; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0007022 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0007022
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTransaldolase
Genome locationchr09:21085073..21090599
RNA-Seq ExpressionIVF0007022
SyntenyIVF0007022
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR001585 - Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
IPR004730 - Transaldolase type 1
IPR013785 - Aldolase-type TIM barrel


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039687.1 transaldolase [Cucumis melo var. makuwa]7.51e-286100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A1S414 Transaldolase8.8e-4834.23Show/hide
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        DAR+++D    I K H L++LY E  +   R+L K+ +TW+GI A++ LE+EGI  +LT ++SFAQA A A+AG  +I  FVGR+ DW +  +G      
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          +  EDPG+  VT  YNY  ++GY++ +M A+ RN  ++  L G D +     +L+ +  S T        +RKL+P +   A   + SE E  +W+  
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                 A++ LA G+  +A    ++EE+ +
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B0UV30 Transaldolase3.2e-5035.84Show/hide
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        +T++LDA+ + + +V DT   D  +++ P  AT + SL+L    LP   +   +D A+A ++    D  +       +K  VN+G ++ ++VPGR+STEV
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        DAR++YDT   + K   L+ LYNE  +  +R+L KI +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + +S   E   
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        A    EDPG+  VTK YNY  +YGY + +M A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+ T      + +RKL+ +     + ++ +     Q    
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            P A++ LA+G+  +A DQ K  + L EK
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P45055 Transaldolase3.3e-4735.15Show/hide
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        +T++LD++ + + +V DT   D  +++ P  AT + SL+L    LP   +   +D A+A ++    D  +       +K  VN+G ++ ++VPGR+STEV
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        DAR++YDT   + K   L+ LYN   +  +R+L KI +TWQGI A+ +LE EGI  +LT ++S AQA A A+AG  +I  FVGR+ DW + +S   E   
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        A    EDPG+  VTK YNY  +YGY + +M A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+ T    K  Y    K  PQ      F       W   S
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         A      A++ LA G+  +A   +++E +
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Q0I1U0 Transaldolase4.2e-5035.84Show/hide
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        A    EDPG+  VTK YNY  +YGY + +M A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+E+ T      + +RKL  +     + ++ +     Q    
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            P A++ LA+G+  +A DQ K  + L EK
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Q65PZ8 Transaldolase3.3e-4733.54Show/hide
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             EDPG+  VT  YNY  +YGY++ +M A+ RN  ++  L G D +     +L+ L+ES      K  +  ++ P+ A     +E +   W+     
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            P A+  LA G+  +A   +++E +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12230.1 Aldolase superfamily protein3.4e-16471.67Show/hide
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        M  SLQSPP AT+  S+              +P P+ +  L+R +        P IL S S       S+SS  SSS++ G  +EL+AVS+FS+IVPDTV
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Query:  VFDDFERFPPTAATVSSSLLLGICGLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLARLVPGRVSTEVDARVAYDTHGIIRKVHDLL
        VFDDFERFPPTAATVSS+LLLGICGLPDTIFRNAVDMALADS C GL+  E + SC FNKA+VNVGGDL +LVPGRVSTEVDAR+AYDT+GIIRKVHDLL
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Query:  KLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRGEDPGLALVTKAYNY
        +LYNEI+VP +RLLFKIPATWQGIEA+RLLESEGIQTH+TFVYSFAQAAAA+QAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGD EIE+A+K GEDPGLALV ++YNY
Subjt:  KLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRGEDPGLALVTKAYNY

Query:  IHKYGYRSKLMAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFSEDEVKKWDQLSLASGMGPAALQLLANGLEGY
        IHKYGY+SKLMAAAVRNKQDLFSLLGVDY+IAPLKVLQSLK+S   PDD KYSF+RKL+P++A +Y F+  E+ KWDQLSLAS MGPA+++LL+ G+EGY
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Query:  ADQTKRVEELFEKIWPPPNV
        A+Q KRVEELF KIWPPPNV
Subjt:  ADQTKRVEELFEKIWPPPNV

AT1G12230.2 Aldolase superfamily protein5.1e-16067.87Show/hide
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        M  SLQSPP AT+  S+              +P P+ +  L+R +        P IL S S       S+SS  SSS++ G  +EL+AVS+FS+IVPDTV
Subjt:  MSFSLQSPPSATIPPSL--------------SPSPSSSSFLQRKLGFSAGLFTPSILISHSPTSLPLTSASSGFSSSIDTGLTSELDAVSSFSQIVPDTV

Query:  VFDDFE----------------------RFPPTAATVSSSLLLGICGLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLARLVPGRVS
        VFDDFE                      +FPPTAATVSS+LLLGICGLPDTIFRNAVDMALADS C GL+  E + SC FNKA+VNVGGDL +LVPGRVS
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Query:  TEVDARVAYDTHGIIRKVHDLLKLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPE
        TEVDAR+AYDT+GIIRKVHDLL+LYNEI+VP +RLLFKIPATWQGIEA+RLLESEGIQTH+TFVYSFAQAAAA+QAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGD E
Subjt:  TEVDARVAYDTHGIIRKVHDLLKLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEGIQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPE

Query:  IEAALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGYRSKLMAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFSEDEVKKWDQ
        IE+A+K GEDPGLALV ++YNYIHKYGY+SKLMAAAVRNKQDLFSLLGVDY+IAPLKVLQSLK+S   PDD KYSF+RKL+P++A +Y F+  E+ KWDQ
Subjt:  IEAALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGYRSKLMAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESVTTPDD-KYSFIRKLSPQSAANYIFSEDEVKKWDQ

Query:  LSLASGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVEELFEKIWPPPNV
        LSLAS MGPA+++LL+ G+EGYA+Q KRVEELF KIWPPPNV
Subjt:  LSLASGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVEELFEKIWPPPNV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCATTCTCTTTGCAATCTCCGCCATCTGCGACCATTCCCCCGTCGCTGTCGCCGTCGCCCTCCTCCTCTTCCTTCCTTCAGAGAAAATTGGGGTTCTCGGCTGGATT
ATTCACACCCTCCATTCTAATTTCCCATTCCCCTACATCTCTTCCTTTAACTTCTGCTTCCTCCGGCTTCTCCTCTTCCATCGACACTGGGTTGACATCTGAGTTAGACG
CTGTTTCTAGCTTCAGTCAGATCGTTCCTGACACCGTCGTTTTTGACGATTTCGAGAGGTTTCCTCCTACTGCTGCTACTGTTAGCTCTTCTCTCCTTCTGGGCATATGT
GGCCTTCCTGATACCATATTTAGAAATGCGGTTGATATGGCGTTGGCCGATTCTGAATGTTTTGGGCTAGACAACCCCGAATTGAAATATTCCTGTATTTTTAACAAGGC
TCTAGTAAATGTTGGTGGTGATTTGGCAAGACTAGTTCCTGGACGTGTTTCAACTGAGGTGGATGCGCGTGTTGCGTATGATACGCATGGCATTATCAGAAAGGTGCATG
ACCTGCTGAAATTGTACAATGAAATCAATGTTCCTCCTGAGCGGTTGTTGTTCAAAATTCCGGCAACTTGGCAGGGTATTGAGGCCTCAAGATTGTTGGAATCAGAGGGA
ATACAGACACATTTGACTTTTGTATATAGCTTTGCCCAAGCAGCAGCTGCAGCTCAAGCTGGTGCCTCTGTCATTCAGATTTTTGTTGGTCGTCTACGTGATTGGGCTCG
GAATCACTCTGGTGACCCTGAAATAGAAGCTGCACTTAAAAGAGGAGAGGATCCTGGGCTGGCTTTGGTGACAAAGGCTTACAACTACATTCACAAATATGGATACAGAT
CAAAGTTGATGGCAGCAGCAGTTAGAAATAAGCAAGATTTATTCAGTCTTCTGGGCGTGGATTACATCATTGCTCCATTGAAGGTATTGCAGTCCCTTAAAGAATCAGTT
ACCACTCCGGATGATAAGTACTCTTTTATTAGGAAACTCTCTCCACAGTCTGCAGCTAATTACATTTTCAGTGAGGACGAGGTAAAAAAATGGGACCAATTAAGCCTTGC
ATCAGGAATGGGGCCTGCAGCTTTGCAGCTGCTTGCTAATGGATTGGAAGGTTATGCTGACCAAACAAAGCGAGTTGAGGAACTTTTCGAGAAGATTTGGCCACCCCCAA
ATGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAAAACCGGCAGTTTTAGAGTAATGAAGTGAAATAGAGATATATTTATTTCATCTCAATCTCAATTAACGGTCTTTCACTCACTCACTCACTCCCATTTCCAATTCCA
AATGTCATTCTCTTTGCAATCTCCGCCATCTGCGACCATTCCCCCGTCGCTGTCGCCGTCGCCCTCCTCCTCTTCCTTCCTTCAGAGAAAATTGGGGTTCTCGGCTGGAT
TATTCACACCCTCCATTCTAATTTCCCATTCCCCTACATCTCTTCCTTTAACTTCTGCTTCCTCCGGCTTCTCCTCTTCCATCGACACTGGGTTGACATCTGAGTTAGAC
GCTGTTTCTAGCTTCAGTCAGATCGTTCCTGACACCGTCGTTTTTGACGATTTCGAGAGGTTTCCTCCTACTGCTGCTACTGTTAGCTCTTCTCTCCTTCTGGGCATATG
TGGCCTTCCTGATACCATATTTAGAAATGCGGTTGATATGGCGTTGGCCGATTCTGAATGTTTTGGGCTAGACAACCCCGAATTGAAATATTCCTGTATTTTTAACAAGG
CTCTAGTAAATGTTGGTGGTGATTTGGCAAGACTAGTTCCTGGACGTGTTTCAACTGAGGTGGATGCGCGTGTTGCGTATGATACGCATGGCATTATCAGAAAGGTGCAT
GACCTGCTGAAATTGTACAATGAAATCAATGTTCCTCCTGAGCGGTTGTTGTTCAAAATTCCGGCAACTTGGCAGGGTATTGAGGCCTCAAGATTGTTGGAATCAGAGGG
AATACAGACACATTTGACTTTTGTATATAGCTTTGCCCAAGCAGCAGCTGCAGCTCAAGCTGGTGCCTCTGTCATTCAGATTTTTGTTGGTCGTCTACGTGATTGGGCTC
GGAATCACTCTGGTGACCCTGAAATAGAAGCTGCACTTAAAAGAGGAGAGGATCCTGGGCTGGCTTTGGTGACAAAGGCTTACAACTACATTCACAAATATGGATACAGA
TCAAAGTTGATGGCAGCAGCAGTTAGAAATAAGCAAGATTTATTCAGTCTTCTGGGCGTGGATTACATCATTGCTCCATTGAAGGTATTGCAGTCCCTTAAAGAATCAGT
TACCACTCCGGATGATAAGTACTCTTTTATTAGGAAACTCTCTCCACAGTCTGCAGCTAATTACATTTTCAGTGAGGACGAGGTAAAAAAATGGGACCAATTAAGCCTTG
CATCAGGAATGGGGCCTGCAGCTTTGCAGCTGCTTGCTAATGGATTGGAAGGTTATGCTGACCAAACAAAGCGAGTTGAGGAACTTTTCGAGAAGATTTGGCCACCCCCA
AATGTATGAAACCCTTGGCCTTTGGTATTTACAAAAATGTTGCTTTTTCATGAATAAGAGCTGGTGAGTGGTTTGTGTCTGAATACTCTAATAAATTCTGTTCTATAACT
CCTGCTTTTCTGGTTCCACTTAATGATAGAAAGTGTATGTTATATAATCTTTCGTTTCAACTTTCTGTTTTGAAGAAATTATTGAAAGTGGCTACCCACTCTAGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSFSLQSPPSATIPPSLSPSPSSSSFLQRKLGFSAGLFTPSILISHSPTSLPLTSASSGFSSSIDTGLTSELDAVSSFSQIVPDTVVFDDFERFPPTAATVSSSLLLGIC
GLPDTIFRNAVDMALADSECFGLDNPELKYSCIFNKALVNVGGDLARLVPGRVSTEVDARVAYDTHGIIRKVHDLLKLYNEINVPPERLLFKIPATWQGIEASRLLESEG
IQTHLTFVYSFAQAAAAAQAGASVIQIFVGRLRDWARNHSGDPEIEAALKRGEDPGLALVTKAYNYIHKYGYRSKLMAAAVRNKQDLFSLLGVDYIIAPLKVLQSLKESV
TTPDDKYSFIRKLSPQSAANYIFSEDEVKKWDQLSLASGMGPAALQLLANGLEGYADQTKRVEELFEKIWPPPNV