; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0009943 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0009943
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL63-like
Genome locationchr12:722134..722956
RNA-Seq ExpressionIVF0009943
SyntenyIVF0009943
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0060028.1 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]3.37e-15895.58Show/hide
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XP_008457345.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL63 isoform X1 [Cucumis melo]5.82e-15995.98Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LXP0 RING-type domain-containing protein2.6e-11490.55Show/hide
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A0A1S3C4V4 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X41.1e-128100Show/hide
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A0A1S3C6K6 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X11.1e-12395.98Show/hide
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A0A5A7UXS2 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X14.1e-12395.58Show/hide
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A0A5D3BFR6 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X11.1e-128100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL649.6e-2139.22Show/hide
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Q8L9T5 RING-H2 finger protein ATL21.8e-1935.89Show/hide
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           +EC +CLSEFEE E GR LP C+H FH++CIDMW +SH+ CP+CR  V   A ++ + AA   E  I  ++    V E  S    +D    S SS  
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            S   P
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Q9LUZ9 RING-H2 finger protein ATL635.2e-3548.33Show/hide
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        S  +SL+ F + + SYNSN++LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  F+            H R RRR    +VT + ++    L  FD  V  P    +   
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Query:  KGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAATMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVD
        KGLD SVIS+IPLFVYE  E++     ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR PV+    D
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL53.4e-1836.04Show/hide
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        S +S N  IMLA++I L + V+ +L  H+YA   F   + R RRR S  +  + A    ++          S+    LDP+V+  IP+FVY  +  + + 
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          EC +CLSEFEE + GR LPKC H FH++CID W  S ++CP+CR PV   A   ++           + + + ++G  +S   S SS+ SSSS S
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Q9SLC3 E3 ubiquitin-protein ligase ATL411.6e-1533.04Show/hide
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        S +  NS IMLAA+ SL  V+L V  LH YA         RRR +         P + R     PF++   P +GL+P+VI+++P F   + +   A+  
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Query:  ECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVDCSDAAESGEGEIGRETVNEGQSGQFNSDSSSSSSSSSSSSSSSSIDP
        EC +CLS  +E++  R LP C+H FH++C+D WL + + CPVCR  V        +  E   G   +  V    +    + SSSSS + +  S +S ++ 
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Query:  PPLMSSIGASLIRILSRNRSDGRI
                 S  +IL+R RS  RI
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein6.8e-2239.22Show/hide
Query:  FSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFF--PHPRHRRRTSVTVSYVLAPPRLSRFDSVVPFDLGSAPSKGLDPSVISAIPLFVYES------EEK
        ++ N  IML+++I L + V+ +L  H+YA   F   + R RRR    +  + A PR                 + LD +V+  IP+FVY S      EEK
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Query:  KCAATMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPV
        +     EC +CLSEFEE + GR LPKC H FH++CID W  S + CP+CR PV
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AT3G16720.1 TOXICOS EN LEVADURA 21.3e-2035.89Show/hide
Query:  FSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFF--PHPRHRRRTS----VTVSYVLAPPRLSRFDSVVPFDLGSAPSKGLDPSVISAIPLFVYESEEKKC
        ++ +  IML+A++ L  VV+ ++ LH YA  +      RH RR S     T+ +  A P  +    V         S+GLDP+VI ++P+F +  E  K 
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           +EC +CLSEFEE E GR LP C+H FH++CIDMW +SH+ CP+CR  V   A ++ + AA   E  I  ++    V E  S    +D    S SS  
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Query:  SSSSSSIDP
            S   P
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AT3G62690.1 AtL52.4e-1936.04Show/hide
Query:  SIFSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFF--PHPRHRRRTSVTVSYVLAPPRLSRFDSVVPFDLGSAPSKGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAA
        S +S N  IMLA++I L + V+ +L  H+YA   F   + R RRR S  +  + A    ++          S+    LDP+V+  IP+FVY  +  + + 
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Query:  TMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVDCSDAAESGEGEIGRETVNEGQSGQFNSDSSSSSSSSSSSSSS
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AT4G33565.1 RING/U-box superfamily protein2.9e-2035.19Show/hide
Query:  YNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPHPRHRRRTSVTVSYVLAPPRLSRFDS----VVPFDLGSAPSKGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAATM
        ++ N+    +IS   ++  + LL     CF  + R RR  + +  + +   R   FD     +V   +    + GL+P+VIS+I +  Y  ++     T 
Subjt:  YNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPHPRHRRRTSVTVSYVLAPPRLSRFDS----VVPFDLGSAPSKGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAATM

Query:  ECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVDCSDAAESGE
        +C +CLSEFEE E  R LPKC+H FHL CID WL SH NCP+CR P++       D +E  E
Subjt:  ECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVDCSDAAESGE

AT5G58580.1 TOXICOS EN LEVADURA 633.7e-3648.33Show/hide
Query:  SNSTSLTQFAQSIFSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFP-----------HPRHRRRT---SVTVSYVLAPPRLSRFDSVV--PFDLGSAPS
        S  +SL+ F + + SYNSN++LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  F+            H R RRR    +VT + ++    L  FD  V  P    +   
Subjt:  SNSTSLTQFAQSIFSYNSNIMLAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFP-----------HPRHRRRT---SVTVSYVLAPPRLSRFDSVV--PFDLGSAPS

Query:  KGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAATMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVD
        KGLD SVIS+IPLFVYE  E++     ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR PV+    D
Subjt:  KGLDPSVISAIPLFVYESEEKKCAATMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACATCCAGTAATTCCACTTCACTCACCCAATTCGCTCAAAGCATTTTCTCCTACAACAGCAACATCATGCTCGCCGCTCTCATTTCTCTTCTCTTAGTCGTCCTCTT
CGTCCTTCTCCTCCACGCTTACGCCAATTGCTTCTTCCCTCACCCTCGACACCGCCGTCGTACCTCTGTCACCGTCTCCTACGTCCTTGCTCCGCCTCGTCTCTCGCGTT
TCGATTCCGTCGTTCCCTTTGATTTAGGTTCCGCTCCGTCCAAAGGCCTGGATCCGTCTGTTATCTCTGCCATTCCTCTGTTCGTCTACGAGTCGGAGGAGAAGAAATGT
GCGGCGACGATGGAGTGCGTGATTTGCCTCAGTGAATTCGAAGAACGAGAACTTGGACGACGGTTGCCCAAATGTAGGCATGGATTTCATCTGGAGTGTATTGATATGTG
GTTGAATTCTCACGCGAATTGTCCTGTCTGTAGAGAGCCCGTGATTGGCGAGGCTGTGGATTGTTCCGACGCAGCGGAATCGGGCGAGGGAGAAATCGGAAGGGAGACTG
TGAATGAGGGGCAAAGCGGTCAATTTAACTCTGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGATTGATCCACCACCATTGATGTCGTCG
ATTGGAGCGTCATTGATTCGAATATTGAGTAGAAACAGATCAGACGGAAGGATTTTCCCGTCCTCGAATGGCGAAGAATTGGATGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCCTTCCTCCGGCAACTCCCACTCCCACTCCCACTGCCACCGCCGCTTCTCTGCTACTTTCCACCACCAACAATGACATCCAGTAATTCCACTTCACTCACCCAATTCG
CTCAAAGCATTTTCTCCTACAACAGCAACATCATGCTCGCCGCTCTCATTTCTCTTCTCTTAGTCGTCCTCTTCGTCCTTCTCCTCCACGCTTACGCCAATTGCTTCTTC
CCTCACCCTCGACACCGCCGTCGTACCTCTGTCACCGTCTCCTACGTCCTTGCTCCGCCTCGTCTCTCGCGTTTCGATTCCGTCGTTCCCTTTGATTTAGGTTCCGCTCC
GTCCAAAGGCCTGGATCCGTCTGTTATCTCTGCCATTCCTCTGTTCGTCTACGAGTCGGAGGAGAAGAAATGTGCGGCGACGATGGAGTGCGTGATTTGCCTCAGTGAAT
TCGAAGAACGAGAACTTGGACGACGGTTGCCCAAATGTAGGCATGGATTTCATCTGGAGTGTATTGATATGTGGTTGAATTCTCACGCGAATTGTCCTGTCTGTAGAGAG
CCCGTGATTGGCGAGGCTGTGGATTGTTCCGACGCAGCGGAATCGGGCGAGGGAGAAATCGGAAGGGAGACTGTGAATGAGGGGCAAAGCGGTCAATTTAACTCTGATTC
TTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCGATTGATCCACCACCATTGATGTCGTCGATTGGAGCGTCATTGATTCGAATATTGAGTAGAAACA
GATCAGACGGAAGGATTTTCCCGTCCTCGAATGGCGAAGAATTGGATGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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AATMECVICLSEFEERELGRRLPKCRHGFHLECIDMWLNSHANCPVCREPVIGEAVDCSDAAESGEGEIGRETVNEGQSGQFNSDSSSSSSSSSSSSSSSSIDPPPLMSS
IGASLIRILSRNRSDGRIFPSSNGEELDV