; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0006193 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0006193
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionABC transporter G family member 12 like
Genome locationchr02:8886518..8891306
RNA-Seq ExpressionIVF0006193
SyntenyIVF0006193
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR018790 - Protein of unknown function DUF2358


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B999 uncharacterized protein LOC1034871951.4e-162100Show/hide
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A0A5D3CX50 Uncharacterized protein3.7e-11890.31Show/hide
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A0A6J1DTK7 uncharacterized protein LOC1110238781.2e-14288.49Show/hide
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A0A6J1F169 uncharacterized protein LOC1114411881.0e-14487.79Show/hide
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A0A6J1I9U0 uncharacterized protein LOC1114724604.6e-14588.45Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G65230.1 Uncharacterized conserved protein (DUF2358)1.2e-8955.52Show/hide
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        +++ S  +P+  P++   RRR  R +     +      H  P     NDS  T     E ++++SE DK+VD +DFGELCN+FEC SSP VESTARQL R
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        DIL++R+G+R+   +AV VKYKDP+R FTGREKYKR +W TS L+NPT +VQEMVM+STSVL IKWT++GKPKS++AA+ GDLI+KV S+FTLNQISGQV
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         EHEE WD+SSSS I+QA+FW SR LFA++E+ KD+AD    LT  ++T K++ +++ DP+ DP KFFQ +++F++D YQ AL LAI+YFVVQFL+ T+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TCCTCCTCAATCCCGCCATGCTTTCCCTCTCAGAGCCGCTGCGAACGATTCCAACAGCACCGAGCAATTGACGGCGGAATCCGCCGTCGAAAGATCGGAGGCTGATAAGA
TCGTAGACGGCATGGATTTCGGTGAACTCTGCAACGAATTTGAGTGCATCAGTAGCCCATTGGTTGAATCTACTGCCAGGCAACTTGCTAGAGACATTCTTCAACTTCGT
CAAGGCGATCGATCTCTTGGAAATTTTGCGGTCTTTGTCAAGTATAAGGATCCGATTAGGAAATTCACGGGTCGAGAAAAGTATAAAAGACAACTATGGGCAACCAGTGC
GCTTGACAATCCAACTACGAGTGTGCAAGAAATGGTGATGATGTCAACAAGCGTACTAAACATCAAGTGGACAATCAGAGGGAAACCTAAATCCTTGGTAGCAGCCATTG
GAGGAGATCTCATCATCAAAGTTGATTCACAGTTCACACTCAACCAAATCAGTGGCCAAGTTATCGAACACGAAGAGCGTTGGGATGTATCGAGTTCTTCTGCCATTTCC
CAAGCTTTCTTTTGGGCCTCACGTTATCTCTTTGCCTCTGCCGAGGCTGGAAAGGACTTGGCTGATTCTGTCAGCAGTCTCACCGGTCGAGTCTCTACCGAGAAACAGAA
CTTGGAAATGTTTCCTGACCCTTCCGGTGATCCTACCAAGTTCTTTCAAGGTGAGGACAACTTCCAAAAAGATGCATACCAATTTGCTCTGCTGCTGGCCATCCTCTATT
TTGTTGTACAGTTTCTGAGGGCCACACTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGAAACCCAAACCACAAGTAACTAATGGCTGGAGTTTGTAATCACAATGGGACGGAGAAATGAGTACTTGCGTTTCCTCTCCTTCTCTCGCCGTTCCATCTCCAGCGCC
CGCCTCCACGATCTTCCGCCGCAGGATCCTCCGTGGCGCCTCCGCACCTCTCGCCGTTCCTCCTCCTCAATCCCGCCATGCTTTCCCTCTCAGAGCCGCTGCGAACGATT
CCAACAGCACCGAGCAATTGACGGCGGAATCCGCCGTCGAAAGATCGGAGGCTGATAAGATCGTAGACGGCATGGATTTCGGTGAACTCTGCAACGAATTTGAGTGCATC
AGTAGCCCATTGGTTGAATCTACTGCCAGGCAACTTGCTAGAGACATTCTTCAACTTCGTCAAGGCGATCGATCTCTTGGAAATTTTGCGGTCTTTGTCAAGTATAAGGA
TCCGATTAGGAAATTCACGGGTCGAGAAAAGTATAAAAGACAACTATGGGCAACCAGTGCGCTTGACAATCCAACTACGAGTGTGCAAGAAATGGTGATGATGTCAACAA
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AGTGGCCAAGTTATCGAACACGAAGAGCGTTGGGATGTATCGAGTTCTTCTGCCATTTCCCAAGCTTTCTTTTGGGCCTCACGTTATCTCTTTGCCTCTGCCGAGGCTGG
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GTGAGGACAACTTCCAAAAAGATGCATACCAATTTGCTCTGCTGCTGGCCATCCTCTATTTTGTTGTACAGTTTCTGAGGGCCACACTATAAATGTAACAAGACTAAGGT
ACCAATAACAAGACTAAGGTACCTTTCTCTATTCTATACTACTGAAGCCTCATCATGTAAAATTCATATTTTTTACAACAAAAATTCATGTAGTAGTTAAACTCAAACAA
TAATGTATGTATGTAATTATGGATTTTTCTTTGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QGDRSLGNFAVFVKYKDPIRKFTGREKYKRQLWATSALDNPTTSVQEMVMMSTSVLNIKWTIRGKPKSLVAAIGGDLIIKVDSQFTLNQISGQVIEHEERWDVSSSSAIS
QAFFWASRYLFASAEAGKDLADSVSSLTGRVSTEKQNLEMFPDPSGDPTKFFQGEDNFQKDAYQFALLLAILYFVVQFLRATL