| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| KAA0044536.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.56e-173 | 99.17 | Show/hide |
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| KGN53003.1 hypothetical protein Csa_015115 [Cucumis sativus] | 7.12e-155 | 90.87 | Show/hide |
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| XP_004152311.2 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 [Cucumis sativus] | 9.17e-155 | 90.87 | Show/hide |
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| XP_008454079.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350-like [Cucumis melo] | 3.95e-174 | 100 | Show/hide |
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| XP_038878176.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350-like [Benincasa hispida] | 3.10e-149 | 86.78 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0KU23 Uncharacterized protein | 7.7e-119 | 90.87 | Show/hide |
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| A0A1S3BX97 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350-like | 1.9e-133 | 100 | Show/hide |
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| A0A5A7TQZ8 Pentatricopeptide repeat-containing protein | 1.6e-132 | 99.17 | Show/hide |
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| A0A5D3CZ95 Pentatricopeptide repeat-containing protein | 1.9e-133 | 100 | Show/hide |
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| A0A6J1IY98 pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350-like | 2.7e-108 | 83.19 | Show/hide |
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A7LN87 Pentatricopeptide repeat-containing protein PPR5, chloroplastic | 2.8e-09 | 26.92 | Show/hide |
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EA + V+SL + A ++ V++ + + F EL R++ L VF++MQ + WY D +Y +I +MG+ I MA +F ++R G
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Query: EPDTRAFNEMMGAYL----QVDMIERAADTY-RLMIASGCTPDKLTFKILIKNLEK----------FKEEFAIVVKKDCYEY
+PDT +N ++GA+L + + +A + ++ C P +T+ IL++ + FK+ VV D Y Y
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|
|
| Q1PFH7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 2.4e-16 | 31.1 | Show/hide |
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S E + A + LK + S +++ I + +SRLLK+DL L E QRQN++ L +++++ ++ E WY PD+ Y M+MM+ +NK ++ ++V+ L+K+
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+ D F +++ +L ++ A Y M S P L F++++K L EK K++F
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|
|
| Q9FKC3 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g48730, chloroplastic | 1.8e-08 | 26.14 | Show/hide |
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+++ S +AI + + K + + L R + L + +T L+ E ++QVF+ ++ + WY+P++ +Y +I+M+GK K E A E+F ++
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Query: KDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIAS-GCTPDKLTFKILIKN
+G + + ++ AY + + A M +S C PD T+ ILIK+
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|
|
| Q9LVW6 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8, chloroplastic | 8.2e-09 | 30 | Show/hide |
Query: NIICGLRKGLKKPLGRSRVPSNEAIQAVQSLKLAKCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEP-DLRLYHGMIMMM
+I CG R + PL + R+ S EAIQ++QSLK A T + L RL+K+DL L EL RQ+ L++ V ++ E Y P DL LY ++ +
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Query: GKNKMIEMAEEVFHKLRKDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASG-----CTPDKLTFKILIKNLEKFKE
+NK + + + ++ D +A +++ A + + E Y LM SG D+ ++L K L + E
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|
|
| Q9STF9 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic | 1.1e-18 | 30.57 | Show/hide |
Query: PLGR-SRVPSNEAIQAVQSLK-LAKCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHGMIMMMGKNKMIEMAEE
PL R ++ EA+ + LK L + K++ I T + RLLK D+ + EL+RQ E L++++F+ +Q +EWY+PD+ +Y +I+ + K+K ++ A
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Query: VFHKLRKDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASGCTPDKLTFKILIKNL-------EKFKEEF-AIVVKKDCYEYLDNPQKFF
++ K++K+ L PD++ + E++ +L+ A + Y M+ S P++L F++L+K L K K++F + +K Y D P++ F
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G62350.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 1.7e-17 | 31.1 | Show/hide |
Query: SNEAIQAVQSLKLAKCTS-KMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHGMIMMMGKNKMIEMAEEVFHKLRKDG
S E + A + LK + S +++ I + +SRLLK+DL L E QRQN++ L +++++ ++ E WY PD+ Y M+MM+ +NK ++ ++V+ L+K+
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+ D F +++ +L ++ A Y M S P L F++++K L EK K++F
Subjt: LEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASGCTPDKLTFKILIKNL-------EKFKEEF
|
|
| AT3G27750.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown | 5.8e-10 | 30 | Show/hide |
Query: NIICGLRKGLKKPLGRSRVPSNEAIQAVQSLKLAKCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEP-DLRLYHGMIMMM
+I CG R + PL + R+ S EAIQ++QSLK A T + L RL+K+DL L EL RQ+ L++ V ++ E Y P DL LY ++ +
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Query: GKNKMIEMAEEVFHKLRKDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASG-----CTPDKLTFKILIKNLEKFKE
+NK + + + ++ D +A +++ A + + E Y LM SG D+ ++L K L + E
Subjt: GKNKMIEMAEEVFHKLRKDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASG-----CTPDKLTFKILIKNLEKFKE
|
|
| AT3G46870.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 8.1e-20 | 30.57 | Show/hide |
Query: PLGR-SRVPSNEAIQAVQSLK-LAKCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHGMIMMMGKNKMIEMAEE
PL R ++ EA+ + LK L + K++ I T + RLLK D+ + EL+RQ E L++++F+ +Q +EWY+PD+ +Y +I+ + K+K ++ A
Subjt: PLGR-SRVPSNEAIQAVQSLK-LAKCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHGMIMMMGKNKMIEMAEE
Query: VFHKLRKDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASGCTPDKLTFKILIKNL-------EKFKEEF-AIVVKKDCYEYLDNPQKFF
++ K++K+ L PD++ + E++ +L+ A + Y M+ S P++L F++L+K L K K++F + +K Y D P++ F
Subjt: VFHKLRKDGLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASGCTPDKLTFKILIKNL-------EKFKEEF-AIVVKKDCYEYLDNPQKFF
|
|
| AT5G09320.1 Vacuolar sorting protein 9 (VPS9) domain | 3.5e-23 | 32.52 | Show/hide |
Query: KKPLGRSRVPSNEAIQAVQSLKLA----------------KCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHG
+KPL R R+ S EAIQAVQ+LK A ++ ++ VI +K RLLK D+ L EL RQNE L+L+VF+ ++ E WY+P +R+Y
Subjt: KKPLGRSRVPSNEAIQAVQSLKLA----------------KCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHG
Query: MIMMMGKNKMIEMAEEVFHKLRKD-GLEPDTRAFNEMMGAYLQVDMIERAADTYRLMIASGCTPDKLTFKILIKNLEKFKE-EFAIVVKKDCYEYLDNPQ
MI +M N ++E ++ ++ + GL + FN ++ L + + D Y M + G PD+ +F++L+ LE E + +V++D +EY
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Query: KFFNDE
+F ++
Subjt: KFFNDE
|
|
| AT5G48730.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 1.3e-09 | 26.14 | Show/hide |
Query: SRVPSNEAIQAVQSLKLAKCTSKMEDVINTKLSRLLKADLFDALTELQRQNELELSLQVFKFMQNEEWYEPDLRLYHGMIMMMGKNKMIEMAEEVFHKLR
+++ S +AI + + K + + L R + L + +T L+ E ++QVF+ ++ + WY+P++ +Y +I+M+GK K E A E+F ++
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+G + + ++ AY + + A M +S C PD T+ ILIK+
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|
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