; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0006970 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0006970
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionAlanine--tRNA ligase
Genome locationchr01:16518096..16523859
RNA-Seq ExpressionIVF0006970
SyntenyIVF0006970
Gene Ontology termsGO:0006400 - tRNA modification (biological process)
GO:0070143 - mitochondrial alanyl-tRNA aminoacylation (biological process)
GO:0106074 - aminoacyl-tRNA metabolism involved in translational fidelity (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0000049 - tRNA binding (molecular function)
GO:0002161 - aminoacyl-tRNA editing activity (molecular function)
GO:0004813 - alanine-tRNA ligase activity (molecular function)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
GO:0016597 - amino acid binding (molecular function)
InterPro domainsIPR018163 - Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily
IPR018165 - Alanyl-tRNA synthetase, class IIc, core domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052760.1 alanine--tRNA ligase [Cucumis melo var. makuwa]1.05e-8796.03Show/hide
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KAG7018049.1 Alanine--tRNA ligase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.87e-8692.72Show/hide
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TYK04196.1 alanine--tRNA ligase [Cucumis melo var. makuwa]3.78e-8896.03Show/hide
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XP_022153158.1 alanine--tRNA ligase-like [Momordica charantia]2.78e-8891.39Show/hide
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XP_038903822.1 alanine--tRNA ligase [Benincasa hispida]8.01e-8794.04Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEP6 Alanine--tRNA ligase2.9e-7393.38Show/hide
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A0A5A7UC57 Alanine--tRNA ligase2.3e-7596.03Show/hide
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A0A5D3C1B3 Alanine--tRNA ligase2.3e-7596.03Show/hide
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A0A6J1F2W2 Alanine--tRNA ligase2.2e-7392.72Show/hide
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A0A6J1J7W9 Alanine--tRNA ligase9.8e-7493.38Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O13914 Alanine--tRNA ligase1.3e-3046.62Show/hide
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        +  D L  +E+  N +I+D L V +KEV L++AK INGLRAVFGE  P
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P36428 Alanine--tRNA ligase1.4e-6476.82Show/hide
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        G  IFDTG++EGSFG+F VCNVQIFGGF++HIG  +  +G +S+GDKVICKVDYERR LIAPNHTCTHMLN+AL+E+LG+H+DQKGSIVLPEKLRFDFSH
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P40825 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial6.6e-3553.38Show/hide
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        V  ++L+K+E I N+ I++ L V  KE+ L  AK I+G+RAVFGE  P
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Q54Y20 Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic2.8e-3348.05Show/hide
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        G  I+D G    ++    +F V + ++FGG+++HIG  +     + +GD+V   VDY RR+ I  NHT THM+N+AL+ ILG+ +DQ+GS V  ++ RFD
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Q5A8K2 Alanine--tRNA ligase1.9e-3452.35Show/hide
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         V   +L KIE+I NK I++   V  K+V+L +AK INGLRAVFGE  P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50200.1 Alanyl-tRNA synthetase9.7e-6676.82Show/hide
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AT1G50200.2 Alanyl-tRNA synthetase9.7e-6676.82Show/hide
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        G  IFDTG++EGSFG+F VCNVQIFGGF++HIG  +  +G +S+GDKVICKVDYERR LIAPNHTCTHMLN+AL+E+LG+H+DQKGSIVLPEKLRFDFSH
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AT5G22800.1 Alanyl-tRNA synthetase, class IIc4.9e-1734.09Show/hide
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        SG  I D G L  S    Q      V +VQ      VH G+    SG + +G +V   VD + R     +HT TH+L  AL++++G    Q GS+V  ++
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        LRFDF+  + +  ++L +IE ++N+ I D   +  K + LA+AKR  G  A+FGE   +   NE R + +  +S E
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAAATATAGTCGCCAACGCGTGTGAACTCGTCGCCGTGCTATCATCGGAGGCAGCTTCTTCCGTTGCCGCATCGCGCTCGTGCCTCACGTGGAACACTCACCCTCC
TCACCACCGGCACGTTACCGGCTCGGGATGTCCGATTTTTGATACTGGAATACTTGAAGGTTCCTTTGGTTCATTTCAAGTATGCAATGTTCAAATATTTGGAGGTTTCA
TCGTACATATTGGCTCATTTAATGGTGGAAGCGGCAGAATTTCTCTGGGTGACAAAGTTATTTGTAAGGTCGACTATGAGCGACGTACGCTTATTGCTCCAAATCATACT
TGTACGCATATGTTGAATTTTGCTCTTAGGGAAATTCTTGGAAACCACGTTGACCAGAAGGGTTCAATCGTTCTTCCTGAAAAACTGCGATTTGATTTTTCTCATGGCAA
GCCAGTGGACCCTGATGATTTGAGAAAAATAGAATCAATTGTCAACAAACTAATAGAAGATGAACTGGACGTAAATGCTAAGGAGGTAACTCTTGCTGAAGCAAAGCGTA
TTAATGGGCTACGAGCTGTCTTTGGAGAACGTGGTCCAAGGTGTCCTCATAATGAGGCTAGGGACATATGGCTGAAGTTTTTATCTGCTGAACGTGTCTTACCTTTTGGC
TGCAAAGGAGTTATCACTAAACAAATGACTGCAATAGAAGAAATGGTTGCAAGTGAGTACAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAAATATAGTCGCCAACGCGTGTGAACTCGTCGCCGTGCTATCATCGGAGGCAGCTTCTTCCGTTGCCGCATCGCGCTCGTGCCTCACGTGGAACACTCACCCTCC
TCACCACCGGCACGTTACCGGCTCGGGATGTCCGATTTTTGATACTGGAATACTTGAAGGTTCCTTTGGTTCATTTCAAGTATGCAATGTTCAAATATTTGGAGGTTTCA
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TGTACGCATATGTTGAATTTTGCTCTTAGGGAAATTCTTGGAAACCACGTTGACCAGAAGGGTTCAATCGTTCTTCCTGAAAAACTGCGATTTGATTTTTCTCATGGCAA
GCCAGTGGACCCTGATGATTTGAGAAAAATAGAATCAATTGTCAACAAACTAATAGAAGATGAACTGGACGTAAATGCTAAGGAGGTAACTCTTGCTGAAGCAAAGCGTA
TTAATGGGCTACGAGCTGTCTTTGGAGAACGTGGTCCAAGGTGTCCTCATAATGAGGCTAGGGACATATGGCTGAAGTTTTTATCTGCTGAACGTGTCTTACCTTTTGGC
TGCAAAGGAGTTATCACTAAACAAATGACTGCAATAGAAGAAATGGTTGCAAGTGAGTACAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSNIVANACELVAVLSSEAASSVAASRSCLTWNTHPPHHRHVTGSGCPIFDTGILEGSFGSFQVCNVQIFGGFIVHIGSFNGGSGRISLGDKVICKVDYERRTLIAPNHT
CTHMLNFALREILGNHVDQKGSIVLPEKLRFDFSHGKPVDPDDLRKIESIVNKLIEDELDVNAKEVTLAEAKRINGLRAVFGERGPRCPHNEARDIWLKFLSAERVLPFG
CKGVITKQMTAIEEMVASEYN