| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0035174.1 gypsy/ty3 element polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.50e-36 | 66.96 | Show/hide |
Query: MKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSM-EIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWLFKGNHYFQIHKLSNSKKMTV
MKYI SI+NEKSVTT DT+GSS + E GRKKIE + ISKE +ETKK KE+EDK+VDRNKF+K+EMPVFNGN P+ WLF+ + YFQI K+ +KMTV
Subjt: MKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSM-EIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWLFKGNHYFQIHKLSNSKKMTV
Query: FVISFDAPTLDW
VISFD P LDW
Subjt: FVISFDAPTLDW
|
|
| KAA0036991.1 ty3-gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 9.76e-41 | 58.65 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLD+LSTKAD QQQQ+QV+MKY+++ VNEKS TTSD +G S K++ + S E EETKK K++EDK+ +R+KF+KVEMPVF GN P+ WL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
F+ + YFQIHKL++++KMTV +ISFD P LDW+
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
|
|
| KAA0047224.1 transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 9.44e-79 | 98.47 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVF+GNSPNLWL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLD
FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFD PTLD
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLD
|
|
| KAA0066078.1 transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.64e-40 | 55.64 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLD+LSTKAD QQQQ+QV+MKY++++VNEKS T+SD +GSS K++ + + +ETKK K++++K+ +R+KF+KVEMPVF GN P+ WL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
F+ + YFQIHKL++++KMTV VISFD P LDW+
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
|
|
| TYK17139.1 putative retroelement pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.21e-40 | 60.15 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLDQLSTKA+ QQQ++QV+MKY++++VNEKS TTSD +GSS K++ + S E EETKK K++EDK+ +RNKF+KVEM VF GN PN WL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
F+ + YFQIHKL++++KMTV VISFD P LDW+
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SV77 Gypsy/ty3 element polyprotein | 5.7e-31 | 67.86 | Show/hide |
Query: MKYIESIVNEKSVTTSDTKG-SSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWLFKGNHYFQIHKLSNSKKMTV
MKYI SI+NEKSVTT DT+G SSK E GRKKIE + ISKE +ETKK KE+EDK+VDRNKF+K+EMPVFNGN P+ WLF+ + YFQI K+ +KMTV
Subjt: MKYIESIVNEKSVTTSDTKG-SSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWLFKGNHYFQIHKLSNSKKMTV
Query: FVISFDAPTLDW
VISFD P LDW
Subjt: FVISFDAPTLDW
|
|
| A0A5A7T5W7 Ty3-gypsy retrotransposon protein | 7.1e-34 | 58.65 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLD+LSTKAD QQQQ+QV+MKY+++ VNEKS TTSD +G S K++ + S E EETKK K++EDK+ +R+KF+KVEMPVF GN P+ WL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
F+ + YFQIHKL++++KMTV +ISFD P LDW+
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
|
|
| A0A5A7TW94 Transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 | 8.1e-62 | 98.47 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVF+GNSPNLWL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLD
FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFD PTLD
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLD
|
|
| A0A5D3BLG2 Transposon Tf2-1 polyprotein isoform X1 | 1.8e-32 | 55.64 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLD+LSTKAD QQQQ+QV+MKY++++VNEKS T+SD +GSS K++ + + +ETKK K++++K+ +R+KF+KVEMPVF GN P+ WL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
F+ + YFQIHKL++++KMTV VISFD P LDW+
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
|
|
| A0A5D3D379 Putative retroelement pol polyprotein | 1.9e-34 | 60.15 | Show/hide |
Query: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
MKNLDQLSTKA+ QQQ++QV+MKY++++VNEKS TTSD +GSS K++ + S E EETKK K++EDK+ +RNKF+KVEM VF GN PN WL
Subjt: MKNLDQLSTKADNQQQQHQVLMKYIESIVNEKSVTTSDTKGSSKSMEIGRKKIESMTISKEQLEETKKNTKEKEDKSVDRNKFRKVEMPVFNGNSPNLWL
Query: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
F+ + YFQIHKL++++KMTV VISFD P LDW+
Subjt: FKGNHYFQIHKLSNSKKMTVFVISFDAPTLDWY
|
|
