; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0008620 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0008620
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionDUF1685 domain-containing protein
Genome locationchr12:20567825..20568748
RNA-Seq ExpressionIVF0008620
SyntenyIVF0008620
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR012881 - Protein of unknown function DUF1685


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0057058.1 DUF1685 domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]8.45e-162100Show/hide
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XP_031737252.1 uncharacterized protein LOC105434498 [Cucumis sativus]1.08e-14088.84Show/hide
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        LSEAWEA+ EEEEKEEL K+PLMMKWRFPSNQIDMKDNLKWWAHAVASTVR
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XP_038895996.1 uncharacterized protein LOC120084174 [Benincasa hispida]5.93e-12683.87Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV26 Uncharacterized protein3.5e-11188.84Show/hide
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A0A1S4DSH1 uncharacterized protein LOC1034893592.3e-11089.43Show/hide
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A0A5A7UPL7 DUF1685 domain-containing protein3.5e-127100Show/hide
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A0A6J1EH41 uncharacterized protein LOC1114340583.1e-7567.86Show/hide
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        MD EQ+L+LFDS WFER +FNKHPF +N Q   P+ QD D L   P E   +PR+  RSISEDLSSKL+FMS S+SPDSVLFSPKLQTI SSK+IAG E 
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A0A6J1KR35 uncharacterized protein LOC1114957101.4e-8071.83Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42760.1 unknown protein8.5e-3341.33Show/hide
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        E+LL LF+  W ER +F K     N           +  + ++ ++L     SF++ R  +       SSK S  SSS+     SP SVL       KLQ
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        TI S K++      E  R L  E+  + + +++    RTR+   +S+S+LE+EELKGFMDLGFVFSE+D K S L SI+PGL RL KK++  +KEEEEEE
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Query:  EEEERKLGG-EISRPYLSEAWEAMEEEEEKEELAKKPLMMKWRFP----SNQIDMKDNLKWWAHAVASTVR
        EE+  K+GG   +RPYLSEAW+     + K+++  +   +KWR P    ++++D+KDNL+ WAHAVAST+R
Subjt:  EEEERKLGG-EISRPYLSEAWEAMEEEEEKEELAKKPLMMKWRFP----SNQIDMKDNLKWWAHAVASTVR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACTTCGAGCAACTTCTCAATCTCTTCGATTCATTCTGGTTCGAGCGTGGAGTCTTCAACAAACATCCTTTTCTATCAAACCTACAACCTCAAATTCAAGATCCCGA
TTCATTACCCAAGGAATCATTCATCATCCCACGGCTTCCAACGAGATCGATAAGTGAAGATTTAAGCTCAAAATTAAGCTTTATGTCCAGTTCCAATTCACCCGATTCAG
TTCTCTTTTCTCCAAAGCTTCAAACCATCTTTTCCAGCAAGGACATCGCCGGAGCAGAGTCGCCGGAGACAAGCCGTAAGTTGGAAATTGAGCGTAGGCCAAAAACAGAG
TACAGGAGGAGGTTTAGAGGAAGAAGAACGAGACGGTCGGAAAGTCGGAGCCTTTCAGAGCTGGAATTCGAGGAGTTAAAAGGGTTTATGGATTTGGGATTTGTTTTCTC
GGAAGAGGATAAAGGTTCGAGCTTGGCGTCGATAGTTCCCGGATTGAACAGGCTAGGGAAAAAGGAAGAGAAAGAAAGTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAG
AAAGAAAATTGGGTGGTGAAATTTCGAGGCCTTATCTTTCAGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGGAAGAAGAAGAAAAAGAGGAGTTGGCGAAGAAACCATTGATGATGAAA
TGGAGGTTTCCTTCTAATCAGATTGATATGAAAGATAATCTAAAATGGTGGGCTCATGCTGTTGCTTCTACTGTCAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATCACAAAACATTCATAGACACACCTCTGTTTTCAGCCGCCATTGATGGACTTCGAGCAACTTCTCAATCTCTTCGATTCATTCTGGTTCGAGCGTGGAGTCTTCAAC
AAACATCCTTTTCTATCAAACCTACAACCTCAAATTCAAGATCCCGATTCATTACCCAAGGAATCATTCATCATCCCACGGCTTCCAACGAGATCGATAAGTGAAGATTT
AAGCTCAAAATTAAGCTTTATGTCCAGTTCCAATTCACCCGATTCAGTTCTCTTTTCTCCAAAGCTTCAAACCATCTTTTCCAGCAAGGACATCGCCGGAGCAGAGTCGC
CGGAGACAAGCCGTAAGTTGGAAATTGAGCGTAGGCCAAAAACAGAGTACAGGAGGAGGTTTAGAGGAAGAAGAACGAGACGGTCGGAAAGTCGGAGCCTTTCAGAGCTG
GAATTCGAGGAGTTAAAAGGGTTTATGGATTTGGGATTTGTTTTCTCGGAAGAGGATAAAGGTTCGAGCTTGGCGTCGATAGTTCCCGGATTGAACAGGCTAGGGAAAAA
GGAAGAGAAAGAAAGTAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGAAAATTGGGTGGTGAAATTTCGAGGCCTTATCTTTCAGAAGCTTGGGAAGCTATGGAGG
AAGAAGAAGAAAAAGAGGAGTTGGCGAAGAAACCATTGATGATGAAATGGAGGTTTCCTTCTAATCAGATTGATATGAAAGATAATCTAAAATGGTGGGCTCATGCTGTT
GCTTCTACTGTCAGATGACATTACTCGAATGCAATTGTTCTTCTTTTTGTAAATTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTAGTTTGAATTGTAAATTTTTGGTGCTGTTTCTT
AAATTTTGATCTGATATCAATGTTTGGGATATTGAAAGCTAATG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YRRRFRGRRTRRSESRSLSELEFEELKGFMDLGFVFSEEDKGSSLASIVPGLNRLGKKEEKESKEEEEEEEEEERKLGGEISRPYLSEAWEAMEEEEEKEELAKKPLMMK
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