; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0007693 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0007693
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPolyprotein
Genome locationchr04:20423498..20424109
RNA-Seq ExpressionIVF0007693
SyntenyIVF0007693
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0033915.1 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]1.39e-11986.7Show/hide
Query:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
        MK DK++TLT  E   LPRVDPNRPI+QPNSLDIKL GSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNF MG+LNTISYDS KILPIK+YNT+MKN
Subjt:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN

Query:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG
        HYK+PSPPDLG DDLR DFRSFD NNIETWNIDGCSEGQM IIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALT GFTGNLRSWWHNHLTD NREAIKDA+LEK  
Subjt:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG

Query:  TRP
          P
Subjt:  TRP

KAA0049723.1 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]8.72e-11484.26Show/hide
Query:  KETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKNHYKKP
        K+TL P E  GLPRVDPN+PI+QPNSLDIKLKGSSTDELL+ELTRKLSET ISKE+  TSSK+E+SNFGMG+LNTISYDS K  PIKVYNTNMKNHYK+P
Subjt:  KETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKNHYKKP

Query:  SPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNGTR
        SPPDLGWDDLR DFRSFD NNIETWNIDGCSEGQM IIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALT GFTGNLR+WWHN LTD NREA+K+ VLEK  TR
Subjt:  SPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNGTR

KAA0068152.1 hypothetical protein E6C27_scaffold238G001190 [Cucumis melo var. makuwa]1.50e-117100Show/hide
Query:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
        MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
Subjt:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN

Query:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRS
        HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRS
Subjt:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRS

TYK21071.1 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]6.15e-145100Show/hide
Query:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
        MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
Subjt:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN

Query:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG
        HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG
Subjt:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG

Query:  TRP
        TRP
Subjt:  TRP

TYK22191.1 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]5.71e-8568.14Show/hide
Query:  MKLDKK-ETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMK
        MK DK  + L   E  GLP+V PNRPI+QPN LDIKLK SSTDEL+EELTRKLSET I                        +YDS KILPIKVYNT+MK
Subjt:  MKLDKK-ETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMK

Query:  NHYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKN
        NHYK+PSPPDL  DDL  DFRSFD NNIETWN++ C EGQM II QEMFVAATSYLRRMSQ+EI+DALT GFTGNLRSWWHNHLTD NREAIK+AVLEK 
Subjt:  NHYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKN

Query:  GTRP
           P
Subjt:  GTRP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SXJ8 Polyprotein1.4e-9286.7Show/hide
Query:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
        MK DK++TLT  E   LPRVDPNRPI+QPNSLDIKL GSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNF MG+LNTISYDS KILPIK+YNT+MKN
Subjt:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN

Query:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG
        HYK+PSPPDLG DDLR DFRSFD NNIETWNIDGCSEGQM IIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALT GFTGNLRSWWHNHLTD NREAIKDA+LEK  
Subjt:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG

Query:  TRP
          P
Subjt:  TRP

A0A5A7VII9 Uncharacterized protein7.2e-94100Show/hide
Query:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
        MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
Subjt:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN

Query:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRS
        HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRS
Subjt:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRS

A0A5D3CLG3 Polyprotein7.0e-8983.84Show/hide
Query:  KKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKNHYKK
        +K+TL P E  GLPRVDPN+PI+QPNSLDIKLKGSSTDELL+ELTRKLSET ISKE+  TSSK+E+SNFGMG+LNTISYDS K  PIKVYNTNMKNHYK+
Subjt:  KKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKNHYKK

Query:  PSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNGTR
        PSPPDLGWDDLR DFRSFD NNIETWNIDGCSEGQM IIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALT GFTGNLR+WWHN LTD NREA+K+ VLEK  TR
Subjt:  PSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNGTR

A0A5D3DBQ3 Polyprotein2.2e-111100Show/hide
Query:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
        MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN
Subjt:  MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKN

Query:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG
        HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG
Subjt:  HYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNG

Query:  TRP
        TRP
Subjt:  TRP

A0A5D3DET5 Polyprotein6.3e-6668.14Show/hide
Query:  MKLDK-KETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMK
        MK DK  + L   E  GLP+V PNRPI+QPN LDIKLK SSTDEL+EELTRKLSET I                        +YDS KILPIKVYNT+MK
Subjt:  MKLDK-KETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMK

Query:  NHYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKN
        NHYK+PSPPDL  DDL  DFRSFD NNIETWN++ C EGQM II QEMFVAATSYLRRMSQ+EI+DALT GFTGNLRSWWHNHLTD NREAIK+AVLEK 
Subjt:  NHYKKPSPPDLGWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKN

Query:  GTRP
           P
Subjt:  GTRP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAACTGGACAAAAAAGAAACCCTAACTCCTTCAGAGCGGTCAGGATTACCTAGGGTTGACCCCAACCGACCAATAATGCAACCAAACTCCTTAGATATAAAGTTGAA
GGGATCAAGTACTGATGAGCTTCTTGAAGAATTGACTAGGAAGTTATCAGAAACATCCATTTCTAAGGAAAACATAGGAACCTCGTCCAAAAGGGAAGTTAGTAATTTTG
GAATGGGAAACCTCAATACAATCAGCTATGATTCTCTAAAAATTCTTCCTATCAAAGTTTACAACACTAATATGAAGAATCATTACAAAAAGCCATCGCCACCAGATCTT
GGATGGGATGACTTACGTCCAGATTTTCGATCATTCGACAAAAATAATATCGAAACTTGGAACATCGATGGTTGTTCTGAAGGGCAGATGGCAATCATTTTTCAAGAAAT
GTTTGTTGCTGCAACAAGCTATCTTAGGAGAATGAGTCAAAGAGAGATTGTTGACGCCTTGACTACAGGGTTTACAGGAAACCTTAGAAGTTGGTGGCACAATCATCTTA
CTGATGAAAATAGGGAAGCCATAAAGGACGCTGTTTTGGAAAAAAACGGAACAAGGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAACTGGACAAAAAAGAAACCCTAACTCCTTCAGAGCGGTCAGGATTACCTAGGGTTGACCCCAACCGACCAATAATGCAACCAAACTCCTTAGATATAAAGTTGAA
GGGATCAAGTACTGATGAGCTTCTTGAAGAATTGACTAGGAAGTTATCAGAAACATCCATTTCTAAGGAAAACATAGGAACCTCGTCCAAAAGGGAAGTTAGTAATTTTG
GAATGGGAAACCTCAATACAATCAGCTATGATTCTCTAAAAATTCTTCCTATCAAAGTTTACAACACTAATATGAAGAATCATTACAAAAAGCCATCGCCACCAGATCTT
GGATGGGATGACTTACGTCCAGATTTTCGATCATTCGACAAAAATAATATCGAAACTTGGAACATCGATGGTTGTTCTGAAGGGCAGATGGCAATCATTTTTCAAGAAAT
GTTTGTTGCTGCAACAAGCTATCTTAGGAGAATGAGTCAAAGAGAGATTGTTGACGCCTTGACTACAGGGTTTACAGGAAACCTTAGAAGTTGGTGGCACAATCATCTTA
CTGATGAAAATAGGGAAGCCATAAAGGACGCTGTTTTGGAAAAAAACGGAACAAGGCCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLDKKETLTPSERSGLPRVDPNRPIMQPNSLDIKLKGSSTDELLEELTRKLSETSISKENIGTSSKREVSNFGMGNLNTISYDSLKILPIKVYNTNMKNHYKKPSPPDL
GWDDLRPDFRSFDKNNIETWNIDGCSEGQMAIIFQEMFVAATSYLRRMSQREIVDALTTGFTGNLRSWWHNHLTDENREAIKDAVLEKNGTRP