; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0006412 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0006412
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF538
Genome locationchr02:15566491..15569419
RNA-Seq ExpressionIVF0006412
SyntenyIVF0006412
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007493 - Protein of unknown function DUF538
IPR036758 - At5g01610-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7023568.1 hypothetical protein SDJN02_14594 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.43e-9692.81Show/hide
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XP_022961236.1 uncharacterized protein LOC111461806 [Cucurbita moschata]1.43e-9692.81Show/hide
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XP_038878918.1 uncharacterized protein LOC120071008 [Benincasa hispida]1.23e-9794.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTW9 Uncharacterized protein1.4e-7898.04Show/hide
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A0A1S3CJ18 uncharacterized protein LOC1035015422.6e-80100Show/hide
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A0A5D3BM00 Uncharacterized protein2.6e-80100Show/hide
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A0A6J1H9T4 uncharacterized protein LOC1114618062.8e-7492.81Show/hide
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A0A6J1JBL6 uncharacterized protein LOC1114852982.8e-7492.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02813.1 Protein of unknown function, DUF5389.0e-1732.64Show/hide
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AT1G02816.1 Protein of unknown function, DUF5381.6e-1834.03Show/hide
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        SIF  FLF    PL   + D    +IP  +A+  L  Y FP G+LP  V +Y +++++G F      SC F L   +Y   +   ++G I++ +I  L G
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AT4G02360.1 Protein of unknown function, DUF5382.1e-1836.45Show/hide
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        Y  P G+LP  V  Y +N  +G+F +   D+C+FT+   +Y   +   ++G I+ G + NL G+ V+ LF W +I  +   G DL F VG+ +A +P+ +
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        F ESP C
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AT4G02370.1 Protein of unknown function, DUF5388.2e-1833.04Show/hide
Query:  SAHARLADYGFPFGLLPSAVSTYTINETSGDFSLDLGDSCKFTLPPDNYVASFSRVVTGKIAKGRIHNLDGIRVRALFQWWSITGIRSTGEDLVFEVGLI
        +A++ L  Y FP G+LP  V  Y ++ T+G F     DSC F L   +Y  ++   ++G I++ ++  L G++V+ LF W +I  +   G+++ F VG+ 
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Query:  TAKYPSKSFNESPVC
        +A +  + F ESP C
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AT5G19590.1 Protein of unknown function, DUF5383.3e-4359.6Show/hide
Query:  SIFLLFLFSALLPLSTQSIDSKNLNIPPSSAHARLADYGFPFGLLPSAVSTYTINETSGDFSLDLGDSCKFTLPPDNYVASFSRVVTGKIAKGRIHNLDG
        S+FLL +   LLP+S Q  D       P+ AHA L ++GFP GLLP +V  Y +N+TSGDFSL L  +CK TLPPDNY+A++S  VTG+I++G+I  L G
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        IRVRA F+ WSITGIRS+G++LVFEV  ITAKYPSK+F+ES  CEG+RSSS
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAATCCATCTTCCTTCTCTTTCTCTTCTCAGCCCTCCTTCCCCTTTCCACTCAATCCATCGACTCCAAAAACCTAAACATTCCACCTTCCTCTGCCCATGCTCGCCT
CGCCGATTACGGATTCCCCTTCGGCCTTCTTCCCTCCGCCGTCTCCACCTACACCATTAACGAGACCTCCGGTGACTTCTCTTTGGACCTCGGTGATTCCTGCAAGTTCA
CGCTTCCTCCAGACAACTATGTGGCTTCCTTTTCTAGGGTTGTAACTGGTAAGATTGCAAAGGGTCGGATCCACAATCTTGATGGGATTCGTGTTCGGGCTTTGTTCCAG
TGGTGGTCGATTACTGGTATTAGGTCCACCGGCGAGGATTTGGTTTTCGAGGTTGGGTTGATCACTGCGAAGTACCCGTCTAAGAGTTTCAACGAGAGCCCAGTGTGTGA
AGGCCGTCGGTCTTCTTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AACATTTGATTTTGATTCAGAGGTTGAAGAAGCTCACACCATGAAATCCATCTTCCTTCTCTTTCTCTTCTCAGCCCTCCTTCCCCTTTCCACTCAATCCATCGACTCCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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