; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0009459 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0009459
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSufE-like protein 1
Genome locationchr01:13024266..13025303
RNA-Seq ExpressionIVF0009459
SyntenyIVF0009459
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR002634 - BolA protein
IPR003808 - Fe-S metabolism associated domain, SufE-like
IPR036065 - BolA-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7037305.1 SufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.60e-15474.06Show/hide
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XP_008447788.1 PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis melo]2.33e-19789.57Show/hide
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XP_038897655.1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial [Benincasa hispida]1.89e-17281.74Show/hide
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A0A0A0K8K1 SufE domain-containing protein5.2e-14484.35Show/hide
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A0A1S3BJ54 LOW QUALITY PROTEIN: sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial1.9e-15489.57Show/hide
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A0A5D3BG00 SufE-like protein 15.0e-15589.86Show/hide
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A0A6J1FMC1 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial3.6e-12173.49Show/hide
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A0A6J1J2B6 sufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial8.9e-12073.49Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P74523 Uncharacterized SufE-like protein slr14191.2e-1541.59Show/hide
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        ++L P +++       VQ   ++ Y+ +   D  V+Y+ DSD+ L KGL ALL+QGL+     EI+ ++PDF+   GLQ SLTPSR NGF N+ K+MQ K
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Q12238 UV-induced protein uvi314.9e-1447.25Show/hide
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        R  RI + L   L   ++ + + SY+H+ H  ++G     ETHF L++VS EF G S V RHRL+Y LL+DE   GLHAL I S+KTPDE+
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Q3E793 BolA-like protein 11.1e-1355.22Show/hide
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        S++H GHAGV+G+   ETHF +++VSK+FEG  L +RHR++Y+LLQDE+   +G+HAL +S KTP E
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Q682I1 Protein BOLA1, chloroplastic1.7e-2749.62Show/hide
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        N  +V  S   +   +++      +SV  S + +K    S  + +R  R++E L++EL PVEL +ED+SYQHAGHAG++G +D ETHFN+K+VSK FEG 
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        +LVKRHRL+Y+LL++EL +GLHALSI +KTP E
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Q84W65 SufE-like protein 1, chloroplastic/mitochondrial1.6e-7853.54Show/hide
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        T  SSI   +   L +P   S   SF R+ I+FQ++   S   +   ++++S SS   LQPIE+LPPKLQ+IVKLFQSVQ+ +AK               
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Query:  ESEKGNGSAVSSSQTDYSVEKAEPESNTEKSVVDSK---LGDKGNQSSD---------VLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGS--
        + E+ + S  SS  +  S+ + + E+N  +  ++SK   + D G +  D          LGSRG RI+E LE+EL+PVEL VED+SYQHAGHA VRGS  
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Query:  -DGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEL
         DGETHFNL++VS  F+GKSLVKRHRLIY+LLQDEL+SGLHALSI AKTP E+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G55805.1 BolA-like family protein1.2e-2849.62Show/hide
Query:  NGSAVSSSQTDYSVEKAEPESNTEKSVVDSKLGDKGNQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRG-SDGETHFNLKVVSKEFEGK
        N  +V  S   +   +++      +SV  S + +K    S  + +R  R++E L++EL PVEL +ED+SYQHAGHAG++G +D ETHFN+K+VSK FEG 
Subjt:  NGSAVSSSQTDYSVEKAEPESNTEKSVVDSKLGDKGNQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRG-SDGETHFNLKVVSKEFEGK

Query:  SLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDE
        +LVKRHRL+Y+LL++EL +GLHALSI +KTP E
Subjt:  SLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDE

AT4G26500.1 chloroplast sulfur E1.2e-7953.54Show/hide
Query:  TTESSIVSQSPRTLFKPFN-SHNFSFLRS-ISFQRLPSKSPSSLSVSASAASSSSSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAK---------------
        T  SSI   +   L +P   S   SF R+ I+FQ++   S   +   ++++S SS   LQPIE+LPPKLQ+IVKLFQSVQ+ +AK               
Subjt:  TTESSIVSQSPRTLFKPFN-SHNFSFLRS-ISFQRLPSKSPSSLSVSASAASSSSSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAK---------------

Query:  --------------------AYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQKKALALLV
                            A+ D ++NVVYEADSDSVLTKGLAALLV+GLS RPV EILR++PDF VLLGLQQSL+PSRNNG LNMLKLMQKKAL L V
Subjt:  --------------------AYLDSDKNVVYEADSDSVLTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQKKALALLV

Query:  ESEKGNGSAVSSSQTDYSVEKAEPESNTEKSVVDSK---LGDKGNQSSD---------VLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGS--
        + E+ + S  SS  +  S+ + + E+N  +  ++SK   + D G +  D          LGSRG RI+E LE+EL+PVEL VED+SYQHAGHA VRGS  
Subjt:  ESEKGNGSAVSSSQTDYSVEKAEPESNTEKSVVDSK---LGDKGNQSSD---------VLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGS--

Query:  -DGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEL
         DGETHFNL++VS  F+GKSLVKRHRLIY+LLQDEL+SGLHALSI AKTP E+
Subjt:  -DGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEL

AT5G09830.1 BolA-like family protein2.2e-0637.21Show/hide
Query:  KRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGSDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSI-SAKTPDE
        ++++  L  +L P+ L V DIS    G  G       + F ++VVS++FEGK L++RHR++   L++E++  +HALSI  A+TP +
Subjt:  KRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGSDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSI-SAKTPDE

AT5G17560.1 BolA-like family protein2.9e-0633.03Show/hide
Query:  SVVDSKLGDKGNQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGSDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHAL-S
        S   S++ D G+    ++ S   +IKE    +LN   + V D+S            DG  H  + VVS  FEG+S V R R++Y  + +ELQ+ +HA+  
Subjt:  SVVDSKLGDKGNQSSDVLGSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGSDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHAL-S

Query:  ISAKTPDEL
        ++ KTP E+
Subjt:  ISAKTPDEL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCATCTCGTAGCTTCCGATTACTCACTACAGAATCCTCAATCGTTTCTCAGTCTCCAAGAACCCTTTTTAAGCCCTTCAATTCCCACAATTTTTCTTTTCTTCGATC
CATTTCTTTCCAAAGATTACCCTCCAAATCCCCGTCTTCACTCTCCGTATCTGCTTCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCCAAGCCTCTGCAACCCATTGAACAACTCCCTC
CCAAGCTTCAAGATATCGTCAAGCTCTTTCAATCGGTTCAGGATTCCAGGGCCAAAGCTTATTTGGATTCCGATAAGAACGTCGTTTACGAGGCCGATTCCGACTCTGTT
CTAACCAAGGGTCTCGCCGCTCTGCTCGTTCAAGGCCTTTCCAATCGTCCTGTGGATGAGATTCTTAGGGTTTCTCCTGATTTTGTTGTTCTTCTTGGCCTTCAACAGAG
CCTTACTCCTTCTAGGAATAATGGGTTTTTGAATATGTTGAAGTTGATGCAGAAGAAGGCGCTTGCGTTGCTTGTGGAATCTGAAAAAGGTAATGGCAGTGCGGTTTCAT
CGTCACAAACAGATTATTCTGTTGAGAAAGCAGAACCAGAATCTAATACTGAGAAATCCGTTGTGGATTCGAAGTTGGGGGACAAAGGAAATCAAAGTTCTGATGTATTA
GGAAGTAGAGGGAAGAGAATAAAGGAGATATTGGAGAGAGAGCTAAATCCAGTGGAATTGTATGTTGAAGATATCTCTTATCAGCATGCAGGGCATGCTGGGGTAAGGGG
TAGTGATGGAGAAACTCACTTTAATTTGAAGGTTGTGTCAAAGGAGTTTGAAGGGAAAAGTTTGGTGAAGAGGCACAGGCTCATTTATAATCTGTTGCAAGATGAGTTGC
AGAGTGGACTCCACGCCTTATCCATCTCAGCAAAGACACCTGATGAACTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSRSFRLLTTESSIVSQSPRTLFKPFNSHNFSFLRSISFQRLPSKSPSSLSVSASAASSSSSKPLQPIEQLPPKLQDIVKLFQSVQDSRAKAYLDSDKNVVYEADSDSV
LTKGLAALLVQGLSNRPVDEILRVSPDFVVLLGLQQSLTPSRNNGFLNMLKLMQKKALALLVESEKGNGSAVSSSQTDYSVEKAEPESNTEKSVVDSKLGDKGNQSSDVL
GSRGKRIKEILERELNPVELYVEDISYQHAGHAGVRGSDGETHFNLKVVSKEFEGKSLVKRHRLIYNLLQDELQSGLHALSISAKTPDEL