; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0007400 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0007400
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSec-independent protein translocase protein TATB
Genome locationchr06:571934..577236
RNA-Seq ExpressionIVF0007400
SyntenyIVF0007400
Gene Ontology termsGO:0009409 - response to cold (biological process)
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GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0033281 - TAT protein transport complex (cellular component)
GO:0009977 - proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003369 - Sec-independent protein translocase protein TatA/B/E


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK22976.1 sec-independent protein translocase protein TATB [Cucumis melo var. makuwa]9.88e-176100Show/hide
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XP_031738311.1 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]3.37e-14986.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6M5 Uncharacterized protein2.7e-11787.02Show/hide
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A0A1S3AYD4 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X21.4e-12997.03Show/hide
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A0A1S3AYF5 sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic isoform X13.9e-13297.77Show/hide
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A0A5A7SWY3 Sec-independent protein translocase protein TATB3.9e-13297.77Show/hide
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A0A5D3DH86 Sec-independent protein translocase protein TATB6.9e-137100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48950 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic2.6e-3250.26Show/hide
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Q2R237 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic1.9e-3563.97Show/hide
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         +++ ++ + +DD   A+  Y+SEE +KVTEEQL A
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Q8DJ44 Sec-independent protein translocase protein TatA3.1e-0954.1Show/hide
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Q94G16 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic2.4e-4652Show/hide
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        VIGVVALLVFGPKGLAEVAR LGKTLR FQPTIRE+QDVSREFK+TLEREIG+D+I + + S+Y+++ ++T   P +         A   +     SKAY
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Q9XH75 Sec-independent protein translocase protein TATB, chloroplastic5.6e-4350Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G28750.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1065.1e-0737.21Show/hide
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AT5G52440.1 Bacterial sec-independent translocation protein mttA/Hcf1064.0e-4450Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTCCAAAATTTCAGTTTCGACATTCCCATTTTCCCCATCATCTACTTGCTCAAGACTTTCACCTTCCACTTCCTTTTCCATCTTATACCCCAGAACCCCCAAATT
TCATCTCTCCTTGTGTAATTTCCCACTGGGTCTCCGCCTTTTCTCTCCGTGGACTGGTTTAAAGCACTTGGGTATTTCTACCAGAGGAAGGTCTCCGTTTCCCGAGAGAA
GGAAGAGAATTCCTAAGGGGAAAGCAGTTTTTGCATCTTTGTTTGGGGTTGGAGCTCCCGAAGCACTGGTTATTGGGGTTGTGGCTTTGTTAGTTTTTGGTCCCAAGGGA
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TGGTCTCGATGAAATTGAGAGTTCAGTTAACAGCTCATACAATGCAAGCAAATCTACCTACTCAAACCCACCTTCTGTTTATAAAGCAGAAGAGCTTTCAGTGGCTGAAC
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GGATGTGATACAAAATGTTGTTTAGGTGGGCAATTAGAAAATGTGTTGAGTGTTTAATTTATCAGTGTCTTGGAACGGTAATTAGTTTCTAGGCATTGGATAAGATGATT
TTGTTGGATTACTACTAATTAGAATTCCTTCCTCATTTCATATTAATATCTTCCACGGATTTTGGTTAGCTTATATAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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