; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0008509 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0008509
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionnon-classical arabinogalactan protein 31-like
Genome locationchr08:1864795..1867096
RNA-Seq ExpressionIVF0008509
SyntenyIVF0008509
Gene Ontology termsGO:0071944 - cell periphery (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004134701.1 non-classical arabinogalactan protein 31 [Cucumis sativus]1.06e-16390.26Show/hide
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XP_008439849.1 PREDICTED: non-classical arabinogalactan protein 31-like [Cucumis melo]5.87e-195100Show/hide
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XP_022926154.1 non-classical arabinogalactan protein 31-like [Cucurbita moschata]5.74e-13677.44Show/hide
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        SFF   FFAIFA S ADD T AETL  P            HHHH+PTPAP+ PPTHLPLHPPA PP+HH HH   H QPPVHPP     +HLPP    AH
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        +PAP HHHHH  +V P+PPPTHSPAP++PPKPRL+RSFISVQGVVYCKSCKYAG DTLLGAT VAGA+VKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKA+
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XP_022978745.1 non-classical arabinogalactan protein 31-like [Cucurbita maxima]2.45e-13777.82Show/hide
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        SFF   FFAIFA    DD T AETL  P            HHHH+PTPAP+ PPTHLPLHPPA PP+HH HH   H QPPVHPP     HHLPPTH P H
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        +PAP HHHHH  +V P+PPPTHSPAP++PPKPRL+RSFISVQGVVYCKSCKYAG DTLLGAT VAGA+VKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKA+
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        TSYAFHKCKVVLG SP+P+CSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLP+VLYSVGPFAFEPTC HH
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XP_038881349.1 non-classical arabinogalactan protein 31-like [Benincasa hispida]6.77e-15682.97Show/hide
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        MAF L S SFF   FFA+FAFSAAD IT  ETLP+PHH           HHAPTPAP+P PTHLP+H P HPP      HH HH HGQPPVHPPANAPSH
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        HLPPTH PAHSPAP HH HHH ++ P+PPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNG
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        YFFITAPKAITSYAFHKCKV+LG SPSP+C+KPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KLH4 Structural constituent of cell wall1.5e-12690.26Show/hide
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        MAFNLISLSFFS F FAIFAFSAADDIT AETLP+P   HHHHAP+PAPLPPPTHLPL    HPPAHPP HHRHHAH Q PVHPPANAPSHHLPPT    
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        H PAPA HHHHHHNVSPV PP+HSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKY GADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKA
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        ITSYAFHKCKVVLG SPSPTC+KPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH
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A0A1S3B0F6 non-classical arabinogalactan protein 31-like1.9e-150100Show/hide
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        HSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFIT
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        APKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH
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A0A5A7U9U1 Non-classical arabinogalactan protein 31-like1.9e-150100Show/hide
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        APKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH
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A0A6J1EEB1 non-classical arabinogalactan protein 31-like1.1e-10577.44Show/hide
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        SFF   FFAIFA S ADD T AETL  P            HHHH+PTPAP+ PPTHLPLHPPA PP+  HH HH H QPPVHP    P +HLP    PAH
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Query:  SPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAI
        +PAP   HHHHH+V P+PPPTHSPAP++PPKPRL+RSFISVQGVVYCKSCKYAG DTLLGAT VAGA+VKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKA+
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Query:  TSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH
        TSYAFHKCKVVLG SP+P+CSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLP+VLYSVGPFAFEPTC HH
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A0A6J1IR37 non-classical arabinogalactan protein 31-like9.9e-10777.82Show/hide
Query:  SFFSFFFFAIFAFSAADDITPAETLPLP------------HHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPT--HHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAH
        SFF   FFAIF    ADD T AETL  P            HHHH+PTPAP+ PPTHLPLHPPA PP+  HH HH H QPPVHP    P HHLPPTH P H
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Query:  SPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAI
        +PAP   HHHHH+V P+PPPTHSPAP++PPKPRL+RSFISVQGVVYCKSCKYAG DTLLGAT VAGA+VKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKA+
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Query:  TSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH
        TSYAFHKCKVVLG SP+P+CSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLP+VLYSVGPFAFEPTC HH
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P93013 Non-classical arabinogalactan protein 302.1e-2939Show/hide
Query:  ISLSFFSFFFFAIFAFSAADDITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSH--HLPPTHSPAHSPAPAHHHH
        +SL+ F+   F    F+   +  P  + P    H  P   PL PP  LP  PPA  P         + P +PPA AP     LPP  +P   P       
Subjt:  ISLSFFSFFFFAIFAFSAADDITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSH--HLPPTHSPAHSPAPAHHHH

Query:  HHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCK
            + P+ PP     P+YPPK    ++ ++V+GVVYCK+CKYAG + + GA PV  A V+L+C+N K  + +T  TDKNGYF + APK +T+Y    C+
Subjt:  HHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCK

Query:  VVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQK----SYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP
          L KSP   CSK S+LH G  G+ L+P      S        + +Y+VGPFAFEPTCP
Subjt:  VVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQK----SYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP

Q03211 Pistil-specific extensin-like protein1.4e-1738.4Show/hide
Query:  PAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPA-HPPTHHRHHAHGQPPVHPPAN-------APSHHLPPTHSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSP--
        P   +  P    A  P P PPP   P   PA  PPT        QPP  P A         P    PP  +P+ SPA          ++P P P  +P  
Subjt:  PAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPA-HPPTHHRHHAHGQPPVHPPAN-------APSHHLPPTHSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSP--

Query:  ------APIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSP
               P+  P P L +  I V G+VYCKSC   G  TLL A+ + GA VKLIC   K  +VQ ATTD  G F I  PK++T+    KCKV L KSP+P
Subjt:  ------APIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSP

Query:  TCSKPSALHGGAAGA---PLRPQKSYIDANKLPFV-----LYSVGPFAFE
         C+ P+  +GG +G    PL P K  I    +P       LY VGPF FE
Subjt:  TCSKPSALHGGAAGA---PLRPQKSYIDANKLPFV-----LYSVGPFAFE

Q9FZA2 Non-classical arabinogalactan protein 311.7e-3945.38Show/hide
Query:  ITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPA--PIYPP
        + P    P+    + PT AP+ PPT  P+ PP +PPT        +PPV PP + P+   PP   P + P  A          PV PPT  P   P+YPP
Subjt:  ITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPA--PIYPP

Query:  KPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGA
        K    RS ++V+G VYCKSCKYA  +TLLGA P+ GA+VKL+C++ K    +T TTDKNGYF + APK +T++ F  C+V L KS    CSK S L GG 
Subjt:  KPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGA

Query:  AGAPLRPQ----KSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP
         GA L+P+    KS +  NKL + L++VGPFAF P+CP
Subjt:  AGAPLRPQ----KSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28290.1 arabinogalactan protein 311.2e-4045.38Show/hide
Query:  ITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPA--PIYPP
        + P    P+    + PT AP+ PPT  P+ PP +PPT        +PPV PP + P+   PP   P + P  A          PV PPT  P   P+YPP
Subjt:  ITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPAPAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPA--PIYPP

Query:  KPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGA
        K    RS ++V+G VYCKSCKYA  +TLLGA P+ GA+VKL+C++ K    +T TTDKNGYF + APK +T++ F  C+V L KS    CSK S L GG 
Subjt:  KPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGA

Query:  AGAPLRPQ----KSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP
         GA L+P+    KS +  NKL + L++VGPFAF P+CP
Subjt:  AGAPLRPQ----KSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP

AT1G28290.2 arabinogalactan protein 315.1e-3944.67Show/hide
Query:  ITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPA------PAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPA-
        ++P    P+    + PT AP+ PPT  P+ PP  PP         +PPV+PP  AP    PPT  P   P       P +         PV PPT  P  
Subjt:  ITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPA------PAHHHHHHHNVSPVPPPTHSPA-

Query:  -PIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPS
         P+YPPK    RS ++V+G VYCKSCKYA  +TLLGA P+ GA+VKL+C++ K    +T TTDKNGYF + APK +T++ F  C+V L KS    CSK S
Subjt:  -PIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKSPSPTCSKPS

Query:  ALHGGAAGAPLRPQ----KSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP
         L GG  GA L+P+    KS +  NKL + L++VGPFAF P+CP
Subjt:  ALHGGAAGAPLRPQ----KSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP

AT2G33790.1 arabinogalactan protein 301.5e-3039Show/hide
Query:  ISLSFFSFFFFAIFAFSAADDITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSH--HLPPTHSPAHSPAPAHHHH
        +SL+ F+   F    F+   +  P  + P    H  P   PL PP  LP  PPA  P         + P +PPA AP     LPP  +P   P       
Subjt:  ISLSFFSFFFFAIFAFSAADDITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSH--HLPPTHSPAHSPAPAHHHH

Query:  HHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCK
            + P+ PP     P+YPPK    ++ ++V+GVVYCK+CKYAG + + GA PV  A V+L+C+N K  + +T  TDKNGYF + APK +T+Y    C+
Subjt:  HHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCK

Query:  VVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQK----SYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP
          L KSP   CSK S+LH G  G+ L+P      S        + +Y+VGPFAFEPTCP
Subjt:  VVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQK----SYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCP

AT2G34700.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein4.5e-3549.36Show/hide
Query:  NVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVL
        + SP+ PP+ SPA       ++ R  ++V+G+VYCKSCKY+G DTLL A+P+ GA+VKL C NTK  +     TDKNGYFF+ APK +T+YAFH C+   
Subjt:  NVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVL

Query:  GKSPSP-----TCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTC
          +P P     TC+ PS L+ G  GA L+P K+ I+  +  +VL+SVGPFAFEP C
Subjt:  GKSPSP-----TCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTC

AT5G05500.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein9.7e-1431.01Show/hide
Query:  SPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPL--VQTATTDKNGYFF-----ITAPKAITSYAFHK
        +P PPP   P   YP    +     +V+G+VYC+SC   G+ +L GA  +AGA + +IC+N +  +   +   TD  G+F+              +  H 
Subjt:  SPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPL--VQTATTDKNGYFF-----ITAPKAITSYAFHK

Query:  CKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPT-CP
        C+  L  SP   C+  S ++    GAPLR ++  +       V+Y+ GP AF P  CP
Subjt:  CKVVLGKSPSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPT-CP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGTCCTCTTCATTCATAAATTCCCCATCCATGGCTTTTAATCTCATCTCCCTGTCTTTCTTTTCCTTTTTCTTCTTCGCCATTTTCGCCTTCTCCGCCGCTGACGA
CATCACACCGGCCGAAACACTCCCCCTTCCCCACCACCACCACGCTCCCACGCCGGCACCATTACCTCCACCCACCCATTTGCCCCTTCACCCTCCGGCTCACCCGCCAA
CACACCACCGCCATCACGCCCACGGCCAGCCTCCGGTTCACCCACCGGCAAATGCGCCCTCTCACCATCTCCCTCCAACTCACTCGCCGGCTCACTCGCCAGCTCCCGCC
CACCACCACCACCACCACCATAATGTCAGCCCAGTGCCTCCTCCGACTCACTCGCCGGCTCCGATCTACCCTCCGAAACCTCGGTTGGTGAGGAGCTTCATTTCGGTTCA
AGGTGTTGTGTATTGCAAGTCCTGTAAATATGCGGGTGCTGACACACTGCTCGGAGCTACCCCCGTCGCCGGTGCAAGCGTGAAGCTTATTTGTCAGAACACTAAATACC
CATTGGTCCAAACAGCAACCACTGACAAGAACGGCTATTTCTTCATCACTGCCCCAAAGGCCATCACCAGCTACGCCTTCCATAAGTGCAAGGTCGTTCTCGGCAAATCC
CCTTCCCCCACTTGCAGCAAGCCCTCCGCTCTCCACGGCGGCGCTGCCGGAGCCCCTCTCCGCCCTCAGAAGTCTTACATCGACGCTAATAAACTCCCCTTCGTTCTCTA
CTCTGTTGGCCCTTTTGCCTTCGAACCCACTTGCCCTCATCATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCAAGCGTGGAAGTGCTATATATCTTTCGCCCTAAACTCTGCCAATGTCGTCCTCTTCATTCATAAATTCCCCATCCATGGCTTTTAATCTCATCTCCCTGTCTTTCTTT
TCCTTTTTCTTCTTCGCCATTTTCGCCTTCTCCGCCGCTGACGACATCACACCGGCCGAAACACTCCCCCTTCCCCACCACCACCACGCTCCCACGCCGGCACCATTACC
TCCACCCACCCATTTGCCCCTTCACCCTCCGGCTCACCCGCCAACACACCACCGCCATCACGCCCACGGCCAGCCTCCGGTTCACCCACCGGCAAATGCGCCCTCTCACC
ATCTCCCTCCAACTCACTCGCCGGCTCACTCGCCAGCTCCCGCCCACCACCACCACCACCACCATAATGTCAGCCCAGTGCCTCCTCCGACTCACTCGCCGGCTCCGATC
TACCCTCCGAAACCTCGGTTGGTGAGGAGCTTCATTTCGGTTCAAGGTGTTGTGTATTGCAAGTCCTGTAAATATGCGGGTGCTGACACACTGCTCGGAGCTACCCCCGT
CGCCGGTGCAAGCGTGAAGCTTATTTGTCAGAACACTAAATACCCATTGGTCCAAACAGCAACCACTGACAAGAACGGCTATTTCTTCATCACTGCCCCAAAGGCCATCA
CCAGCTACGCCTTCCATAAGTGCAAGGTCGTTCTCGGCAAATCCCCTTCCCCCACTTGCAGCAAGCCCTCCGCTCTCCACGGCGGCGCTGCCGGAGCCCCTCTCCGCCCT
CAGAAGTCTTACATCGACGCTAATAAACTCCCCTTCGTTCTCTACTCTGTTGGCCCTTTTGCCTTCGAACCCACTTGCCCTCATCATTAGTCGTCGTTTATGTTTTTTGG
TTTTAATTGTTATTATGCCTTTTAAACGATGTCGTTTCTTTCGGTTGTTGGGGTTCTGAATTCTGCTGCTGCCTTTCTGTACGGCATGGTTTGGTTGTTACTTCGTTGTT
AGTTTGGGTTGGGATTTTTATGGTACAAATAATATGTTAATTTAAATGCTTCTTTTTTCTTATATTATCTTTTCATAAAGTGAAATGGGATATAGATCTAAAAAGGTCTA
AGGGGGGAAATCGATATTTGGTTCCTTTCCTTTGTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSSFINSPSMAFNLISLSFFSFFFFAIFAFSAADDITPAETLPLPHHHHAPTPAPLPPPTHLPLHPPAHPPTHHRHHAHGQPPVHPPANAPSHHLPPTHSPAHSPAPA
HHHHHHHNVSPVPPPTHSPAPIYPPKPRLVRSFISVQGVVYCKSCKYAGADTLLGATPVAGASVKLICQNTKYPLVQTATTDKNGYFFITAPKAITSYAFHKCKVVLGKS
PSPTCSKPSALHGGAAGAPLRPQKSYIDANKLPFVLYSVGPFAFEPTCPHH