; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010216 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010216
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSerpentine receptor class alpha-12
Genome locationchr04:29763030..29766432
RNA-Seq ExpressionIVF0010216
SyntenyIVF0010216
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004149220.1 uncharacterized protein LOC101208663 [Cucumis sativus]0.094.38Show/hide
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XP_008442856.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486624 [Cucumis melo]0.099.78Show/hide
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XP_022982942.1 uncharacterized protein LOC111481636 [Cucurbita maxima]6.58e-25274.41Show/hide
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        ME S +RRR+A+ TETAWCRAVPGGTG A++ALSS++ P+LQ L+NAL +LQNSHP+LKSKLHFN ISSTFSFLTSPTPFVQ+K + + ETSKIL NDQN
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         L       +ISISP QI+LE ELN+N+ W++L+ S + AA  AD+LFV+LYEVG GKW+ +FRLHVAACDRTTAVSLLEELL+LM     GG +K GEV
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        E G+E+LVPR L KK +L+RGLN++S+SVNSLRLTNLKFKDVKSARRSQ+AR Q+N+TET+KILSECK RGIKLSSV+VAAGL+A HSSGSHG DRH RK
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        YGIITL+DCRRFLEPPL S+HFGFYHAAI NSYTI+GGE+LWELA+K+STT+EASKNSNKHFTDMSDLNFL+CR +ENPSLT SGAMRTSLMT+FEDTV 
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        DNSG MQ +IG+ DY+GCAS HGIGPS A+FDT+R+GRLDCAC+YP+PLHSR+QMEAL+ N+K LLVKG
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XP_023527975.1 uncharacterized protein LOC111791031 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.04e-25374.41Show/hide
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        ME S +RRR+A+ TETAWCRAVPGGTG A++ALSS++ P+LQ L+NALH+LQNSHP+LKSKLHFN ISSTFSFLTSPTPFVQ+K + + ETSKIL NDQN
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         L       +ISISP QI+LE ELN N+ W++L+ S + A  AAD+LFV+LYEVG GKW+ +FRLHVAACDRTTAVSLLEELL+LM     GG +K GE+
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        E G+E+LVPR L KK +L+RGLN++S+SVNSLRLTNLKFKDVKSARRSQ+AR Q+N+TET+KILSECK RGIKLSSV+VAAGL+A HSSGSHG DRH RK
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        YGIITL+DCRRFLEPPL SHHFGFYHAAI NSYTI+GGE+LWELA+K+STT+EASKNSNKHFTDMSDLNFL+CR +ENPSLT SGAMRTSLMT+FEDTV 
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        DNSG MQ +IG+ DY+GCAS HG+GPS A+FDT+R+GRLDCAC+YP+PLHSR+QMEAL+ N+K LLVKG
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XP_038903725.1 uncharacterized protein LOC120090244 [Benincasa hispida]4.26e-28485.1Show/hide
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        ME S TRRR+A+ +E AWCRAVPGGTG  ILA+SST  P+L +L+NALHKLQNSHPVLKSKLH+N  SSTFSFLTS TPFVQLK+FG SETSK L NDQN
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        A   GNISISPFQILLERELNDNT WR+L SSG D  ADILFVNLYEVG+GKWVAIFRLHVA CDRTTAVSLLEELLVL+ + G GGG+KK EVE GLE+
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        LVPRNL KKPLLARGLN+LSHSVNS+RLTNLKFKDVKSARRSQLARFQINQTET+KILSECKLRG+KLSSVLVAAGL+AAHSSG HGFDRHHRKYGIITL
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        VDCRRFLEPPLTSH FGFYHAAIFNSYT++GGEDLWELA+KVSTT+EASKNSNKHFTDMSDLNFLMCRV+ENPSLT SGAMRTSLMTIFEDTVFDNSG M
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        QKDI I+DY+GCASIHGIGPSAA+FDTVRNGRLDC C+YPSPLHSR+QMEALL+N+K LLVKG
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LEM0 Uncharacterized protein1.3e-24794.38Show/hide
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        MEHS TRRRLAS+TE AWCRA+PGGTG  ILALSSTEPPSLQR E+ALHKLQNSHPVLKSKLHFNH SSTFSFLTSPTPFVQLKIFGI ETSKILLNDQN
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        A+ GN+SISPFQILLERELNDNTAWRSLNSSGSDAAADILFVNLYEVGIGKWVAIFRLHVAACDRTTAVSLLEELLVLMT+DG GGGEKK EVERGLEEL
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        VPRNLMKKPLLARGLNMLSHSVNS RLTNLKFKDVKSARRSQLARFQINQTET+KILSECKLRGIKLSSVLVAAGL+AAHSSGSHGFDR HHRKYGIITL
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A0A1S3B678 uncharacterized protein LOC1034866245.3e-26299.78Show/hide
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A0A5A7TKZ2 Uncharacterized protein5.3e-26299.78Show/hide
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A0A6J1F529 uncharacterized protein LOC1114422007.1e-19874.2Show/hide
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        ME S +RRR+A+ TETAWCRAVPGGTG A++ALSS++ P+LQ L+NAL +LQNSHP+LKSKLHFN ISS FSF+TSPTPFVQ+K + + ETSKI LNDQN
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         L       +ISISP QI+LE ELN+N+ W++L+ S + A  AAD+LFV+LYEVG GKW+ +FRLHVAACDRTTAVSLLEELL+LM     GG +K GEV
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Query:  ERGLEELVPRNLMKKPLLARGLNMLSHSVNSLRLTNLKFKDVKSARRSQLARFQINQTETNKILSECKLRGIKLSSVLVAAGLMAAHSSGSHGFDRHHRK
        E G+E+LVPR L KK +L+RGLN++S+SVNSLRLTNLKFKDVKSARRSQ+AR Q+N+TET+KILSECK RGIKLSS +VAAGL+A HSSGSHG DRH RK
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Query:  YGIITLVDCRRFLEPPLTSHHFGFYHAAIFNSYTIKGGEDLWELAEKVSTTVEASKNSNKHFTDMSDLNFLMCRVIENPSLTASGAMRTSLMTIFEDTVF
        YGIITL+DCRRFLEPPL SHHFGFYHAAI NSYTI+GGE+LWELA+K+STT+EASKNSNKHFTDMSDLNFL+CR +ENPSLT SGAMRTSLMT+FEDTV 
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Query:  DNSGGMQKDIGINDYVGCASIHGIGPSAAMFDTVRNGRLDCACIYPSPLHSRDQMEALLTNIKTLLVKG
        DNSG MQ +IGI DY+GCAS HGIGPS A+FDT+R+GRLDCAC+YP+PLHSR+QMEAL+ N+K LLVKG
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A0A6J1IXX9 uncharacterized protein LOC1114816364.2e-19874.41Show/hide
Query:  MEHSDTRRRLASSTETAWCRAVPGGTGIAILALSSTEPPSLQRLENALHKLQNSHPVLKSKLHFNHISSTFSFLTSPTPFVQLKIFGISETSKILLNDQN
        ME S +RRR+A+ TETAWCRAVPGGTG A++ALSS++ P+LQ L+NAL +LQNSHP+LKSKLHFN ISSTFSFLTSPTPFVQ+K + + ETSKI LNDQN
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Query:  ALK-----GNISISPFQILLERELNDNTAWRSLNSSGSDAA--ADILFVNLYEVGIGKWVAIFRLHVAACDRTTAVSLLEELLVLMTNDGRGGGEKKGEV
         L       +ISISP QI+LE ELN+N+ W++L+ S + AA  AD+LFV+LYEVG GKW+ +FRLHVAACDRTTAVSLLEELL+LM     GG +K GEV
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Query:  ERGLEELVPRNLMKKPLLARGLNMLSHSVNSLRLTNLKFKDVKSARRSQLARFQINQTETNKILSECKLRGIKLSSVLVAAGLMAAHSSGSHGFDRHHRK
        E G+E+LVPR L KK +L+RGLN++S+SVNSLRLTNLKFKDVKSARRSQ+AR Q+N+TET+KILSECK RGIKLSSV+VAAGL+A HSSGSHG DRH RK
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Query:  YGIITLVDCRRFLEPPLTSHHFGFYHAAIFNSYTIKGGEDLWELAEKVSTTVEASKNSNKHFTDMSDLNFLMCRVIENPSLTASGAMRTSLMTIFEDTVF
        YGIITL+DCRRFLEPPL S+HFGFYHAAI NSYTI+GGE+LWELA+K+STT+EASKNSNKHFTDMSDLNFL+CR +ENPSLT SGAMRTSLMT+FEDTV 
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Query:  DNSGGMQKDIGINDYVGCASIHGIGPSAAMFDTVRNGRLDCACIYPSPLHSRDQMEALLTNIKTLLVKG
        DNSG MQ +IG+ DY+GCAS HGIGPS A+FDT+R+GRLDCAC+YP+PLHSR+QMEAL+ N+K LLVKG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G52610.1 unknown protein5.0e-10343.35Show/hide
Query:  RLASSTETAWCRAVPGGTGIAILALSSTEPPSLQRLENALHKLQNSHPVLKSKLHFNHISSTFSFL--TSPTPFVQLKIFGISETSKILLNDQNALKGNI
        R    TE +WCRA+ GGTGIA++AL  +  P LQ L+N L KLQ  HP L+S + F+  +++FSF+  ++    V++  F    T++I+ +  +      
Subjt:  RLASSTETAWCRAVPGGTGIAILALSSTEPPSLQRLENALHKLQNSHPVLKSKLHFNHISSTFSFL--TSPTPFVQLKIFGISETSKILLNDQNALKGNI

Query:  SISPFQILLERELNDNTAWRSLNSSGSDAAADILFVNLYEVGIG--KWVAIFRLHVAACDRTTAVSLLEELLVLMTNDGRGGGEKKGEVE------RGLE
           P +I+LE E+N NT W + +     + + +  V+LY++     + +  FRL+ AA DRT AV+LL E +     DG G G      E      + +E
Subjt:  SISPFQILLERELNDNTAWRSLNSSGSDAAADILFVNLYEVGIG--KWVAIFRLHVAACDRTTAVSLLEELLVLMTNDGRGGGEKKGEVE------RGLE

Query:  ELVPRNLMKKPLLARGLNMLSHSVNSLRLTNLKFKDVK-SARRSQLARFQINQTETNKILSECKLRGIKLSSVLVAAGLMAAHSSGSHGFDRHHRKYGII
        EL+P     KP  ARG+++L +S+N+ R +NL F D + S RRSQL R ++++ +T K+++ CK RG+KL + L ++ L+AA+SS +        KY ++
Subjt:  ELVPRNLMKKPLLARGLNMLSHSVNSLRLTNLKFKDVK-SARRSQLARFQINQTETNKILSECKLRGIKLSSVLVAAGLMAAHSSGSHGFDRHHRKYGII

Query:  TLVDCRRFLEPPLTSHHFGFYHAAIFNSYTIKGGEDLWELAEKVSTTVEASKNSNKHFTDMSDLNFLMCRVIENPSLTASGAMRTSLMTIFEDTVFDNSG
        TL DCR  LEPPLTS+ FGFYHA I +++ + G E LW+LA++   +  +SKNSNK FTDMSDLNFLMC+ IENP+LT S ++RT+ ++IFED V D S 
Subjt:  TLVDCRRFLEPPLTSHHFGFYHAAIFNSYTIKGGEDLWELAEKVSTTVEASKNSNKHFTDMSDLNFLMCRVIENPSLTASGAMRTSLMTIFEDTVFDNSG

Query:  GMQ-KDIGINDYVGCASIHGIGPSAAMFDTVRNGRLDCACIYPSPLHSRDQMEALLTNIKTLLVKG
          +   +G+ DY+GCASIHG+GPS A+FD +R+G+LDCA +YPSPLHSR+QM+ L+ ++KT+L++G
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ACCCCCAAGCCTTCAACGTCTCGAGAACGCCCTTCACAAACTCCAAAATTCTCATCCTGTTCTTAAATCCAAACTCCATTTCAACCACATTTCTTCCACTTTCTCCTTCC
TTACTTCTCCCACTCCCTTCGTTCAACTTAAGATTTTCGGGATTTCAGAAACCTCCAAAATCCTTCTTAATGATCAAAATGCTCTTAAAGGTAACATTTCCATTTCCCCT
TTTCAGATTCTCCTCGAACGCGAACTCAACGACAACACCGCCTGGCGGAGCCTAAACTCCTCCGGCTCCGACGCAGCGGCGGATATTTTGTTTGTTAACTTGTACGAAGT
TGGGATAGGGAAATGGGTCGCTATATTTCGACTACACGTGGCGGCGTGCGACCGGACCACGGCGGTGTCGTTGCTGGAAGAGCTGCTTGTTTTGATGACCAACGATGGAC
GTGGTGGCGGAGAGAAAAAAGGGGAAGTGGAGCGGGGATTAGAGGAACTTGTTCCTAGAAATTTAATGAAGAAGCCATTGTTGGCCAGAGGATTGAACATGCTTAGCCAC
TCTGTGAATTCATTGAGATTAACGAATCTGAAATTCAAAGATGTAAAATCTGCGAGACGATCGCAGTTGGCTAGGTTTCAGATCAACCAAACCGAAACGAACAAGATTCT
CTCCGAGTGCAAATTGAGAGGGATAAAATTGAGTTCAGTGTTGGTTGCGGCGGGGCTGATGGCGGCTCACAGCTCCGGCAGCCACGGCTTCGACCGCCACCACCGGAAGT
ACGGTATCATAACGCTAGTAGACTGCCGGCGATTTCTTGAGCCTCCGCTGACCTCCCACCATTTCGGATTTTATCATGCTGCCATCTTCAACTCTTACACCATAAAAGGA
GGAGAAGACCTGTGGGAGCTAGCGGAGAAAGTCTCCACAACAGTGGAGGCTTCCAAGAATTCAAACAAGCACTTCACCGACATGTCGGACCTCAACTTTCTGATGTGTCG
TGTCATCGAGAACCCGAGCCTGACGGCTTCGGGGGCAATGAGGACGTCGCTAATGACTATATTCGAAGACACGGTGTTCGACAATTCAGGTGGAATGCAAAAGGATATTG
GCATTAACGACTATGTTGGTTGCGCCTCCATCCATGGCATTGGGCCCTCCGCTGCCATGTTCGACACCGTTAGAAATGGACGGCTAGACTGTGCGTGTATTTATCCATCT
CCATTGCACTCTCGGGACCAAATGGAGGCCCTGCTTACTAACATCAAGACTCTTCTTGTTAAAGGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTCTCATCCTGTTCTTAAATCCAAACTCCATTTCAACCACATTTCTTCCACTTTCTCCTTCCTTACTTCTCCCACTCCCTTCGTTCAACTTAAGATTTTCGGGATTTCAG
AAACCTCCAAAATCCTTCTTAATGATCAAAATGCTCTTAAAGGTAACATTTCCATTTCCCCTTTTCAGATTCTCCTCGAACGCGAACTCAACGACAACACCGCCTGGCGG
AGCCTAAACTCCTCCGGCTCCGACGCAGCGGCGGATATTTTGTTTGTTAACTTGTACGAAGTTGGGATAGGGAAATGGGTCGCTATATTTCGACTACACGTGGCGGCGTG
CGACCGGACCACGGCGGTGTCGTTGCTGGAAGAGCTGCTTGTTTTGATGACCAACGATGGACGTGGTGGCGGAGAGAAAAAAGGGGAAGTGGAGCGGGGATTAGAGGAAC
TTGTTCCTAGAAATTTAATGAAGAAGCCATTGTTGGCCAGAGGATTGAACATGCTTAGCCACTCTGTGAATTCATTGAGATTAACGAATCTGAAATTCAAAGATGTAAAA
TCTGCGAGACGATCGCAGTTGGCTAGGTTTCAGATCAACCAAACCGAAACGAACAAGATTCTCTCCGAGTGCAAATTGAGAGGGATAAAATTGAGTTCAGTGTTGGTTGC
GGCGGGGCTGATGGCGGCTCACAGCTCCGGCAGCCACGGCTTCGACCGCCACCACCGGAAGTACGGTATCATAACGCTAGTAGACTGCCGGCGATTTCTTGAGCCTCCGC
TGACCTCCCACCATTTCGGATTTTATCATGCTGCCATCTTCAACTCTTACACCATAAAAGGAGGAGAAGACCTGTGGGAGCTAGCGGAGAAAGTCTCCACAACAGTGGAG
GCTTCCAAGAATTCAAACAAGCACTTCACCGACATGTCGGACCTCAACTTTCTGATGTGTCGTGTCATCGAGAACCCGAGCCTGACGGCTTCGGGGGCAATGAGGACGTC
GCTAATGACTATATTCGAAGACACGGTGTTCGACAATTCAGGTGGAATGCAAAAGGATATTGGCATTAACGACTATGTTGGTTGCGCCTCCATCCATGGCATTGGGCCCT
CCGCTGCCATGTTCGACACCGTTAGAAATGGACGGCTAGACTGTGCGTGTATTTATCCATCTCCATTGCACTCTCGGGACCAAATGGAGGCCCTGCTTACTAACATCAAG
ACTCTTCTTGTTAAAGGATGAAGGATTGGTTTGGATTTGGGGGGGTGTTTTAGGAACTTCATATTTTATTTTTCTTTTTTCACTACATTATTCTTCTAAATTAAGTGATT
TACGAAAAAAAGGGTTTAAATACTATTTCACTTTCGAGACGTGTTGTTGCAATTAAGTAACGTATAGATAGATTGTTTTAAATATTTTAGCCTATATTTACTAAGACTCG
TTCTATTTTGACTATCAATGTAATACGTAGCTTTGAAGGATATGTACTCTTTACAAAGATGGAGAAACAGATGGTTTAAAAATTCACAATGATATTGAATCAAGTAGATG
TTACTGGTCGATAATAGGTCTTGCTGGATCATAATGTTATAGTTTTCTCTGATTGTGAGTTTACACCAATTGATATTTTAAATGGATTGATGAAGCCTTTTCTGTTGGAT
GGCTCATCTTTTAGTCAAAGTTCAGATTGGAATGGACGATGCATACCCAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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