| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0031989.1 putative Retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.91e-131 | 99.48 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
MLRVNFLTKYHAIFDY NKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
Query: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
Subjt: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| KAA0036100.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.96e-63 | 54.97 | Show/hide |
Query: VNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKR-VER-IIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIKF
++FL ++A D + KEVV R P E+ F ++ V R +I VLKA KL++ ++LAH++ + P VP+V E++DVFP +LSGL P REI+F
Subjt: VNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKR-VER-IIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIKF
Query: TIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
TIE++ GT PISQ PYRMA ELKELK QL+EL++K YI+P PW AP+LF +K+DG++RLCIDYRQLNKVT++NKYPLPRI++LFDQL+
Subjt: TIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| KAA0040571.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold262G001410 [Cucumis melo var. makuwa] | 6.40e-63 | 56.04 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
+L + FLTKYHA+ D +NKE ARKLMK H +YL HV++T A R+DPSKVPIVCEY+DVF +ELSG P+REI+
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
Query: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLP
F I++ +T ISQ PY M ++KELKNQL+ELIEK YI+P TSPW AP+LF + +DGS+RLCIDYRQL+KVT+KNKYPLP
Subjt: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLP
|
|
| TYK02467.1 uncharacterized protein E5676_scaffold1738G00930 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.91e-62 | 58.01 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
+L +NFLTKYH I D NKEVVLR+ K E+K+ H +YLAHVI+T ++D VPIVCEY+DVFP+ELS L + EI+
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
Query: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPL
TI+++ TTPISQTPYRMA ELKELK+QL+EL+EK IQP T PW PILF +K+DGS+RLCIDYRQLNKVT+KNKYPL
Subjt: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPL
|
|
| WP_217833159.1 hypothetical protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002] | 1.98e-66 | 55.67 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
+L ++FL+KY A D + KEVV + + E+ F D+++ +I +KA KL+ +YLAHV+ + P VPIV E++DVFP+ELSGL P RE
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
++FTI++V GTTPISQ PYRMA ELKELK QL+EL++K YI+P SPW AP+LF +K+DG++RLCIDYRQLNKVT+ NKYPLPRI++LFDQL+
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7U2V7 Reverse transcriptase | 3.8e-52 | 54.12 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
+L ++FL ++A D + KEVV R P E+ F ++ +I VLKA KL++ ++LAH++ + P VP+V E++DVFP +LSGL P RE
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
I+FTIE++ GT PISQ PYRMA ELKELK QL+EL++K YI+P SPW AP+LF +K+DG++RLCIDYRQLNKVT++NKYPLPRI++LFDQL+
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| A0A5A7V4W9 Reverse transcriptase | 2.2e-52 | 54.12 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
+L ++FL ++A D + KEVV R P E+ F ++ +I VLKA KL++ ++LAH++ + P VP+V E++DVFP +LSGL P RE
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
I+FTIE++ GT PISQ PYRMA ELKELK QL+EL++K YI+P SPW AP+LF +K+DG++RLCIDYRQLNKVT++NKYPLPRI++LFDQL+
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| A0A5D3BHI1 Reverse transcriptase | 3.8e-52 | 54.12 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
+L ++FL ++A D + KEVV R P E+ F ++ +I VLKA KL++ ++LAH++ + P VP+V E++DVFP +LSGL P RE
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
I+FTIE++ GT PISQ PYRMA ELKELK QL+EL++K YI+P SPW AP+LF +K+DG++RLCIDYRQLNKVT++NKYPLPRI++LFDQL+
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| A0A5D3BS67 Reverse transcriptase | 3.8e-52 | 54.12 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
+L ++FL ++A D + KEVV R P E+ F ++ +I VLKA KL++ ++LAH++ + P VP+V E++DVFP +LSGL P RE
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRV--ERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQRE
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
I+FTIE++ GT PISQ PYRMA ELKELK QL+EL++K YI+P SPW AP+LF +K+DG++RLCIDYRQLNKVT++NKYPLPRI++LFDQL+
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| A0A5D3D2P1 Putative Retrotransposon protein | 3.6e-103 | 99.48 | Show/hide |
Query: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
MLRVNFLTKYHAIFDY NKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
Subjt: MLRVNFLTKYHAIFDYYNKEVVLRDPKKIEIKFEADKRVERIIFVLKARKLMKNEHVSYLAHVINTLAPRNDPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQREIK
Query: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
Subjt: FTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 1.1e-08 | 24.39 | Show/hide |
Query: DPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQ--REIKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQ
+P I E+ D+ + + LP+ + ++F +E+ Q + Y + G+++ + +++ + ++ I+ + P++F K++G++R+ +DY+
Subjt: DPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQ--REIKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQ
Query: LNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
LNK N YPLP IE L +++
Subjt: LNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
| P10394 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 412 | 3.1e-11 | 30.83 | Show/hide |
Query: IVCEYMDVFPKELSGLLPQREIKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDG------SIRLCIDYRQLN
I EY+D+F E + K + + + P+ YR +++E++ Q+++LI+ ++P S + +P+L K+ RL IDYRQ+N
Subjt: IVCEYMDVFPKELSGLLPQREIKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDG------SIRLCIDYRQLN
Query: KVTMKNKYPLPRIENLFDQL
K + +K+PLPRI+++ DQL
Subjt: KVTMKNKYPLPRIENLFDQL
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 3.3e-13 | 36.56 | Show/hide |
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQL
+K IEI G PY + +E+ +++L++ +I P SP +P++ K+DG+ RLC+DYR LNK T+ + +PLPRI+NL ++
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQL
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 3.3e-13 | 36.56 | Show/hide |
Query: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQL
+K IEI G PY + +E+ +++L++ +I P SP +P++ K+DG+ RLC+DYR LNK T+ + +PLPRI+NL ++
Subjt: IKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQLNKVTMKNKYPLPRIENLFDQL
|
|
| Q9UR07 Transposon Tf2-11 polyprotein | 1.1e-08 | 24.39 | Show/hide |
Query: DPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQ--REIKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQ
+P I E+ D+ + + LP+ + ++F +E+ Q + Y + G+++ + +++ + ++ I+ + P++F K++G++R+ +DY+
Subjt: DPSKVPIVCEYMDVFPKELSGLLPQ--REIKFTIEIVQGTTPISQTPYRMALGELKELKNQLKELIEKDYIQPRTSPWRAPILFEEKEDGSIRLCIDYRQ
Query: LNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
LNK N YPLP IE L +++
Subjt: LNKVTMKNKYPLPRIENLFDQLK
|
|
