| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0032864.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.72e-56 | 93.14 | Show/hide |
Query: MQLVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEIS
M+LVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLI+SIATHNFIHQ+LVDELNLP IEESKFGVTIGDETMREG GICRRVEVVLV+I
Subjt: MQLVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEIS
Query: IV
IV
Subjt: IV
|
|
| KAA0036971.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.24e-27 | 56.44 | Show/hide |
Query: QLVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISI
++VEL +EV IEV L +I+GF+AKG +KL+G VK + ++V+IDS +HN IHQRLVDEL L I+EE++FGVT+GD T+R G G+C+RVEV L+E++I
Subjt: QLVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISI
Query: V
+
Subjt: V
|
|
| KAA0059036.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.82e-26 | 54 | Show/hide |
Query: LVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
+VEL +LEV + E+ L +++GF AKG MKL+G VKG+ +IVL+DS ATH+FIHQ +V+E+N+ I +++ FGVTI + T R GRG+C+RVE+ L E+ IV
Subjt: LVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
| TYK01280.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.76e-26 | 56.57 | Show/hide |
Query: VELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
VE +LEV K E++L +ILGF++KG MKLRG +KG+ +I+LIDS ATHNFIHQ ++ EL L + ++KFGVTIGD T EG+GIC+++EV L +++IV
Subjt: VELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
| TYK05651.1 Retrotransposable element Tf2 [Cucumis melo var. makuwa] | 9.40e-26 | 56.12 | Show/hide |
Query: ELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
EL SL + G E++L +ILGF++KG MK+RG + G+ +I+LIDS ATHNFIH+ +V+EL LP+ ++KFGVTIGD T EG GIC+ VE+ L E++IV
Subjt: ELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SNT7 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.8e-43 | 93.14 | Show/hide |
Query: MQLVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEIS
M+LVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLI+SIATHNFIHQ+LVDELNLP IEESKFGVTIGDETMREG GICRRVEVVLV+I
Subjt: MQLVELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEIS
Query: IV
IV
Subjt: IV
|
|
| A0A5A7SVA3 Retrotransposon protein | 3.8e-22 | 56.57 | Show/hide |
Query: VELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
VE +LEV K E++L +ILGF++KG MKLRG +KG+ +I+LIDS ATHNFIHQ +V EL L + ++KFGVTIGD T EG+GIC+++E L +++IV
Subjt: VELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
| A0A5A7TH70 DNA polymerase epsilon catalytic subunit | 2.2e-22 | 56.12 | Show/hide |
Query: ELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
EL SL + G E++L +ILGF++KG MK+RG + G+ +I+LIDS ATHNFIH+ +V+EL LP+ ++KFGVTIGD T EG GIC+ VE+ L E++IV
Subjt: ELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
| A0A5D3BQE6 Retrotransposon protein | 1.7e-22 | 56.57 | Show/hide |
Query: VELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
VE +LEV K E++L +ILGF++KG MKLRG +KG+ +I+LIDS ATHNFIHQ ++ EL L + ++KFGVTIGD T EG+GIC+++EV L +++IV
Subjt: VELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
| A0A5D3C142 Retrotransposable element Tf2 | 2.2e-22 | 56.12 | Show/hide |
Query: ELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
EL SL + G E++L +ILGF++KG MK+RG + G+ +I+LIDS ATHNFIH+ +V+EL LP+ ++KFGVTIGD T EG GIC+ VE+ L E++IV
Subjt: ELTSLEVPGKIEVALLSILGFSAKGVMKLRGWVKGQHLIVLIDSIATHNFIHQRLVDELNLPIIEESKFGVTIGDETMREGRGICRRVEVVLVEISIV
|
|
