; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0008990 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0008990
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPMD domain-containing protein
Genome locationchr08:10590618..10591061
RNA-Seq ExpressionIVF0008990
SyntenyIVF0008990
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031751.1 hypothetical protein E6C27_scaffold506G00140 [Cucumis melo var. makuwa]6.53e-7077.62Show/hide
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KAA0042070.1 hypothetical protein E6C27_scaffold67G005320 [Cucumis melo var. makuwa]3.77e-7278.23Show/hide
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        EINEHKDE+DS KSD HWKRPLKKA V  +DP+ RGSSALG P   H
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KAA0047478.1 hypothetical protein E6C27_scaffold498G00950 [Cucumis melo var. makuwa]9.64e-6878.32Show/hide
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        E+ E KDESDS KSD HWKRPLKKA V G+ P+GRG SAL  P
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KAA0057575.1 hypothetical protein E6C27_scaffold497G00470 [Cucumis melo var. makuwa]3.57e-6876.22Show/hide
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        M P ITLDNILYHWRIC R NTLS+LYL ARSLEPCKHVTQRFTDWW T+H TYF+DN HHL+SSAI  P QP+LPKNRGSNLGG EIRLVEAMA  LE+
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        E+NEH  ESDS KSD HWKRPLKK  V G+ P+GRG SAL  P
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TYK16513.1 hypothetical protein E5676_scaffold21G003220 [Cucumis melo var. makuwa]6.92e-7377.62Show/hide
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        M P ITL+NILYHWRICTR NTLSKLYL+ARSLEPCKHVTQ+FT+WW TRH TYF+DN HHLMSSAI  P QPKLPKNRGSNLGG +IRLVE M   LEE
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        E+ EHKDESDS KSD HWKRPLKKA V  ++P+GRG SALG P
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SHN8 PMD domain-containing protein3.9e-5777.62Show/hide
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        M P ITLDNILYHWRICTR NTLS+LYL ARSLEPCKHVTQRFTDWW T+H TYF+DN HHL+SSAI  P Q +LPKNRG NLGG EIRLVEAMA  LEE
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        E+ EHKDESDS KSD HWKRPLKKA V G+ PN RG SAL  P
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A0A5A7SQC9 PMD domain-containing protein4.6e-5877.62Show/hide
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        M P ITLDNILYHWRICTR NTLS+LYL  RSLEPCKHVTQRFTDWW T+H TYF+DN HHL+SS I  P QP+LPKNRGSNLGG EIRLVEAMA  LEE
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A0A5A7TX42 Uncharacterized protein1.0e-5778.32Show/hide
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A0A5D3CXA5 Uncharacterized protein6.0e-5877.62Show/hide
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A0A5D3D2A0 PMD domain-containing protein5.8e-6178.23Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCACCTACGATCACACTGGATAATATATTATATCACTGGAGAATATGTACGAGGCATAACACTTTATCTAAGTTATACTTGTCCGCTCGTTCGTTAGAGCCTTGCAA
GCATGTGACGCAACGATTTACAGACTGGTGGGCCACAAGGCACGAGACCTATTTTGATGATAACATACATCATTTGATGAGTAGTGCCATTCATCTCCCTTTACAGCCCA
AACTACCCAAGAACCGAGGGAGCAACCTGGGTGGTAATGAAATTCGCTTGGTTGAGGCGATGGCTGCTACTCTCGAGGAGGAGATAAATGAGCATAAAGATGAAAGCGAT
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TTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCACCTACGATCACACTGGATAATATATTATATCACTGGAGAATATGTACGAGGCATAACACTTTATCTAAGTTATACTTGTCCGCTCGTTCGTTAGAGCCTTGCAA
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TTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SRKSDCHWKRPLKKANVPGNDPNGRGSSALGDPTFHH