; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0008425 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0008425
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionDUF4050 domain-containing protein
Genome locationchr05:25522225..25525117
RNA-Seq ExpressionIVF0008425
SyntenyIVF0008425
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016903413.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503177 isoform X1 [Cucumis melo]8.34e-10095.36Show/hide
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XP_038889429.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X1 [Benincasa hispida]7.03e-9591.67Show/hide
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XP_038889430.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X2 [Benincasa hispida]5.53e-9591.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein1.2e-7896.03Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X24.3e-7996.69Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X15.2e-7792.41Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508502.1e-6278.15Show/hide
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A0A6J1KGB3 uncharacterized protein LOC1114936408.6e-6478.81Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein4.9e-1135.9Show/hide
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AT1G15350.2 unknown protein4.9e-1135.9Show/hide
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AT4G32342.1 unknown protein6.4e-1135.14Show/hide
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AT5G25360.1 unknown protein9.2e-1838.06Show/hide
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AT5G25360.2 unknown protein9.2e-1838.06Show/hide
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         QTR +W+ N    K+ K    T +SW  T E LL   K + R IPL   + F V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCCAAGCATGTCAGAAGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTGGACGAGTTGCTTACACTTCAATCTCGACAGAATTCATTTATCAGCACAACGAACCATAACTCTA
ACCATGGTGGTGTCATTGATAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGCCTTCGGTGGGTCGGAAATTGTGTGCCTGCT
AAACGAACTAAAAAAAGTCATATTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTATTGTTGGAAACCAGAAAGCCTTACCATCGACGCATACCTTTATCGGTCAGCCT
GCTTTTCTATGTTTTCTGGTGTTTTTCTTTAGTTGACTACACATTCAATTCCTCTTCTTTGAATATTAAAACCATATTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTAAAATTAACTACTAATTAACGGTATGAAATTACTGATTATCAAATGGATCTGTTAAAAGTTTCAATGCAAGTCACAATCACAATAATTTCCTATCCAATACTGCCTT
GTTTATCCGATTCTATCCGAAATTAGGGATTTTGATTCGATTCCCATTTTCCCTTTCGATTTCGGCATGTTTCTGTGTTTTCATGTTTGTAATCTGATTTTTCGCCGAAT
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ACCATGGTGGTGTCATTGATAATTTAAGCAATCATTCTGACTTTGTAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCCGCCTTCGGTGGGTCGGAAATTGTGTGCCTGCT
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GCTTTTCTATGTTTTCTGGTGTTTTTCTTTAGTTGACTACACATTCAATTCCTCTTCTTTGAATATTAAAACCATATTATAATTAACAGGAAATGGTAGACTTTCTGGTA
GAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTATATTATTAAGCCGGTCAATTGAAAGAACAATCACCTTGTGCATACACTATCCTTGTGACTTTTTTCTTTCGTGTTTTGGAGTTCAA
TTCCGCGCCTACCACCTTAACTTGGGATCAACTCGATACAAGTTTAACATACAAAATGACACCATTGGTTTGCTAACCTTTTCGATATTGCTGCTACATTGGAGATCTCT
AAGGGGAGGGGCCAATTGTGAAGTAACCCAAAATCAAAGATCTTCCAATTGATCGGCGAGCTAAATGGTAAGCCCCCTCCGACCAATATACTTTATACATACATATCAAA
CTTTCTTCATCATTAGTTTAATATATGATGAAACATCAACTTTGCAGTGTGTTTGATGCAATGTTGTTGATGACCGACTCGTTGTAATTGATGTAAAAGAATAGATAATA
ATTAATCTCTCTAAAACAAACTCTTCTTTGTTTTGAATTCCTGATAAAATATCAAGATTGATTTTGTGGTGATATTGCTGTCAAATGTGTTGGATGGTAGAGAAAACAGA
TAATAGACAAAATCAAGCCTCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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