVADGNSNSKPKFSMP

Query:  PNPL
          P+
Subjt:  PNPL

AT4G16780.1 homeobox protein 21.6e-4361.49Show/hide
Query:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVNDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART
        S  +S V SS   + +RE D   +         R   +D+DG +N+RKKLRLSK QSA+LEE+FK +STLNPKQKQ LA+QL L  RQVEVWFQNRRART
Subjt:  SPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSEEVELERVCWRVNDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRART

Query:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERV
        K+KQTEVDCE L++CCE LT+ENRRLQKEV EL+A+KL+   YM MS   TLT+CPSCE V
Subjt:  KVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELKAIKLAKPVYMQMS-GATLTICPSCERV

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family1.5e-7056.78Show/hide
Query:  LVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS-------SEEVEL
        LVLGLGLS   ++    +KK  +      +  +P  LTL  S   G+ ++          + RQTS H S + S  SG+VKRER++S       +EE   
Subjt:  LVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLS-------SEEVEL

Query:  ERVCWRVNDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQ
          VC RV+D+ DD+   + RKKLRL+KQQSALLE++FK +STLNPKQKQ LARQLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LKKCCETLTDENRRLQ
Subjt:  ERVCWRVNDE-DDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQ

Query:  KEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGG--VADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC
        KE+Q+LKA+KL++P YM M  ATLT+CPSCER+G GG GG   A     +K  FS+   P FYNPF+NPSAAC
Subjt:  KEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGG--VADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana3.7e-4870.8Show/hide
Query:  ELERVCWRVNDEDDDGCN-NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR
        E+ER   R ++ED+D  N +TRKKLRLSK QSA LE+SFK++STLNPKQK  LA+QLNL PRQVEVWFQNRRARTK+KQTEVDCE LK+CCE+LT+ENRR
Subjt:  ELERVCWRVNDEDDDGCN-NTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRR

Query:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGT
        LQKEV+EL+ +K + P YMQ+   TLT+CPSCERV T
Subjt:  LQKEVQELKAIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTTCCCCACAACCATGTGAACTATGGGATTCGAGCACGAAAAGGAAATTAAGTAATTGGTTGGTGTTGGGATTAGGGCTCTCAGAATTAGCTGACGATCAAAGGAC
GACATTGAAGAAGAAGCCTGCACCTTGCTCCTCCAGTTCACTTGATTTCGAGCCTTGTGTTTTGACTTTGGGATTTTCCGGTGGTGGTGGCGACCCTCATCGGAAAGTTA
TTGATCATGAGGGTGTTCGTCATTTATATCGCCAAACATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTGTTCTTCCTTCTCGGGTAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAA
GAAGTTGAACTGGAGAGAGTTTGTTGGAGAGTTAATGATGAAGATGACGATGGTTGTAATAATACTAGAAAGAAACTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCTTGGA
AGAAAGTTTCAAACAGAATAGCACGCTCAATCCTAAGCAAAAACAAGGCTTAGCAAGACAGCTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAG
CTCGAACAAAAGTGAAACAAACGGAAGTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGACGTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAG
GCAATAAAGCTGGCAAAACCGGTATACATGCAGATGTCGGGGGCGACATTAACCATATGCCCCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGCGGACGG
TAATTCTAATTCCAAACCCAAATTTTCAATGCCTCCTAACCCTCTCTTTTACAATCCCTTCTCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTATGAAGCAACACTCAAAAGTGGTAGTAATAGTTAAATGTAGCAAACAAGAAAGAGAGAGAAAGAAAGAATGATACTTTCTTGATGTGTTCCCCACAACCATGTGAACT
ATGGGATTCGAGCACGAAAAGGAAATTAAGTAATTGGTTGGTGTTGGGATTAGGGCTCTCAGAATTAGCTGACGATCAAAGGACGACATTGAAGAAGAAGCCTGCACCTT
GCTCCTCCAGTTCACTTGATTTCGAGCCTTGTGTTTTGACTTTGGGATTTTCCGGTGGTGGTGGCGACCCTCATCGGAAAGTTATTGATCATGAGGGTGTTCGTCATTTA
TATCGCCAAACATCCCCTCATAGCAGCGCTGTTTGTTCTTCCTTCTCGGGTAAGGTTAAAAGAGAGAGAGATCTGAGCAGTGAAGAAGTTGAACTGGAGAGAGTTTGTTG
GAGAGTTAATGATGAAGATGACGATGGTTGTAATAATACTAGAAAGAAACTTAGACTCTCTAAACAACAATCCGCTCTCTTGGAAGAAAGTTTCAAACAGAATAGCACGC
TCAATCCTAAGCAAAAACAAGGCTTAGCAAGACAGCTAAATCTACTGCCACGACAAGTTGAAGTATGGTTTCAGAATAGGAGAGCTCGAACAAAAGTGAAACAAACGGAA
GTAGATTGTGAGTTGTTGAAGAAGTGTTGTGAGACGTTGACGGATGAAAATAGAAGATTACAAAAGGAGGTTCAAGAATTGAAGGCAATAAAGCTGGCAAAACCGGTATA
CATGCAGATGTCGGGGGCGACATTAACCATATGCCCCTCATGCGAAAGGGTGGGTACTGGCGGCCATGGTGGTGTCGCGGACGGTAATTCTAATTCCAAACCCAAATTTT
CAATGCCTCCTAACCCTCTCTTTTACAATCCCTTCTCCAATCCTTCAGCCGCTTGTTAGACAATATTTATTATTCCAACCTACACAATAATATAATTACCTTTTTTCTTT
TATCTTTTCTTCTTCAGAAAGGGTTGTAGAGCTAAATTGGCGATTAGACAAATTTAATGTAAGTAGTAGCTACCTAGCTAGCTTGTAAAAAATTACTCTTTTATCATATC
CAACATCAAATTATGTCAGTCTTATTTTTCTTTACCATGATGTTAAATGTTTCGAAGATAATTGTAAGGTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAATTAAAGTTCGAAAAGTTAGA
ATTCGAAGAACTCTGATCTTAAACTTTTGGTTTAGGATATATATTTTAATGAAATGTTGTTATATGATTAGAGTGATGAAAATGATGATAGAATTTGTTAGGCAGAAATG
TGAGTAGTGATGAAATTTAGAGAAGTTAATTTTGATGTGACGCAATGTGGGTGGTTTGTTGGATTGGAAAATTATTGGGTGGTGTGGTGTTGGTGTAAGGGCTATCTACA
TATCTATCCATCTAATTGGCTGCCTACGTGTTACGCAAAGGATGACATTGATATGACTTTTGCAATTTTAGTAGTGCGTTTTGCCTTCATTCTTCAATACAAATATAATA
CAATTATCTTTTCATCATTTTATCTCTTTTTCTTTCTCTCTCATTCTAGTTTTATATTATGTGGAATCTACTTTACTTTCCTCAAATATATGTCGTCATTTTCTTTCATT
TTTCTATAAAAGAGATGCTGATTTATCAAAAGACCACGTACAATTTTTTTCTCTTTTTATAGAATGTGTTTGGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCSPQPCELWDSSTKRKLSNWLVLGLGLSELADDQRTTLKKKPAPCSSSSLDFEPCVLTLGFSGGGGDPHRKVIDHEGVRHLYRQTSPHSSAVCSSFSGKVKRERDLSSE
EVELERVCWRVNDEDDDGCNNTRKKLRLSKQQSALLEESFKQNSTLNPKQKQGLARQLNLLPRQVEVWFQNRRARTKVKQTEVDCELLKKCCETLTDENRRLQKEVQELK
AIKLAKPVYMQMSGATLTICPSCERVGTGGHGGVADGNSNSKPKFSMPPNPLFYNPFSNPSAAC