; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0006875 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0006875
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPMD domain-containing protein
Genome locationchr11:1953697..1954066
RNA-Seq ExpressionIVF0006875
SyntenyIVF0006875
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031667.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]2.00e-1776.36Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP
        MA T +EE+NEHK ESDSSK D HWKR LKKAKSPLN HLEGL+EL NDESL  P
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP

KAA0044959.1 hypothetical protein E6C27_scaffold74G002650 [Cucumis melo var. makuwa]1.04e-2181.82Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP
        M PT EEEV EHK ESDS+K DRHWKRPLKKAKSPLN+HLEGLIELG+DESL  P
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP

KAA0045646.1 hypothetical protein E6C27_scaffold243G001580 [Cucumis melo var. makuwa]8.72e-3997.1Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRR
        MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKL  RR
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRR

KAA0055543.1 hypothetical protein E6C27_scaffold222G00160 [Cucumis melo var. makuwa]1.96e-2284.62Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESL
        M PT EEEV EHK ESDSSK DRHWK+PLKKAKSPLNDHLEGLIELG+ ESL
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESL

TYK06377.1 hypothetical protein E5676_scaffold163G00690 [Cucumis melo var. makuwa]2.18e-1878.18Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP
        +A   +EEV EHK ESDSSK DRHWKRPLKKAKSPLND LEGLIELGNDES   P
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TU40 Uncharacterized protein4.3e-2897.1Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRR
        MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKL  RR
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRR

A0A5A7TUP1 Uncharacterized protein3.7e-1681.82Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP
        M PT EEEV EHK ESDS+K DRHWKRPLKKAKSPLN+HLEGLIELG+DESL  P
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP

A0A5A7UHZ1 Uncharacterized protein3.2e-1584.62Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESL
        M PT EEEV EHK ESDSSK DRHWK+PLKKAKSPLNDHLEGLIELG+ ESL
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESL

A0A5D3BZM5 Putative mitochondrial protein3.0e-1360.56Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRRLP
        MA T +EE+NEHK ESDSSK D HWKR LKKAKSPLN HLEGL+EL NDESL  P  +   + ++   + P
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRRLP

A0A5D3C3H5 PMD domain-containing protein2.1e-1478.18Show/hide
Query:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP
        +A   +EEV EHK ESDSSK DRHWKRPLKKAKSPLND LEGLIELGNDES   P
Subjt:  MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCTACCCGCGAGGAGGAGGTGAATGAACATAAAGGTGAGAGTGATAGCAGCAAAATTGATCGTCATTGGAAGAGACCTTTGAAGAAAGCGAAGTCACCTTTGAA
TGATCATCTTGAAGGACTTATAGAGCTAGGCAACGATGAATCTTTGATGGCACCCATGCAGTTGATTCAACCATTGAGGAAGTTGGTACCTCGAAGACTCCCATCGGTAA
ACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTCCTACCCGCGAGGAGGAGGTGAATGAACATAAAGGTGAGAGTGATAGCAGCAAAATTGATCGTCATTGGAAGAGACCTTTGAAGAAAGCGAAGTCACCTTTGAA
TGATCATCTTGAAGGACTTATAGAGCTAGGCAACGATGAATCTTTGATGGCACCCATGCAGTTGATTCAACCATTGAGGAAGTTGGTACCTCGAAGACTCCCATCGGTAA
ACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPTREEEVNEHKGESDSSKIDRHWKRPLKKAKSPLNDHLEGLIELGNDESLMAPMQLIQPLRKLVPRRLPSVN