; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0007844 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0007844
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description60S ribosomal protein L6
Genome locationchr04:23390354..23392788
RNA-Seq ExpressionIVF0007844
SyntenyIVF0007844
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0002181 - cytoplasmic translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000915 - 60S ribosomal protein L6E
IPR005568 - Ribosomal protein L6, N-terminal
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR014722 - Ribosomal protein L2, domain 2
IPR041997 - Ribosomal Protein L6, KOW domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149609.1 60S ribosomal protein L6-2 [Cucumis sativus]1.31e-15397.84Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_008461779.1 PREDICTED: 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucumis melo]4.07e-157100Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_022935449.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Cucurbita moschata]4.37e-15296.54Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_038880885.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Benincasa hispida]5.10e-15196.54Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRK KPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQL SGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDI GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAV+DLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

XP_038906099.1 60S ribosomal protein L6-1-like [Benincasa hispida]1.78e-15196.1Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPK  RVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKP+APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFE EKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS+LKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L9J7 60S ribosomal protein L69.6e-11997.84Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPK EAPAEKPPKFYPADDVKKP+VNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGV+VEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A1S3CFY6 60S ribosomal protein L62.1e-121100Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A5D3CKB9 60S ribosomal protein L62.1e-121100Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1F5G0 60S ribosomal protein L61.4e-11796.54Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVSDLKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

A0A6J1J7G9 60S ribosomal protein L61.5e-11696.1Show/hide
Query:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF
        MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +APAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLR+SITPGTVLIILTGRF
Subjt:  MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRF

Query:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL
        KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVD+ GVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQK VDSAL
Subjt:  KGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSAL

Query:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        LKSIEAVS LKTYLAARFSLK+GMKPHELVF
Subjt:  LKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P34091 60S ribosomal protein L63.3e-10083.48Show/hide
Query:  VSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGKRVVF
        VSRNP+L+RG+GKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFP+H  K       EKPPKFYPADDVKKPL+NKRK KPTKLRASITPGTVLIIL GRFKGKRVVF
Subjt:  VSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGKRVVF

Query:  LKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAV
        LKQL SGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQ+YVIATSTKVDI+GVNVEKFDDKYF K+ +KK KKGEGEFFEAEK+E + LPQ+KKDDQK VD ALLK+IE V
Subjt:  LKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAV

Query:  SDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
         +LK YL ARFSLKAGMKPHELVF
Subjt:  SDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q2YGT9 60S ribosomal protein L61.6e-4647.98Show/hide
Query:  SRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPA-------------------EKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKP-----TKLR
        SRNP L+RG+G+YSRS MY ++ L+  K K      + + K K    A                    K P++YP +DV + L++  K KP      KLR
Subjt:  SRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPA-------------------EKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKP-----TKLR

Query:  ASITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNV-EKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKS
        ASITPGT+LIILTGR +GKRV+FLKQL SGLLLVTGP  +N VPLRR +Q +VIATSTK+DI+GV + E   D YF K+  +K +  EGE F+ EK EK 
Subjt:  ASITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNV-EKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKS

Query:  ALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
         + + +K DQK VDS +L+ I+AV  L+ YL + F+L  G+ PH+LVF
Subjt:  ALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C5 60S ribosomal protein L6-31.0e-10182.89Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKPTKLRASITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9C9C6 60S ribosomal protein L6-26.0e-10282.89Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKP KLRASITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Q9FZ76 60S ribosomal protein L6-19.3e-10382.17Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +AP EKP KFYPA+DVKKPLVN+RK KPTKL+ASITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DI+GVN EKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ+KK+DQKTVD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL

Query:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        KSIEAV +LK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18540.1 Ribosomal protein L6 family protein6.6e-10482.17Show/hide
Query:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFK
        A +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDA+PK +AP EKP KFYPA+DVKKPLVN+RK KPTKL+ASITPGTVLIIL GRFK
Subjt:  APKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFK

Query:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL
        GKRVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTK+DI+GVN EKFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ+KK+DQKTVD+AL+
Subjt:  GKRVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALL

Query:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        KSIEAV +LK YL ARFSL  GMKPHELVF
Subjt:  KSIEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74050.1 Ribosomal protein L6 family protein7.3e-10382.89Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK
        +T +V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKPTKLRASITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF

AT1G74060.1 Ribosomal protein L6 family protein4.3e-10382.89Show/hide
Query:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK
        +TA+V+RNPDLIRGVGKYSRS+MYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAK K +AP EKPPKFYPA+DVKKPL N+R AKP KLRASITPGTVLIIL GRFKGK
Subjt:  KTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGK

Query:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS
        RVVFLKQL SGLLLVTGPFK+NGVPLRRVNQ+YVI TSTKVDI+GV ++KFDDKYF K  +KKKKK EGEFFEAEKEEK  +PQ KKDDQK VD+AL+K+
Subjt:  RVVFLKQLPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKS

Query:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF
        IEAV +LKTYL ARFSLK GMKPHELVF
Subjt:  IEAVSDLKTYLAARFSLKAGMKPHELVF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCCGAAGACAGCAAGAGTTAGCCGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGGTTGGCAAATACTCGAGGTCCAAGATGTACCACAAGCGAGGTCTCTGGGCAATCAAGGC
CAAAAATGGAGGTGTCTTCCCTCGCCACGATGCCAAGCCTAAGCCCGAAGCTCCAGCTGAAAAGCCGCCGAAATTTTACCCTGCCGACGATGTTAAGAAACCCCTTGTCA
ACAAACGCAAAGCTAAGCCTACCAAACTTAGGGCTAGTATTACTCCTGGAACTGTGCTTATCATTCTTACTGGACGGTTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTCTTGAAGCAA
CTTCCGTCTGGGTTGCTTTTAGTGACTGGTCCGTTCAAAGTCAATGGCGTTCCTTTGAGACGTGTGAATCAGTCATACGTGATTGCAACCTCCACCAAGGTGGACATTAC
AGGAGTTAACGTGGAGAAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAAAAGAAGAAAAAGAAGGGAGAAGGAGAATTTTTTGAGGCAGAGAAGGAGGAAAAAAGTG
CACTTCCACAAGACAAAAAAGATGATCAGAAGACCGTGGACTCAGCTCTGCTGAAGTCCATCGAGGCAGTCTCAGACTTAAAGACCTACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTA
AAGGCAGGCATGAAACCACATGAACTTGTTTTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGAGAAGAGACGAGGCAGCCAAGTTCTGAGAAATTCATCCATGGCTCCGAAGACAGCAAGAGTTAGCCGAAACCCCGATCTCATTCGAGGGGTTGGCAAATACTCGAGGT
CCAAGATGTACCACAAGCGAGGTCTCTGGGCAATCAAGGCCAAAAATGGAGGTGTCTTCCCTCGCCACGATGCCAAGCCTAAGCCCGAAGCTCCAGCTGAAAAGCCGCCG
AAATTTTACCCTGCCGACGATGTTAAGAAACCCCTTGTCAACAAACGCAAAGCTAAGCCTACCAAACTTAGGGCTAGTATTACTCCTGGAACTGTGCTTATCATTCTTAC
TGGACGGTTCAAGGGAAAGAGAGTTGTGTTCTTGAAGCAACTTCCGTCTGGGTTGCTTTTAGTGACTGGTCCGTTCAAAGTCAATGGCGTTCCTTTGAGACGTGTGAATC
AGTCATACGTGATTGCAACCTCCACCAAGGTGGACATTACAGGAGTTAACGTGGAGAAGTTTGATGACAAATATTTCTCCAAGGAAGTTCAAAAGAAGAAAAAGAAGGGA
GAAGGAGAATTTTTTGAGGCAGAGAAGGAGGAAAAAAGTGCACTTCCACAAGACAAAAAAGATGATCAGAAGACCGTGGACTCAGCTCTGCTGAAGTCCATCGAGGCAGT
CTCAGACTTAAAGACCTACTTAGCTGCAAGGTTTTCTCTAAAGGCAGGCATGAAACCACATGAACTTGTTTTCTAAACATTTCTCTCTTGGGTGCTGAAACTTCTCTTAT
TGAAGTTGATCCCTACAATCTTCTTGTTCATGTTCTGTTGCAAGGATTCTAGATTTGAAGTTTTGTGTCTCAGACGAATTTTGCAGTGAACTTTATTCATCAATTTTTGC
ATTATGTAGCTTCCTTTGACTACTGATAGTGATAAGATATGTACTTTTTCTTCAATGTATCATTGTTTTTCTAGTTGATGAAATACTTGAGAGAAGAATCATTTGAAAAG
AAGCCATGGTGCATAGCCAAATTGAGCTAGGCTATTTCTTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPKTARVSRNPDLIRGVGKYSRSKMYHKRGLWAIKAKNGGVFPRHDAKPKPEAPAEKPPKFYPADDVKKPLVNKRKAKPTKLRASITPGTVLIILTGRFKGKRVVFLKQ
LPSGLLLVTGPFKVNGVPLRRVNQSYVIATSTKVDITGVNVEKFDDKYFSKEVQKKKKKGEGEFFEAEKEEKSALPQDKKDDQKTVDSALLKSIEAVSDLKTYLAARFSL
KAGMKPHELVF