; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0005692 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0005692
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionzinc finger protein ZAT12-like
Genome locationchr10:5901890..5902553
RNA-Seq ExpressionIVF0005692
SyntenyIVF0005692
Gene Ontology termsGO:0010200 - response to chitin (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050290.1 zinc finger protein ZAT12-like [Cucumis melo var. makuwa]9.62e-121100Show/hide
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XP_004147699.1 zinc finger protein ZAT12 [Cucumis sativus]2.56e-11893.48Show/hide
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XP_008461644.1 PREDICTED: zinc finger protein ZAT12-like [Cucumis melo]2.98e-129100Show/hide
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XP_022957121.1 zinc finger protein ZAT12-like [Cucurbita moschata]7.37e-10584.24Show/hide
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XP_038892761.1 zinc finger protein ZAT12-like [Benincasa hispida]3.98e-10988.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLU2 Uncharacterized protein1.8e-9193.48Show/hide
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A0A1S3CF73 zinc finger protein ZAT12-like6.1e-100100Show/hide
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A0A5D3CS99 Zinc finger protein ZAT12-like2.5e-93100Show/hide
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A0A6J1GYC8 zinc finger protein ZAT12-like2.2e-8184.24Show/hide
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A0A6J1JZD8 zinc finger protein ZAT12-like1.1e-8083.7Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q42410 Zinc finger protein ZAT124.6e-2846.99Show/hide
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        T ANCLMLLSR          + +     RVF CKTC +QF SFQALGGHRASHKKP        N   SS      K  +H C ICG+EF +GQALGGH
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Q42453 Zinc finger protein ZAT78.1e-2545.03Show/hide
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        T A CLMLLSR                  RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++     NSD  S  GS +  KT   H C ICG++F +GQAL
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Q681X4 Zinc finger protein ZAT51.9e-2139.15Show/hide
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        MA CL++L+R T             H + SS NSS    V+ECKTCNR FSSFQALGGHRASHKKPR                    +G NS     GS 
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         +SQ S       K HECSICG EF  GQALGGHMRRHR           T    R+ +    +  + +      + L LDLNL   E+D   S+F  + 
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Query:  LGKSVSMVDCFF
           + +++DC +
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Q9LX85 Zinc finger protein ZAT81.8e-2442.37Show/hide
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        R  ++E +  T A CLMLLSR                  RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++     +  GS S        +H C ICG+E
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        F +GQALGGHMRRHR+    +   L+T    RS  P       +KKS+ G R+ CLDL+   S  + + L+LG+++S
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Q9SLD4 Zinc finger protein ZAT111.7e-2742.55Show/hide
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        MKRER D E       +A CLM+L++ +       +    S  +  FECKTCN++FSSFQALGGHRASHKKP++        D             H+CS
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        IC   F  GQALGGHMRRHR++        +T  P   +SP  P  PV+K+     RIL LDLNLTP END  ++     V  +D  F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G28710.1 C2H2-type zinc finger family protein2.8e-3346.11Show/hide
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        M+R R D+E I  MANCL+LLS+          +  + + +RVF CKTCN++F SFQALGGHRASH++   + G    S          KP  HEC ICG
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         EFA+GQALGGHMR+HR  +     R L          P   P  +KKS GG   R+LCLDLNLTP EN+   L+LG+ +
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AT2G37430.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.2e-2842.55Show/hide
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        MKRER D E       +A CLM+L++ +       +    S  +  FECKTCN++FSSFQALGGHRASHKKP++        D             H+CS
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        IC   F  GQALGGHMRRHR++        +T  P   +SP  P  PV+K+     RIL LDLNLTP END  ++     V  +D  F
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AT3G46070.1 C2H2-type zinc finger family protein6.8e-2745.05Show/hide
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        RDL ++ T A+CLMLLS             +     RVF CKTC R F SFQALGGHRASH K         NSD  S  GSP  KPKT      H C I
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        CGLEF +GQALGGHMR+HR       A  +L  H   S  P       +KKS+ G R+ CLD +LT  E+  +  L+LG+++
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AT3G46090.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein5.7e-2645.03Show/hide
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        T A CLMLLSR                  RVF CKTC ++FSSFQALGGHRASHKK  ++     NSD  S  GS +  KT   H C ICG++F +GQAL
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Query:  GGHMRRHRATTLLNDARLLTNHPRRSLSPPPPKPPVVKKSNGGGRILCLDLNLTPSENDSRF-LQLGKSVS
        GGHMRRHR   +     L+T    RS  P       +KK + G R+ CLDL+L   E+   + L+LG+++S
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AT5G59820.1 C2H2-type zinc finger family protein3.3e-2946.99Show/hide
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        T ANCLMLLSR          + +     RVF CKTC +QF SFQALGGHRASHKKP        N   SS      K  +H C ICG+EF +GQALGGH
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        MRRHR  +      L+T    R+L  P P    +KKS+ G R+ CLDL+L   +N +  L+LG++V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAGAGAGAGAGATCTCGAGAGCATAACAACCATGGCGAACTGCTTGATGTTACTTTCTCGTAACACTGCGGCAGATCATTTCGAATCCTCGTCTACTAATTCATC
TTCTCCGAATCGTGTTTTTGAGTGCAAGACTTGCAATCGGCAGTTTTCGTCGTTTCAGGCGCTTGGAGGACATCGTGCTAGTCACAAGAAGCCGCGGATTGTTGGAGGAG
ATGGCGGAAACTCCGATGGATCTTCATCGCAAGGTTCTCCGACTAAGCCGAAGACGCACGAGTGTAGTATTTGTGGATTAGAGTTTGCGATTGGTCAAGCGCTTGGAGGA
CATATGAGAAGACATAGAGCAACAACGCTGTTGAACGATGCTCGATTACTTACTAATCATCCTAGAAGATCATTATCTCCTCCTCCGCCGAAACCGCCTGTGGTGAAGAA
GAGCAACGGCGGTGGGAGAATTCTGTGTTTGGATCTGAATTTGACTCCGTCTGAGAATGATAGTAGGTTTCTGCAGCTTGGAAAGAGTGTTTCCATGGTTGATTGTTTCT
TTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTACATTTTCCAATATTCCTTACCATCATTCATCATGAAGAGAGAGAGAGATCTCGAGAGCATAACAACCATGGC
GAACTGCTTGATGTTACTTTCTCGTAACACTGCGGCAGATCATTTCGAATCCTCGTCTACTAATTCATCTTCTCCGAATCGTGTTTTTGAGTGCAAGACTTGCAATCGGC
AGTTTTCGTCGTTTCAGGCGCTTGGAGGACATCGTGCTAGTCACAAGAAGCCGCGGATTGTTGGAGGAGATGGCGGAAACTCCGATGGATCTTCATCGCAAGGTTCTCCG
ACTAAGCCGAAGACGCACGAGTGTAGTATTTGTGGATTAGAGTTTGCGATTGGTCAAGCGCTTGGAGGACATATGAGAAGACATAGAGCAACAACGCTGTTGAACGATGC
TCGATTACTTACTAATCATCCTAGAAGATCATTATCTCCTCCTCCGCCGAAACCGCCTGTGGTGAAGAAGAGCAACGGCGGTGGGAGAATTCTGTGTTTGGATCTGAATT
TGACTCCGTCTGAGAATGATAGTAGGTTTCTGCAGCTTGGAAAGAGTGTTTCCATGGTTGATTGTTTCTTTTGATCCATTCTAGAGTACATATTCAAACAGATCACGAAA
CAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKRERDLESITTMANCLMLLSRNTAADHFESSSTNSSSPNRVFECKTCNRQFSSFQALGGHRASHKKPRIVGGDGGNSDGSSSQGSPTKPKTHECSICGLEFAIGQALGG
HMRRHRATTLLNDARLLTNHPRRSLSPPPPKPPVVKKSNGGGRILCLDLNLTPSENDSRFLQLGKSVSMVDCFF