; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0009885 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0009885
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionbasic-leucine zipper transcription factor A
Genome locationchr05:25089096..25089767
RNA-Seq ExpressionIVF0009885
SyntenyIVF0009885
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063552.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold329G00590 [Cucumis melo var. makuwa]2.43e-11299.39Show/hide
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XP_008460859.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499607 [Cucumis melo]8.46e-113100Show/hide
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XP_011650096.1 NEDD8-specific protease 1 [Cucumis sativus]1.70e-9890.96Show/hide
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XP_023536962.1 uncharacterized protein LOC111798189 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.35e-7576.05Show/hide
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XP_038890730.1 homeobox protein MOX-2 [Benincasa hispida]9.93e-9589.09Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LL60 Uncharacterized protein4.6e-7590.96Show/hide
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A0A1S3CDF1 uncharacterized protein LOC1034996075.9e-86100Show/hide
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A0A5D3BFQ4 Uncharacterized protein1.3e-8599.39Show/hide
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A0A6J1FDP2 uncharacterized protein LOC1114444391.7e-5675.45Show/hide
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A0A6J1HQB7 uncharacterized protein LOC1114657101.1e-5575.45Show/hide
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         RRH SAS DF YDALSY+LNFDEGYDEGHVDD FPLRNFSSRLPASPPKS PSSS  SREM TA+S
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G01430.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NHL domain-containing protein (TAIR:AT5G14890.1)1.4e-0753.45Show/hide
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        G    R S    FRYD LSYSLNFD+G   GH DDEFP R++S R  A S P S+  S
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AT5G14890.1 NHL domain-containing protein9.1e-0744.44Show/hide
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        FI R GR+         G        FRYD+ SYSLNFD+G   GH +DEFP R++S R  A S P S+  S
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AT5G35090.1 unknown protein1.2e-0931.58Show/hide
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        +L++ LKS  C++ C R         +HHHH +         ++++  +  P       K    +R      ++  + I R+          G+H RRH 
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         +ADF YD  SY+LNFD+G ++ ++ D FPLRNFS+RLP SPP S+ ++ ++
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AT5G62865.1 unknown protein5.5e-0441.03Show/hide
Query:  RLPNFISRLG---RHGRRHSASADFRYDALSYSLNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPASP------PKSSPSSSTA
        R   FI R     R GR   AS  F+YD LSYSLNFD+  +E        LR+FS+R  + P      P  SP+S +A
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGATTCCAACGAACACAAAGGAAACTCCTCATCCTCGACTCTTAAAGAGATGCTCAAATCTTCTCTATGTTTATCTTGTTGCCTTCGTAAGCACCGGAATGGCCA
TCATCATCTTCATCACCATCATCACCACCACCACCACGGCCACCACCGGCGGATGTCGATTTCGTCCGACGGCGATTCGCCTGGACCGCTCACGAGATGTTCTTCTGCAA
AGGATAAATCCAGATCTCGTGAGTGTCATGATATTAAAGATCGACTTCCGAATTTCATTTCTCGACTCGGTCGCCATGGACGTCGTCACTCTGCTTCCGCTGATTTCCGT
TACGATGCACTTAGTTATTCGCTTAATTTCGATGAAGGATATGATGAAGGTCATGTTGATGATGAGTTTCCTCTCAGGAATTTCTCCTCTAGGTTACCGGCTTCTCCTCC
GAAATCCTCACCGTCTTCGTCTACTGCGTCGAGAGAGATGATTACGGCGTTTAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAGTTATAAAAAATGGACGATTCCAACGAACACAAAGGAAACTCCTCATCCTCGACTCTTAAAGAGATGCTCAAATCTTCTCTATGTTTATCTTGTTGCCTTCGTAAGCA
CCGGAATGGCCATCATCATCTTCATCACCATCATCACCACCACCACCACGGCCACCACCGGCGGATGTCGATTTCGTCCGACGGCGATTCGCCTGGACCGCTCACGAGAT
GTTCTTCTGCAAAGGATAAATCCAGATCTCGTGAGTGTCATGATATTAAAGATCGACTTCCGAATTTCATTTCTCGACTCGGTCGCCATGGACGTCGTCACTCTGCTTCC
GCTGATTTCCGTTACGATGCACTTAGTTATTCGCTTAATTTCGATGAAGGATATGATGAAGGTCATGTTGATGATGAGTTTCCTCTCAGGAATTTCTCCTCTAGGTTACC
GGCTTCTCCTCCGAAATCCTCACCGTCTTCGTCTACTGCGTCGAGAGAGATGATTACGGCGTTTAGTTAATTTAATCCAAGCAATCGAATTACATTTATGTGGAATGCGT
TCTGAGGTTTAATTCGCGGCCGATCGTTAAAAATTTTATTACGGCAAACGGATGACGGATCGGTGTGGTTATACTTATGAACGATGAGGTTCACTGGAACGGAAGAGATC
GAATTCCAAAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YDALSYSLNFDEGYDEGHVDDEFPLRNFSSRLPASPPKSSPSSSTASREMITAFS