; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0007601 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0007601
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionLINE-1 retrotransposable element ORF2 protein
Genome locationchr11:30196372..30197047
RNA-Seq ExpressionIVF0007601
SyntenyIVF0007601
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR000477 - Reverse transcriptase domain
IPR043502 - DNA/RNA polymerase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0039950.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]1.22e-114100Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

KAA0041397.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]6.70e-10490.5Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLS LL NLA+K KINGV F PNLNLTHILFADDILIFVED++DYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRA SI DSWGISKG LPT+
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        YLGMPLGG+PSSSNFWDN+LQKIQKKLS+WKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQ+SVFKVPKGIAQKIEA WRNFLWN
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

KAA0044556.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]1.30e-10490.5Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLS LL NLA+K KINGV F PNLNLTHILFADDILIFVED++DYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRA SI DSWGISKG LPT+
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        YLGMPLGG+PSSSNFWDN+LQKIQKKLS+WKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQ+SVFKVPKGIAQKIEA WRNFLWN
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

TYJ99326.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]7.67e-12988.84Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLSRLLNNLADK KINGV F PNLNLTHILFADDILIFVED+DDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVP DRA SIADSWGISKGHLPTS
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN-----------DGTKLSPQKR
        YLGMPLGG+PSSSNFWDNVLQKIQKKLS+WKYSQLSKG RITLINSTLESLPIYQ+SVFKVPKGIAQKIEA WRNFLWN           DGTKLSPQKR
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN-----------DGTKLSPQKR

Query:  KEASAFTLSIAQTLPSSVNGYGNS
        KEAS FTLSIAQ LPSSVNG+GNS
Subjt:  KEASAFTLSIAQTLPSSVNGYGNS

TYK29578.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]5.17e-9993.9Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLSRLLNNLADKRKINGV FSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTD AKSIADSWGISKGHLPTS
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKG
        YLGMPLGG+PSSSNFWDNVLQKIQKKLS+WKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQ  ++KV  G
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T9I7 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein5.6e-97100Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

A0A5A7TIB8 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein8.1e-8890.5Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLS LL NLA+K KINGV F PNLNLTHILFADDILIFVED++DYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRA SI DSWGISKG LPT+
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        YLGMPLGG+PSSSNFWDN+LQKIQKKLS+WKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQ+SVFKVPKGIAQKIEA WRNFLWN
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

A0A5A7TR15 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein8.1e-8890.5Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLS LL NLA+K KINGV F PNLNLTHILFADDILIFVED++DYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRA SI DSWGISKG LPT+
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        YLGMPLGG+PSSSNFWDN+LQKIQKKLS+WKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQ+SVFKVPKGIAQKIEA WRNFLWN
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

A0A5A7TSA7 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein1.1e-7993.9Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLSRLLNNLADKRKINGV FSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTD AKSIADSWGISKGHLPTS
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKG
        YLGMPLGG+PSSSNFWDNVLQKIQKKLS+WKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQ  ++KV  G
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKG

A0A5D3BJP3 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein6.6e-10688.84Show/hide
Query:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS
        MDYLSRLLNNLADK KINGV F PNLNLTHILFADDILIFVED+DDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVP DRA SIADSWGISKGHLPTS
Subjt:  MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTS

Query:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN-----------DGTKLSPQKR
        YLGMPLGG+PSSSNFWDNVLQKIQKKLS+WKYSQLSKG RITLINSTLESLPIYQ+SVFKVPKGIAQKIEA WRNFLWN           DGTKLSPQKR
Subjt:  YLGMPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWN-----------DGTKLSPQKR

Query:  KEASAFTLSIAQTLPSSVNGYGNS
        KEAS FTLSIAQ LPSSVNG+GNS
Subjt:  KEASAFTLSIAQTLPSSVNGYGNS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O00370 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein1.0e-0724.86Show/hide
Query:  LSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTSYLG
        L  L   +  +++I G++      +   LFADD+++++E+      NL  ++  F   SG  IN+ KS  F  N        I      +       YLG
Subjt:  LSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTSYLG

Query:  MPLGGRPSSSNFWDN---VLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSV--FKVPKGIAQKIEASWRNFLWN
        + L  R     F +N   +L++I++  + WK    S  GRI ++   +    IY+ +    K+P     ++E +   F+WN
Subjt:  MPLGGRPSSSNFWDN---VLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSV--FKVPKGIAQKIEASWRNFLWN

P08548 LINE-1 reverse transcriptase homolog1.4e-0724.27Show/hide
Query:  LADKRKINGVKF-SPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTSYLGMPL--G
        + +++ I G+   S  + L+  LFADD+++++E+  D  + L  ++  + + SG  IN  KS  F         K++ DS   +       YLG+ L   
Subjt:  LADKRKINGVKF-SPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTSYLGMPL--G

Query:  GRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSV--FKVPKGIAQKIEASWRNFLWNDGTKLSPQKRKEASAFTLSIAQTLPS
         +      ++ + ++I + ++ WK    S  GRI ++  ++    IY  +    K P    + +E    +F+WN       QK+ +       IA+TL S
Subjt:  GRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSV--FKVPKGIAQKIEASWRNFLWNDGTKLSPQKRKEASAFTLSIAQTLPS

Query:  SVNGYG
        + N  G
Subjt:  SVNGYG

P0C2F6 Putative ribonuclease H protein At1g657503.9e-0727.38Show/hide
Query:  MPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWNDGTKLSPQ
        MP+  +  + + +  +L+++  ++S W+   LS  GR+TL  + L S+P++ MS   +P+ I  +++   R FLW    +   Q
Subjt:  MPLGGRPSSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWNDGTKLSPQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACTATCTCAGCCGTCTGTTGAACAACTTAGCAGATAAAAGAAAAATCAATGGAGTCAAATTCAGTCCCAACCTTAATCTTACCCACATCCTATTTGCGGATGACAT
CCTCATCTTTGTAGAGGATAGGGATGACTATGTATCAAACCTCAAAATGATCCTTCATCTCTTTGAATCAGCCTCGGGCCTTAACATCAACTTATCCAAGTCTACTATCT
TTCCCATAAACGTACCAACAGATCGTGCAAAGTCTATAGCGGACAGCTGGGGAATAAGCAAGGGCCATCTTCCAACATCTTACCTTGGTATGCCCTTAGGAGGGAGGCCT
TCCTCATCAAACTTCTGGGACAATGTGCTTCAAAAAATCCAGAAAAAATTGAGCAACTGGAAATATTCTCAGTTATCCAAAGGCGGCAGAATCACTCTGATAAACTCAAC
TCTTGAAAGTCTCCCCATATATCAAATGTCGGTCTTCAAGGTTCCCAAAGGTATAGCTCAGAAAATTGAAGCTTCTTGGAGAAATTTCCTTTGGAATGATGGAACCAAAT
TGTCTCCCCAAAAGAGAAAGGAGGCCTCGGCATTCACTCTGTCAATAGCACAAACTTTGCCCTCCTCTGTAAATGGCTATGGAAATTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACTATCTCAGCCGTCTGTTGAACAACTTAGCAGATAAAAGAAAAATCAATGGAGTCAAATTCAGTCCCAACCTTAATCTTACCCACATCCTATTTGCGGATGACAT
CCTCATCTTTGTAGAGGATAGGGATGACTATGTATCAAACCTCAAAATGATCCTTCATCTCTTTGAATCAGCCTCGGGCCTTAACATCAACTTATCCAAGTCTACTATCT
TTCCCATAAACGTACCAACAGATCGTGCAAAGTCTATAGCGGACAGCTGGGGAATAAGCAAGGGCCATCTTCCAACATCTTACCTTGGTATGCCCTTAGGAGGGAGGCCT
TCCTCATCAAACTTCTGGGACAATGTGCTTCAAAAAATCCAGAAAAAATTGAGCAACTGGAAATATTCTCAGTTATCCAAAGGCGGCAGAATCACTCTGATAAACTCAAC
TCTTGAAAGTCTCCCCATATATCAAATGTCGGTCTTCAAGGTTCCCAAAGGTATAGCTCAGAAAATTGAAGCTTCTTGGAGAAATTTCCTTTGGAATGATGGAACCAAAT
TGTCTCCCCAAAAGAGAAAGGAGGCCTCGGCATTCACTCTGTCAATAGCACAAACTTTGCCCTCCTCTGTAAATGGCTATGGAAATTCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDYLSRLLNNLADKRKINGVKFSPNLNLTHILFADDILIFVEDRDDYVSNLKMILHLFESASGLNINLSKSTIFPINVPTDRAKSIADSWGISKGHLPTSYLGMPLGGRP
SSSNFWDNVLQKIQKKLSNWKYSQLSKGGRITLINSTLESLPIYQMSVFKVPKGIAQKIEASWRNFLWNDGTKLSPQKRKEASAFTLSIAQTLPSSVNGYGNS