CuGenDBv2

Gene ID	IVF0010552
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	AT-rich interactive domain-containing protein 5A, putative
Genome location	chr02:20722503..20723364
RNA-Seq Expression	IVF0010552
Synteny	IVF0010552
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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e value

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A0A0A0LPS1 Uncharacterized protein

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A0A1S3BW57 uncharacterized protein LOC103494120

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A0A5A7UV79 Putative AT-rich interactive domain-containing protein 5A

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A0A6J1BYA9 uncharacterized protein LOC111006843

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No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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AT1G73885.1 unknown protein

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCTCTGACCATAACCAATGGCGGTGCCACCGCCGGCACCACTGGGGGAATTCTCTACAGAACCTTCACAAGAACTCCTCCTTCTAACTATTTCCTTTTCCGCCGCAA
CGCACTCTTTCATCCCTCAAAAGAAGCCCGCACCCTCCATGTCGTTCAAGCCAAGAAATCCTCCTTCCGAACAGGGCGATTCGACAGTAAGAACCGGAGGAGCTCGACGA
CGATCAAGGAACAGGATAAAGAAGAAGAAGAAGAACGAAATCGGACGGCTGGGATTGAAATGGGCAGTCCCATCGTTGAAAATGCCGGCGTAGTGTTTGATGTGGATGAG
AATTTGCCGGAGTTGCCTGGGCTTCAGCCAGATTTCTGGGAGGGTCCGCAGTGGGATGCCCTAGGCTTCTTCCTAGAGTATTTGTGGGCTTTTGGAATCGTTTTCGCGCT
TATTGCTTGTGGGATTGCTGTCACCACATATAATGAAGGAGCAACTGATTTCAAGGAGACACCTGCATATAAAGAATCAGTTCAAACTAGAGAGATTTTAGAACCAGAGG
CATCAAACCCAGATGTGTTTGAATCCAATCCAACTGAGGTGGCTCCAAGTTTGGAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPLTITNGGATAGTTGGILYRTFTRTPPSNYFLFRRNALFHPSKEARTLHVVQAKKSSFRTGRFDSKNRRSSTTIKEQDKEEEEERNRTAGIEMGSPIVENAGVVFDVDE
NLPELPGLQPDFWEGPQWDALGFFLEYLWAFGIVFALIACGIAVTTYNEGATDFKETPAYKESVQTREILEPEASNPDVFESNPTEVAPSLE

IVF0010552 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome