; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0006841 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0006841
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionLYR motif-containing protein 2
Genome locationchr04:3376063..3377028
RNA-Seq ExpressionIVF0006841
SyntenyIVF0006841
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008011 - Complex 1 LYR protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063314.1 LYR motif-containing protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]2.60e-4798.77Show/hide
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XP_023535371.1 uncharacterized protein LOC111796833 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.75e-3477.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGK2 Uncharacterized protein6.3e-2582.72Show/hide
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A0A1S3CRB8 LYR motif-containing protein 21.4e-35100Show/hide
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A0A5A7V7X8 LYR motif-containing protein 25.1e-3598.77Show/hide
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A0A5D3E7B8 LYR motif-containing protein 21.4e-35100Show/hide
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A0A6J1F8N3 uncharacterized protein LOC1114433214.8e-2577.78Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G76065.1 LYR family of Fe/S cluster biogenesis protein8.1e-2572.37Show/hide
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        DL+ FILRARVLKLYRQ L+IA +APV  R EL+  +R+EMEKNR CND+QKIR+L+SEG+ER+K LDEMLDMQGH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTCTTCTCCCATGATTTACGTGAATTTATTCTTCGAGCAAGAGTGTTGAAACTGTATAGACAGGGTTTAAGAATAGCTCGGAAAGCACCTGTTGATGGTCGAGATGA
ATTGAGGCATATGATGAGAGAAGAAATGGAGAAGAACAGAAAGTGTAATGATAGACAGAAAATAAGATTTTTGTTGAGCGAAGGAATAGAGAGATTGAAGCAATTAGATG
AGATGTTGGATATGCAAGGCCATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAATCGGTCTTCCGTCGTTGAATCCTCAAAGAAATCGGAACCGAACGACAGAAATGATTATACCTCCGATTGAATCAAGCAGGGAATTCGCTTCATTTTAATCTGCAC
CATCAGTGTTATCCTCTTCATTTTCATCATTAAGAGAAATCGCGATGGTCTTCTCCCATGATTTACGTGAATTTATTCTTCGAGCAAGAGTGTTGAAACTGTATAGACAG
GGTTTAAGAATAGCTCGGAAAGCACCTGTTGATGGTCGAGATGAATTGAGGCATATGATGAGAGAAGAAATGGAGAAGAACAGAAAGTGTAATGATAGACAGAAAATAAG
ATTTTTGTTGAGCGAAGGAATAGAGAGATTGAAGCAATTAGATGAGATGTTGGATATGCAAGGCCATTAACTAGAGATCTTTCTTTTCTTTCTTTTTTATTAATTTTGAT
TATTGGGAGTTAAGTTTTTCTCCAATCATTTTGGAGTGTCTCATAGAAAGGAATGTTGTTTTAGGGGAAGGATATGAGTTTGGTTTAGGGCTTATCTTCAAGTTATTGTA
ATCAAATTGTGATTAAGGTACAAAGGAGTTATTAATTCCACTTCCCACATTATTTGTATCAGTTTGATTTTTATGTTAGGTTTTGAAATAAGAAACTGAAATCATCTAAA
ATTGAGATGAATATGTGGGATTATTGACTGAGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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