; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010018 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010018
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSASA domain-containing protein
Genome locationchr07:2011192..2012187
RNA-Seq ExpressionIVF0010018
SyntenyIVF0010018
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004141392.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucumis sativus]5.98e-19193.36Show/hide
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XP_022982273.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]1.78e-16179.07Show/hide
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XP_038899610.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Benincasa hispida]5.78e-18390Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4Z7 SASA domain-containing protein1.3e-15090.03Show/hide
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A0A1S3BVE3 probable carbohydrate esterase At4g342151.9e-175100Show/hide
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A0A5A7VA07 Putative carbohydrate esterase1.9e-175100Show/hide
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A0A6J1FS50 probable carbohydrate esterase At4g342155.7e-12778.33Show/hide
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A0A6J1J4F1 probable carbohydrate esterase At4g342151.4e-12879.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.5e-7155.19Show/hide
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        Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      ++  WD ++PP+C+P   ILR +ADL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FANA+         VIGL
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         G+ L NV+ VDA GLPL+ D LHLTT +QV+LG  LA AY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)6.6e-7554.62Show/hide
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        SQ  +    IF+LAGQSNMAGRGGV N T T+   WDGV+PP+C   P ILR  + L W EA+EPLH DID  KTNG+GPGMPFAN + +++ G    +G
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Query:  LVPCAIGGTSIKEWQKGSNLYNHLLSRAEASILR--GGKIKALLWYQGESDTENAEDSELYGGRLKKFLTDIRSDLKIPLLPIIQVGIASGEGEYKEGVR
        LVPC+IGGT + +WQKG  LY   + RA+A++    GG  +A+LWYQGESDT +  D+ +Y  RL KF +D+R+DL+ P LPIIQV +A+G G Y + VR
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        + Q   DL NV  VDA GLPLEPDGLHLTT SQV+LG ++A ++   P+
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)1.0e-7255.19Show/hide
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        Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      ++  WD ++PP+C+P   ILR +ADL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FANA+         VIGL
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        VPCA GGT+IKEW++GS+LY  ++ R E S   GG+IKA+LWYQGESD  +  D+E YG  + + + ++R DL +P LPIIQV IASG G Y + VR  Q
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         G+ L NV+ VDA GLPL+ D LHLTT +QV+LG  LA AY
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)1.0e-7255.19Show/hide
Query:  QQPSPPTDIFLLAGQSNMAGRGGVTNGTLTHQPTWDGVVPPQCSPTPYILRFAADLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPFANAILMDKPGGRTVIGL
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Query:  VPCAIGGTSIKEWQKGSNLYNHLLSRAEASILRGGKIKALLWYQGESDTENAEDSELYGGRLKKFLTDIRSDLKIPLLPIIQVGIASGEGEYKEGVRRGQ
        VPCA GGT+IKEW++GS+LY  ++ R E S   GG+IKA+LWYQGESD  +  D+E YG  + + + ++R DL +P LPIIQV IASG G Y + VR  Q
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Query:  FGIDLVNVMIVDALGLPLEPDGLHLTTPSQVRLGGLLAHAY
         G+ L NV+ VDA GLPL+ D LHLTT +QV+LG  LA AY
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCTACTTATGCCTATTATTTCTCACCACCACCGCCGCCCAAATCCCCTCCGCCTCTCAACAACCATCACCACCCACCGACATTTTCCTCCTCGCCGGACAGAGCAA
CATGGCCGGACGAGGCGGTGTCACCAACGGCACCCTCACTCACCAACCCACGTGGGACGGTGTTGTGCCGCCCCAATGCTCACCAACCCCTTACATCCTCCGCTTCGCAG
CAGATCTCACTTGGGTCGAAGCTCGCGAGCCACTCCATGCGGACATCGATTTTCTCAAGACCAACGGGATTGGGCCGGGCATGCCCTTTGCCAACGCCATTCTAATGGAT
AAACCCGGCGGTCGGACGGTAATCGGTCTGGTACCATGTGCGATCGGCGGGACTTCGATCAAGGAATGGCAAAAGGGATCCAATCTGTACAACCATTTGTTGAGCAGAGC
CGAGGCATCGATTCTGAGAGGGGGGAAAATTAAAGCGCTTCTATGGTATCAAGGTGAAAGCGATACTGAAAATGCAGAAGATTCGGAGCTGTACGGTGGCAGATTGAAGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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