; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0009232 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0009232
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTF-B3 domain-containing protein
Genome locationchr04:29651956..29655200
RNA-Seq ExpressionIVF0009232
SyntenyIVF0009232
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
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GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044800 - B3 domain-containing transcription factor LEC2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBH2 TF-B3 domain-containing protein1.6e-15594.98Show/hide
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A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X22.7e-158100Show/hide
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A0A6J1F8D4 B3 domain-containing protein At2g36080-like2.9e-12078.67Show/hide
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A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like2.9e-12079Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560006.6e-4552.38Show/hide
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Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360802.0e-5748.66Show/hide
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Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115801.7e-4849.22Show/hide
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Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062507.8e-5450.59Show/hide
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Q9M268 B3 domain-containing transcription factor NGA27.1e-3944.26Show/hide
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        P    S ++  +H  MF+K +TPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL  S           + ++KGLLL+FED SG  WRFRYSYWNSSQSYV+TKGWSRF
Subjt:  PKSSLSLAVTADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRF

Query:  VKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFC-----------SANSYPSHHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAES
        VK+K+LDAGD+V F+R   + D+L+I W+RR  P   D      +G +     + R +            + N Y   HQ R L    Y  S +  H  +
Subjt:  VKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFC-----------SANSYPSHHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAES

Query:  SVQS---------QTVSIGN--SKILRLFGVDLEC
         ++S         Q  S+ +   K LRLFGVD+EC
Subjt:  SVQS---------QTVSIGN--SKILRLFGVDLEC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.4e-5848.66Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFEDESG
        MSIN +S DFH       Q       ++     V  +   +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL         AAAA D+ +KGLLL FEDE G
Subjt:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFEDESG

Query:  KIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPSHHQHRHLPS
        K WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR                              +S  S   +RH+ S
Subjt:  KIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPSHHQHRHLPS

Query:  PPYQSSSDTPHA-ESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSLLNVGSSLSLSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT
            S    PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D  +  FYP   HY  P P++MD +F+ D+N+T
Subjt:  PPYQSSSDTPHA-ESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSLLNVGSSLSLSGRDPTRHTFYP---HYSSPLPHHMDFTFSQDVNQT

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein7.8e-4961.82Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFEDESG
        MSIN +S DFH       Q       ++     V  +   +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL         AAAA D+ +KGLLL FEDE G
Subjt:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFEDESG

Query:  KIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-SAPSPADS
        K WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR  + S +DS
Subjt:  KIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-SAPSPADS

AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.2e-4949.22Show/hide
Query:  MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGD---SADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVV
        +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+ +         +GD   + +KG+LLSFEDESGK W+FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VK+K LDAGDVV
Subjt:  MFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGD---SADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVV

Query:  VFERHRRDGDRLFIGWKRR--SAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWT------RMFCSANSYPS-HHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKI
         F+RHR D  RLFIGW+RR  ++ SPA S V+     V     W+      R   ++ +YP+ H ++ H     Y +  D  HA+S      V  G+S+ 
Subjt:  VFERHRRDGDRLFIGWKRR--SAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWT------RMFCSANSYPS-HHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKI

Query:  LRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSLLNVGSSLSLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF
        +RLFGV+LEC  D  EP P P + N             +H +Y  YS+P P ++ F
Subjt:  LRLFGVDLECQTDMSEPEP-PSLLNVGSSLSLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDF

AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein4.0e-5351.38Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFE
        MS+N++S D H  L    Q        S  +   T  H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL  +A + ++AAA   S++KG+LLSFE
Subjt:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFE

Query:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPS
        DESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR     S+ +  +SAV T S G             A SY  
Subjt:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPS

Query:  HHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSE
         H  R   +   ++ S TP   SSV      +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++
Subjt:  HHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSE

AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein5.6e-5550.59Show/hide
Query:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFE
        MS+N++S D H  L    Q        S  +   T  H      +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL  +A + ++AAA   S++KG+LLSFE
Subjt:  MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADH----LPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFE

Query:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSAN--SY
        DESGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR     S+ +  +SAV T S    G   + ++  ++N  + 
Subjt:  DESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSAN--SY

Query:  PSHHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSE
        PSH ++ H     Y ++  T     S  S +V +G+S+ +RLFGV+LECQ D ++
Subjt:  PSHHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQTVSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCATAAACAACTTCTCTCCTGACTTCCATCAACCTCTTTTCTCTACTTCTCAACTCCCCATCATGCTCAACCCCAAATCCTCCCTCTCCCTCGCCGTCACCGCCGA
CCATCTCCCCATGTTCGAGAAACCCTTAACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCCGAAAAATACTTTCCCCTCTCACCCTCCG
CCGCGGTCGCCACCGCCGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCCGATAAGGGGTTGCTCCTTAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTACTCTTATTGG
AATAGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACCAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAGCGGCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGCCGTGACGGTGA
TAGGTTGTTCATTGGGTGGAAAAGGAGGTCGGCACCGTCTCCGGCGGACAGTGCGGTGGCGACGGGGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAATGTTCT
GTTCTGCAAATTCATATCCTTCTCATCATCAACATCGTCATCTTCCCTCACCGCCATACCAATCTTCTTCCGATACTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACA
GTGTCGATTGGGAATTCAAAGATACTGCGGCTCTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCCGAACCACCGTCGTTGCTCAATGTCGGGTCAAGTTT
AAGTCTATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACCAGACGAAAT
ATCAAGGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACAACTTAGAAGAGAATATGGATGCAAATAAGTACTTTTGAATGGAGTATGGAGTATGGGTGCAGATAAAATCCTCACTCATTTCTTCAGTGTCTTCTAAACAAAAAG
AAAAATAAAATGTCCATAAACAACTTCTCTCCTGACTTCCATCAACCTCTTTTCTCTACTTCTCAACTCCCCATCATGCTCAACCCCAAATCCTCCCTCTCCCTCGCCGT
CACCGCCGACCATCTCCCCATGTTCGAGAAACCCTTAACCCCCAGCGACGTTGGCAAACTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCCGAAAAATACTTTCCCCTCT
CACCCTCCGCCGCGGTCGCCACCGCCGCCGCTGCCGCCGGTGACTCTGCCGATAAGGGGTTGCTCCTTAGCTTTGAAGATGAGTCCGGAAAAATATGGCGGTTCCGTTAC
TCTTATTGGAATAGTAGTCAGAGCTATGTGCTGACCAAAGGGTGGAGCCGGTTTGTTAAAGAGAAGCGGCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGCCG
TGACGGTGATAGGTTGTTCATTGGGTGGAAAAGGAGGTCGGCACCGTCTCCGGCGGACAGTGCGGTGGCGACGGGGAGTGGTGGGGTTGGCGGCGGTGGAGGTTGGACTA
GAATGTTCTGTTCTGCAAATTCATATCCTTCTCATCATCAACATCGTCATCTTCCCTCACCGCCATACCAATCTTCTTCCGATACTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAG
AGTCAAACAGTGTCGATTGGGAATTCAAAGATACTGCGGCTCTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCCGAACCACCGTCGTTGCTCAATGTCGG
GTCAAGTTTAAGTCTATCGGGTCGAGATCCAACCCGCCACACCTTCTACCCACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGGATTTCACTTTCTCACAAGATGTCAACC
AGACGAAATATCAAGGATAGAGATGGGTGGATGTGACGTCCCTGTACTGCAAAAAACCCCACTTTTTATTTATTTGTTTAATTAAATTCCCCACCACTTCACTTGAGAAA
AGTCACCCCATTAAAAGAAGGTGAAAATACAGATCAAAAAAAAAAAGGAAATCCCAGATTTTCTGGCCGACTTCCCAAGGTTATGGATGGAGGGTGTAAACAGAGATGAC
GGATAAGGATGAAAACGAGTGGGGTCCAAGATGAAAGCAAATGGGAAACTAGCTAGGGCCGTTGAAGGTCAGGAATGAGGAATCTATTTTGAGTACTGTTGAGATTCTGG
GTGGAGATTTTTGAGAGATTAGGCTCAAAAATATGAGTAATGGAAAAAAGGAGGGAGAGGGTATGGGGCTGTGTGTTAGTGCTTTTTATTTTGGGTGGGTGAGGATTTGA
TGGATCGTTGACACTCCCGCCTTCTACTCCTACTACTATTTTATAAGTTTTAGCAAAATCTAACCTTTCTTTCTCACCTCATTTATATAAAGATTTACTTCTCACTTGTC
GTGTCCTTATCTGCTCTGCGCCTCTAGAGGTCGCTGTTTAATTTTTCATGCTTTGTCTGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSINNFSPDFHQPLFSTSQLPIMLNPKSSLSLAVTADHLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVATAAAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYW
NSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADSAVATGSGGVGGGGGWTRMFCSANSYPSHHQHRHLPSPPYQSSSDTPHAESSVQSQT
VSIGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSLLNVGSSLSLSGRDPTRHTFYPHYSSPLPHHMDFTFSQDVNQTKYQG