| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004135834.1 probable histone H2A variant 3 isoform X2 [Cucumis sativus] | 3.18e-84 | 100 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_010033915.1 probable histone H2A variant 3 [Eucalyptus grandis] | 5.28e-83 | 98.51 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+N+KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022152569.1 probable histone H2A variant 3 [Momordica charantia] | 9.11e-84 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022953233.1 probable histone H2A variant 3 [Cucurbita moschata] | 2.61e-83 | 98.51 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_031406453.1 probable histone H2A variant 3 [Punica granatum] | 9.57e-81 | 98.51 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K6F6 Histone H2A | 3.0e-64 | 100 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A1S3CF35 Histone H2A | 3.0e-64 | 100 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A5D3CH66 Histone H2A | 3.0e-64 | 100 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1DGE3 Histone H2A | 6.7e-64 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1JQN2 Histone H2A | 1.5e-63 | 98.51 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23628 Histone H2A variant 1 | 5.3e-58 | 85.29 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANN--KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K+ A N KDKDKKKP+SRS+RAG+QFPVGR+HRQLK+RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANN--KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q84MP7 Probable histone H2A variant 3 | 9.9e-57 | 86.13 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAA---NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
M+GKG KGL+ K+ A KDK KK PVSRSSRAGLQFPVGR+HRQLK R ANGRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAA---NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
Query: LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8H7Y8 Probable histone H2A variant 1 | 9.9e-57 | 86.23 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAA---NNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
M+GKG KGL+ K+ A +KDKDKKK PVSRSSRAGLQFPVGR+HRQLKSR +A+GRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAA---NNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
Query: QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK+SKE
Subjt: QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8S857 Probable histone H2A variant 2 | 3.4e-57 | 85.61 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKS----AANNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
M+GKG KGL+ K+ AA +KDKD+KK PVSRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+ANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
Subjt: MSGKGAKGLIMGKS----AANNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
Query: LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q9C944 Probable histone H2A variant 3 | 4.3e-60 | 89.55 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGK + ++KDKDKKKP++RSSRAGLQFPVGRVHR LK+R A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G52740.1 histone H2A protein 9 | 3.1e-61 | 89.55 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGK + ++KDKDKKKP++RSSRAGLQFPVGRVHR LK+R A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.1 histone H2A 8 | 1.7e-56 | 83.09 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +AA NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.2 histone H2A 8 | 1.7e-56 | 83.09 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +AA NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.3 histone H2A 8 | 1.7e-56 | 83.09 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +AA NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SAANNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT3G54560.1 histone H2A 11 | 3.7e-59 | 85.29 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSAANN--KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K+ A N KDKDKKKP+SRS+RAG+QFPVGR+HRQLK+RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSAANN--KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
