; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0008748 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0008748
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPMD domain-containing protein
Genome locationchr02:16120178..16120629
RNA-Seq ExpressionIVF0008748
SyntenyIVF0008748
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0025356.1 hypothetical protein E6C27_scaffold1204G00400 [Cucumis melo var. makuwa]1.26e-3564.46Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK---------------------------------VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQ
        M PNLE+EVKEHKDESDSSK                                 ++SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPH V   FEEVGTSKTPVNK AEQ
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK---------------------------------VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQ

Query:  SLRPSALLEEIHRGKMTVGGK
        SLRPSALLEEI RGKMTVGGK
Subjt:  SLRPSALLEEIHRGKMTVGGK

KAA0043323.1 hypothetical protein E6C27_scaffold110G002340 [Cucumis melo var. makuwa]2.33e-3785.39Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSKVI-SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRGKMTVGGK
        M  NLE+EVKEHKDESDSSK   SPLN+HLEGLIEPDSDESLTGPH V S FEEVGTSKT VNKLAEQSLRPS LLEEI RGKMTVGGK
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSKVI-SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRGKMTVGGK

KAA0046555.1 hypothetical protein E6C27_scaffold114G00780 [Cucumis melo var. makuwa]1.43e-3872.57Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSKVI-----------------------------SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRP
        MIPNLEDEVKEHKDESDSSK                               SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRP
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSKVI-----------------------------SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRP

Query:  SALLEEIHRGKMT
        SALLEEIHRGKMT
Subjt:  SALLEEIHRGKMT

KAA0060611.1 hypothetical protein E6C27_scaffold22G004890 [Cucumis melo var. makuwa]5.55e-3775.7Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG
        M PNLE+EVKEHKDESDSSK              VI     SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPH V STFEEVGTSKTPVNK AEQSLRPSALLEEI RG
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG

Query:  KMTVGGK
        KMTVG K
Subjt:  KMTVGGK

TYK02261.1 hypothetical protein E5676_scaffold18G00620 [Cucumis melo var. makuwa]5.55e-3775.7Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG
        M PNLE+EVKEHKDESDSSK              VI     SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPH V STFEEVGTSKTPVNK AEQSLRPSALLEEI RG
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG

Query:  KMTVGGK
        KMTVG K
Subjt:  KMTVGGK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SHN8 PMD domain-containing protein3.6e-2964.46Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK---------------------------------VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQ
        M PNLE+EVKEHKDESDSSK                                 ++SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPH V   FEEVGTSKTPVNK AEQ
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK---------------------------------VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQ

Query:  SLRPSALLEEIHRGKMTVGGK
        SLRPSALLEEI RGKMTVGGK
Subjt:  SLRPSALLEEIHRGKMTVGGK

A0A5A7TIV2 Uncharacterized protein2.5e-3085.39Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK-VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRGKMTVGGK
        M  NLE+EVKEHKDESDSSK   SPLN+HLEGLIEPDSDESLTGPH V S FEEVGTSKT VNKLAEQSLRPS LLEEI RGKMTVGGK
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK-VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRGKMTVGGK

A0A5A7TYW3 Uncharacterized protein1.3e-3172.57Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK-----------------------------VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRP
        MIPNLEDEVKEHKDESDSSK                               SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRP
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK-----------------------------VISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRP

Query:  SALLEEIHRGKMT
        SALLEEIHRGKMT
Subjt:  SALLEEIHRGKMT

A0A5A7V4F4 PMD domain-containing protein2.5e-3075.7Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG
        M PNLE+EVKEHKDESDSSK              VI     SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPH V STFEEVGTSKTPVNK AEQSLRPSALLEEI RG
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG

Query:  KMTVGGK
        KMTVG K
Subjt:  KMTVGGK

A0A5D3BRA8 PMD domain-containing protein2.5e-3075.7Show/hide
Query:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG
        M PNLE+EVKEHKDESDSSK              VI     SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPH V STFEEVGTSKTPVNK AEQSLRPSALLEEI RG
Subjt:  MIPNLEDEVKEHKDESDSSK--------------VI-----SPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRG

Query:  KMTVGGK
        KMTVG K
Subjt:  KMTVGGK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTCCTAATCTTGAGGATGAGGTAAAGGAGCATAAAGATGAGAGCGATAGCAGCAAAGTGATTTCACCATTGAACGATCATCTTGAAGGACTTATAGAGCCAGACAG
TGATGAATCTTTGACGGGACCTCACACAGTTGTTTCGACCTTTGAGGAAGTTGGTACCTCGAAAACTCCCGTCAATAAACTGGCTGAACAATCCTTACGCCCATCTGCTC
TTCTCGAGGAGATTCATCGAGGCAAGATGACAGTGGGGGGGAAAAGACCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATTCCTAATCTTGAGGATGAGGTAAAGGAGCATAAAGATGAGAGCGATAGCAGCAAAGTGATTTCACCATTGAACGATCATCTTGAAGGACTTATAGAGCCAGACAG
TGATGAATCTTTGACGGGACCTCACACAGTTGTTTCGACCTTTGAGGAAGTTGGTACCTCGAAAACTCCCGTCAATAAACTGGCTGAACAATCCTTACGCCCATCTGCTC
TTCTCGAGGAGATTCATCGAGGCAAGATGACAGTGGGGGGGAAAAGACCTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIPNLEDEVKEHKDESDSSKVISPLNDHLEGLIEPDSDESLTGPHTVVSTFEEVGTSKTPVNKLAEQSLRPSALLEEIHRGKMTVGGKRP