; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0009167 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0009167
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationchr05:25010640..25011245
RNA-Seq ExpressionIVF0009167
SyntenyIVF0009167
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063558.1 putative serine-rich protein C215.13-like protein [Cucumis melo var. makuwa]1.81e-127100Show/hide
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KAG6586344.1 hypothetical protein SDJN03_19077, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.95e-10386.57Show/hide
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XP_016902457.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103496492 [Cucumis melo]1.04e-12699.5Show/hide
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XP_031737100.1 uncharacterized protein LOC101209679 [Cucumis sativus]5.36e-12799.5Show/hide
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XP_038890503.1 uncharacterized protein LOC120080038 [Benincasa hispida]3.17e-11492.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL69 Uncharacterized protein1.4e-9799.5Show/hide
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A0A1S4E2K6 uncharacterized protein LOC1034964922.4e-9799.5Show/hide
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A0A5A7V7K3 Putative serine-rich protein C215.13-like protein6.2e-98100Show/hide
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A0A6J1FCB9 uncharacterized protein LOC1114441072.9e-7986.07Show/hide
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A0A6J1HLP3 uncharacterized protein LOC1114656731.7e-7986.57Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein4.7e-0547.37Show/hide
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        G+  + ++ S +K  C+CSPTTHPGSFRC +H+ +  Q
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related1.5e-4052.91Show/hide
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        M  TS R  S+  VLRS SPSGRF G       +SSSSAFASSTS+  S  +++FF             RS SP+RVNL+ +  +S  S R+SLD R+ S
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        P N+S+SVS ++    N  + R+      CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSH
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          +RR  ++P+ SRLSIM+KADE
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related2.7e-1334.43Show/hide
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        MAAT  RSS SVLR LS S R +      HR  S S                  C      R+  +   S+  PSV             V+VSS+     
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                 +KR C+CSPTTHPGSFRCS H+ +  +     + S                 LN R+ A+ NSL +IG VE +  +R+LAA L +PSS   
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         RR +FRP+ SR
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related3.1e-4151.61Show/hide
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        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RVNL  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
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        +VSS++    +++      S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ +RR 
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         + P+RSRL+ MSKA++
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related3.1e-4151.61Show/hide
Query:  TSRRSSASVLRSLSPSGRFYG-------HRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFC----------RSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLD-RATSPNRSV
        T+R + ++ LRS SPSGRF G         + SSS FASSTS+  S  +T+FF           RS SP+RVNL  S  ++  S R+S+D R+ SPNRS+
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        +VSS++    +++      S+R CMCSPTTHPGSFRCSLHK + +   Q  A Y+ + LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ V+RAL  LIRPSSHQ +RR 
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         + P+RSRL+ MSKA++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTCTTGACCGTGCGACCTCTCCGAACAGATCCGTCTCTGTTTCTTCTTCTCGCAGCGGTGGAACTAATCGTGTTGTGCAGAGACAGAGCAGTTCGAAGAGGACGTGTATG
TGTTCTCCTACAACTCACCCTGGCTCGTTCCGGTGTAGTCTCCATAAAGGTATAATTTCGCAACCTCCTGCTCTGTACTCGCCGAGTAGGTTGAATGCTCGTAGATCGGC
GATGACGAATTCTCTTGTTAGAATTGGAGGCGTTGAAGGTGATCTCGTGAAACGAGCTCTAGCGGCTTTGATTCGACCTTCCTCTCATCAGCAACGTCGTCGAGTTGATT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAATSRRSSASVLRSLSPSGRFYGHRTSSSSAFASSTSTFSSRSATSFFCRSTSPSRVNLHGSPSVSVPSVRFSLDRATSPNRSVSVSSSRSGGTNRVVQRQSSSKRTCM
CSPTTHPGSFRCSLHKGIISQPPALYSPSRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVKRALAALIRPSSHQQRRRVDFRPKRSRLSIMSKADETL