; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0006604 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0006604
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionGag-pol polyprotein
Genome locationchr10:24127579..24127818
RNA-Seq ExpressionIVF0006604
SyntenyIVF0006604
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035422.1 gag-proteinase polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]1.52e-2360.26Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE
        +IAF+ S+D+ CWK+++ G E PS KDVA K T K+EIT +K++DE  FGNS+ALNA+FNGVD N+FK IN C  AKE
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE

KAA0038855.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]8.86e-2973.08Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE
        M AFL S+D+ CWKSVLTG E PS+KD A KTT K EIT TKE DEE  GN +ALNALFNG++HNVFKLIN CTSAKE
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE

KAA0047417.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]1.71e-2680.28Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLIN
        MIAFL SVD+  WKSV TGWE PSVKD A KTT K EIT TK+EDEE FGNSKALNALFNGVD NVFKLIN
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLIN

KAA0065462.1 gag-pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]1.65e-49100Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG
        MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG

TYJ98064.1 gag-proteinase polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]8.59e-2467.95Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE
        MIAFL SVD+  WKSVLTGWE PS+ D     T K +I   KEEDEE FGNSK LNAL NGVD NV KLIN CTSAK+
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SVY3 Gag-proteinase polyprotein1.5e-1860.26Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE
        +IAF+ S+D+ CWK+++ G E PS KDVA K T K+EIT +K++DE  FGNS+ALNA+FNGVD N+FK IN C  AKE
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE

A0A5A7VAY3 Gag-pol polyprotein7.0e-37100Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG
        MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG

A0A5D3BG63 Gag-proteinase polyprotein3.0e-1967.95Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE
        MIAFL SVD+  WKSVLTGWE PS+ D     T K +I   KEEDEE FGNSK LNAL NGVD NV KLIN CTSAK+
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE

A0A5D3C137 Gag-pol polyprotein5.4e-2180.28Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLIN
        MIAFL SVD+  WKSV TGWE PSVKD A KTT K EIT TK+EDEE FGNSKALNALFNGVD NVFKLIN
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLIN

A0A5D3CDY8 Gag-pol polyprotein2.2e-2273.08Show/hide
Query:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE
        M AFL S+D+ CWKSVLTG E PS+KD A KTT K EIT TKE DEE  GN +ALNALFNG++HNVFKLIN CTSAKE
Subjt:  MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTGCCTTTCTTAATTCAGTGGATAACATATGTTGGAAATCCGTTTTGACAGGATGGGAATCGCCTTCTGTTAAAGATGTTGCTAGCAAAACTACTCCGAAGCGTGA
GATTACCCGGACAAAGGAGGAAGATGAAGAATTGTTTGGAAATTCGAAGGCTCTAAATGCATTGTTCAATGGTGTGGACCATAATGTCTTCAAGCTTATTAACGCATGTA
CCTCAGCAAAAGAAGGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTGCCTTTCTTAATTCAGTGGATAACATATGTTGGAAATCCGTTTTGACAGGATGGGAATCGCCTTCTGTTAAAGATGTTGCTAGCAAAACTACTCCGAAGCGTGA
GATTACCCGGACAAAGGAGGAAGATGAAGAATTGTTTGGAAATTCGAAGGCTCTAAATGCATTGTTCAATGGTGTGGACCATAATGTCTTCAAGCTTATTAACGCATGTA
CCTCAGCAAAAGAAGGCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIAFLNSVDNICWKSVLTGWESPSVKDVASKTTPKREITRTKEEDEELFGNSKALNALFNGVDHNVFKLINACTSAKEG