; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0007998 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0007998
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationchr07:13245920..13246228
RNA-Seq ExpressionIVF0007998
SyntenyIVF0007998
Gene Ontology termsGO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0032939.1 hypothetical protein E6C27_scaffold269G00120 [Cucumis melo var. makuwa]4.95e-4381.37Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
        MSADQYAMDL FT VTRSRSRS  IRIGS TESSTPPRPSANLI PSG VVQMRP ASP SN+E STPPTTYSQ VTP+K FVP  +SNLIFKSLS F+I
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI

Query:  LS
        LS
Subjt:  LS

KAA0045303.1 hypothetical protein E6C27_scaffold316G00680 [Cucumis melo var. makuwa]7.42e-6196.08Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
        ++ADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPS NLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSF+I
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI

Query:  LS
        LS
Subjt:  LS

KAA0047770.1 hypothetical protein E6C27_scaffold1059G00330 [Cucumis melo var. makuwa]7.00e-4182.61Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIF
        MSADQYAMDLGFT VT+SRSRSSGI IGS TESSTPPRPSANLI P GGV+QMR  ASPSSNKE  TPPTTYSQVVTPDKWFV RPE+   F
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIF

KAA0066421.1 hypothetical protein E6C27_scaffold21G005030 [Cucumis melo var. makuwa]4.11e-4182.8Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFK
        MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSS IRI S TESSTPPRPSANLI P GG VQMRP ASPSSN+E STPPTTYSQ VTPDK FVPRPE    F+
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFK

TYK08792.1 hypothetical protein E5676_scaffold1300G00210 [Cucumis melo var. makuwa]1.95e-63100Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
        MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI

Query:  LS
        LS
Subjt:  LS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TP36 Uncharacterized protein4.8e-4696.08Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
        ++ADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPS NLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSF+I
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI

Query:  LS
        LS
Subjt:  LS

A0A5D3BM67 Uncharacterized protein2.5e-3182.8Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFK
        MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSS IRI S TESSTPPRPSANLI P GG VQMRP ASPSSN+E STPPTTYSQ VTPDK FVPRPE    F+
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFK

A0A5D3BW12 Uncharacterized protein7.4e-3182.61Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIF
        MSADQYAMDLGFT VT+SRSRSSGI IGS TESSTPPRPSANLI P GGV+QMR  ASPSSNKE  TPPTTYSQVVTPDKWFV RPE+   F
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIF

A0A5D3CBW7 Uncharacterized protein1.1e-47100Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
        MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI

Query:  LS
        LS
Subjt:  LS

A0A5D3DEK9 Uncharacterized protein1.8e-3281.37Show/hide
Query:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI
        MSADQYAMDL FT VTRSRSRS  IRIGS TESSTPPRPSANLI PSG VVQMRP ASP SN+E STPPTTYSQ VTP+K FVP  +SNLIFKSLS F+I
Subjt:  MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMI

Query:  LS
        LS
Subjt:  LS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGCAGATCAATATGCAATGGATTTAGGGTTTACCACAGTAACCCGATCCAGATCAAGATCGTCCGGTATACGGATTGGGTCTCTCACGGAGTCATCAACTCCACC
TAGACCTTCGGCCAATCTTATCTGTCCTTCTGGCGGAGTCGTTCAAATGAGGCCTTCTGCCTCTCCTTCATCCAATAAGGAGTATTCTACTCCTCCTACAACTTATTCTC
AGGTTGTCACCCCCGATAAATGGTTTGTGCCAAGACCCGAATCAAATCTTATTTTCAAAAGCCTATCGTCGTTTATGATCCTATCATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGTGCAGATCAATATGCAATGGATTTAGGGTTTACCACAGTAACCCGATCCAGATCAAGATCGTCCGGTATACGGATTGGGTCTCTCACGGAGTCATCAACTCCACC
TAGACCTTCGGCCAATCTTATCTGTCCTTCTGGCGGAGTCGTTCAAATGAGGCCTTCTGCCTCTCCTTCATCCAATAAGGAGTATTCTACTCCTCCTACAACTTATTCTC
AGGTTGTCACCCCCGATAAATGGTTTGTGCCAAGACCCGAATCAAATCTTATTTTCAAAAGCCTATCGTCGTTTATGATCCTATCATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSADQYAMDLGFTTVTRSRSRSSGIRIGSLTESSTPPRPSANLICPSGGVVQMRPSASPSSNKEYSTPPTTYSQVVTPDKWFVPRPESNLIFKSLSSFMILS