; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010049 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010049
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTransmembrane protein, putative
Genome locationchr01:31206239..31209079
RNA-Seq ExpressionIVF0010049
SyntenyIVF0010049
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6593392.1 hypothetical protein SDJN03_12868, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.69e-5471.54Show/hide
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XP_038899182.1 uncharacterized protein LOC120086544 [Benincasa hispida]4.62e-6682.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K8T0 Uncharacterized protein7.4e-5793.5Show/hide
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A0A1S3CE06 uncharacterized protein LOC1034997986.9e-6399.2Show/hide
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A0A6J1CXJ1 uncharacterized protein LOC1110151788.2e-4069.75Show/hide
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A0A6J1H516 uncharacterized protein LOC111460643 isoform X12.8e-4071.54Show/hide
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A0A6J1KZ93 uncharacterized protein LOC111497700 isoform X12.2e-4071.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G52550.1 unknown protein4.2e-1250Show/hide
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AT3G15780.1 unknown protein1.2e-1438.79Show/hide
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        A +++ P  ST  +H+     FSPP    R + +  +S    + +  +     PP  DPPP ED  +L GL    ++ +DRV+IFLAV FWM LFFW + 
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCATCGACCTCTCTCCACCGTTCTTCACACTCCGTTGCCGCCTTTTCAATCGCCCTTCCTCTCTGTTCAACCTTTCATTTCCGGTCGAAAATTTGCTTCTCTCCACC
TCGTCGCCGCCTTTCACCTCTTTTCTTCTCCTCCAATTCTTATGCTAAATCCGTCGTTTGCAGTGCAGCAGTACGGCCACCGCCGGACTCCGATCCGCCACCCGAGGAGG
ATCCGGTTCGTTTAACAGGTTTACCGGCAATTTTTTCAAAATTTCGGGACAGAGTACAAATTTTCCTTGCTGTGTTATTCTGGATGTCCCTCTTCTTCTGGACTTCTGCA
TTAGATGGGAAAAACAGGCCGAATAAAGGCTCTCGATTTAGACGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTCTCTTTCTCCTCTCTCAATGGCATCGACCTCTCTCCACCGTTCTTCACACTCCGTTGCCGCCTTTTCAATCGCCCTTCCTCTCTGTTCAACCTTTCATTTCCGGTCGA
AAATTTGCTTCTCTCCACCTCGTCGCCGCCTTTCACCTCTTTTCTTCTCCTCCAATTCTTATGCTAAATCCGTCGTTTGCAGTGCAGCAGTACGGCCACCGCCGGACTCC
GATCCGCCACCCGAGGAGGATCCGGTTCGTTTAACAGGTTTACCGGCAATTTTTTCAAAATTTCGGGACAGAGTACAAATTTTCCTTGCTGTGTTATTCTGGATGTCCCT
CTTCTTCTGGACTTCTGCATTAGATGGGAAAAACAGGCCGAATAAAGGCTCTCGATTTAGACGATAGTTTCATAAACAAGCATTCTTTTGTAAAGGATTGTAGGTTTAGT
ATAAATAGTGCTAGGCTACTTGATTATACTTAAGATATAATTCAGCCTTTGACGAGGTAGATAAAGCTTGCTCCATAATGTTGATACCCTCCGCTGTATATTGGTGTAGC
CGCAAAGGAGATAAGGAAAGGCTATGAAACAAATTAAAGCAAACTGTCATGGAAAGTCGTATTTAGTATTGTATTATATTGTTATCAAGTGTGTTGTATATTTCTTGAAC
CCCCCCTCCCACCTCCCATACTCTGTTGTAAGGGACTAATCTTGTTATTGTCCTTGGACCTGCAGGGATCAGGCTAATCTTCTCTGTGTGGTTGCAGTTTTAATGGATGT
CTCTTGAGGGACAACTGACGAGTCTTTTCTCTTTTCTATAGATTGGTATTGGGTTTCATTGACAGGAATTTGGGTTGATGGATGTATTAGAATTGTGTACAGGGAAGTTG
GAGCATGAGAATTGATGGAGGAAGGAATGATCGGTTGGTTCGATATTAGAAATGATTGCCACTATGTGTTTGACACGTTGCTAATAGTTCAACGTTTTAATTGGTCACGT
TGTAATGTGATAGTGTTATGAAAATGAAAAAGATGGTTGGAGGATAAAGAGAAGTGATTTCTTATTATTGGATCATTACAATTCATCCCCAGATGTTTTTCTAAAATCTT
TTTGTTTTATTTTATTTTATTATAGTGGGACAGGGAAGCTCATCATCACTCTAAAAGCTTTCTTTTCTTTTTTTTGGGTCTATTGTTCATGTTATAGTTTAAACGTTTTA
TAAAGTTACCCAAATTGGTTTGTATTGTAATATTCTGTTGTTTTTTGGGTTTCATTGTAATCATTCTTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASTSLHRSSHSVAAFSIALPLCSTFHFRSKICFSPPRRRLSPLFFSSNSYAKSVVCSAAVRPPPDSDPPPEEDPVRLTGLPAIFSKFRDRVQIFLAVLFWMSLFFWTSA
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