; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010583 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010583
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT4
Genome locationtig00001945:22176..23857
RNA-Seq ExpressionIVF0010583
SyntenyIVF0010583
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR006712 - HD-ZIP protein, N-terminal
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6577673.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.01e-16188.21Show/hide
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XP_038906160.1 homeobox-leucine zipper protein HAT4 [Benincasa hispida]9.83e-16790.71Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6T6 Homeobox domain-containing protein2.7e-14497.09Show/hide
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A0A1S3BJZ9 homeobox-leucine zipper protein HAT43.3e-150100Show/hide
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A0A5D3CLM5 Homeobox-leucine zipper protein HAT43.3e-150100Show/hide
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A0A6J1E9Y0 homeobox-leucine zipper protein HAT41.5e-12387.86Show/hide
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A0A6J1HKW5 homeobox-leucine zipper protein HAT4-like2.6e-12386.79Show/hide
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P46600 Homeobox-leucine zipper protein HAT13.5e-6456.89Show/hide
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P46601 Homeobox-leucine zipper protein HAT26.7e-6857.05Show/hide
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P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT35.2e-6860.82Show/hide
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        YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  S+S+  P         P  +   P+  ++PWA+ P+  RP    H
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P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-41.4e-6558.67Show/hide
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        KEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+   +T    P+ T  P        P P   + PW +
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Q05466 Homeobox-leucine zipper protein HAT41.8e-7660.47Show/hide
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        +LGL+LGL+     ++L                    +SW         +SD + +  R+ +RGIDVNR PPSTA+  +E+A +SSPNSTVSS +GKRSE
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        RE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL+RCCENL
Subjt:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL

Query:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTR---PFNALHPRS
        TEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP    PQ      PQA   AHH R +  +N WA          F+AL PRS
Subjt:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTR---PFNALHPRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 41.0e-6658.67Show/hide
Query:  PSKHHNLGLTLGLSVDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTA--DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CS
        P K HN+  T         L  +S     +++R S+ G S LRG +VNR   S A  D EEEAA +SSPNS VSS+SG + +  +   G++ + +RA CS
Subjt:  PSKHHNLGLTLGLSVDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTA--DCEEEAA-MSSPNSTVSSVSGKRSEREM--NGEDLDGDRA-CS

Query:  R----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ
        R    G SD+ED   G+ SRKKLRL+KDQ+ VLEE+FKEH+TLNPKQKLALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCC+NLTEENRRLQ
Subjt:  R----GISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQ

Query:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWAS
        KEV ELRALKLSP  YMHMTPPTTLTMCPSCERV+   +T    P+ T  P        P P   + PW +
Subjt:  KEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWAS

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 33.7e-6960.82Show/hide
Query:  NSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-TADCEEE-AAMSSPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGISDEEDG----
        N+W N   S   +   RS LRGIDVNR P +   D E+E A +SSPNSTVSSV SGK+SERE+            ED + +RA CS  G SD+EDG    
Subjt:  NSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPS-TADCEEE-AAMSSPNSTVSSV-SGKRSEREMNG----------EDLDGDRA-CS-RGISDEEDG----

Query:  -ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQF
         ++SRKKLRL+K+Q+ VLEE+FKEH+TLNPKQK+ALAKQL LR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRCCENLT+ENRRLQKEV ELRALKLSP  
Subjt:  -ETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQF

Query:  YMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWAS-PIPTRPFNALH
        YMHM PPTTLTMCPSCERVAV  S+S+  P         P  +   P+  ++PWA+ P+  RP    H
Subjt:  YMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWAS-PIPTRPFNALH

AT4G16780.1 homeobox protein 21.3e-7760.47Show/hide
Query:  NLGLTLGLSVDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE
        +LGL+LGL+     ++L                    +SW         +SD + +  R+ +RGIDVNR PPSTA+  +E+A +SSPNSTVSS +GKRSE
Subjt:  NLGLTLGLSVDSPPLHL--------------------NSWTND-----ASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADC-EEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSE

Query:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL
        RE      D D   SRGISD+EDG+ SRKKLRL+KDQSA+LEE+FK+H+TLNPKQK ALAKQLGLR RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFL+RCCENL
Subjt:  REMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENL

Query:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTR---PFNALHPRS
        TEENRRLQKEV ELRALKLSPQFYMHM+PPTTLTMCPSCE V+VPP    PQ      PQA   AHH R +  +N WA          F+AL PRS
Subjt:  TEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTR---PFNALHPRS

AT4G17460.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein2.5e-6556.89Show/hide
Query:  NLGLTLGLSVDSPP---LHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SEREMN-----GEDLD--GDRA
        N  L L L   S P   L +  W N      + +  +  LR IDVN + P+T D EEE  +SSPNST+SS VSGKR  +ERE       G+DLD   DR+
Subjt:  NLGLTLGLSVDSPP---LHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKR--SEREMN-----GEDLD--GDRA

Query:  CSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKE
         SRG SDEE+   GET RKKLRL+KDQSAVLE++FKEHNTLNPKQKLALAK+LGL  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E LTEENRRL+KE
Subjt:  CSRGISDEED---GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKE

Query:  VQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS
          ELRALKLSP+ Y  M+PPTTL MCPSCERVA P S++                H+ R +  ++PW        F+ + PRS
Subjt:  VQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS

AT5G47370.1 Homeobox-leucine zipper protein 4 (HB-4) / HD-ZIP protein4.8e-6957.05Show/hide
Query:  MIPSKHHNLGLTLGLSVDSPPLHLNSWTNDASSDRTSE-------TGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSERE-------MN
        M+  +   L L+LG S +  PL +N   N + S+              S LR IDVN   PST +CEE+  +SSPNST+SS +SGKRSERE        +
Subjt:  MIPSKHHNLGLTLGLSVDSPPLHLNSWTNDASSDRTSE-------TGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSS-VSGKRSERE-------MN

Query:  GEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCEN
        G+D D    DR  SRG SDEE+  GETSRKKLRL+KDQSA LEE+FKEHNTLNPKQKLALAK+L L  RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LKRC E 
Subjt:  GEDLD---GDRACSRGISDEED--GETSRKKLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCEN

Query:  LTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWAS----PIPTRPFNALHPRS
        LTEENRRLQKE  ELR LKLSPQFY  MTPPTTL MCPSCERV  P S++                H+ RP+  INPW +          F AL PRS
Subjt:  LTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSCERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWAS----PIPTRPFNALHPRS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCCCTTCAAAACACCATAATCTCGGCTTAACCCTTGGATTAAGCGTCGATTCTCCTCCTCTACATCTCAATTCTTGGACTAATGATGCTTCTTCAGATCGAACATC
GGAAACAGGGAGATCGCTTCTCAGAGGCATCGATGTGAATCGGATGCCGCCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGGCGATGTCGAGCCCTAACAGTACGGTGTCGA
GTGTGAGTGGAAAACGTAGCGAACGTGAGATGAACGGTGAAGATCTGGATGGGGATAGAGCTTGTTCGAGAGGGATTAGTGATGAAGAAGACGGTGAAACTTCTAGAAAA
AAGCTTCGGCTTACTAAAGATCAGTCCGCCGTTTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACATAATACTCTCAATCCGAAGCAAAAGTTGGCGTTGGCGAAACAATTGGGTCTCCG
GCCGAGACAAGTCGAAGTTTGGTTCCAAAATAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAATTCCTAAAGAGATGTTGTGAGAATCTAACGGAGG
AGAATAGACGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTCAAACTTTCCCCACAATTCTACATGCACATGACCCCACCCACCACCCTCACCATGTGCCCCTCATGT
GAGCGTGTCGCCGTCCCACCCTCCACATCGGCCCCCCAGCCCACCCTCACGCGAATGCCCCAGGCCCAACCTCAGGCCCATCACCCTCGCCCTATCCACCACATCAATCC
CTGGGCCTCCCCCATACCCACCCGGCCCTTCAACGCCCTTCACCCTCGCTCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAGGCTTTTCCTCTGACACTCTTTTACTTCTTTCCTTTCCATCATTATTTTTATTTTATTTTATTTTATGTGAAAAAACAATTTATTTATTTCTTTTTCCTATTTCCTCT
TTCTATATAATCCCTCTTTTCTCCCCTTCTTCTTGGACCACAACTCTCTTCCTTCTTCCCTTCTTCCCTTCTTCCCTTCTTCTTCAAATTCTCTCTTCAAATTCTCTCTT
CAAATTCATCAAAAATCCAAAACCATGATCCCTTCAAAACACCATAATCTCGGCTTAACCCTTGGATTAAGCGTCGATTCTCCTCCTCTACATCTCAATTCTTGGACTAA
TGATGCTTCTTCAGATCGAACATCGGAAACAGGGAGATCGCTTCTCAGAGGCATCGATGTGAATCGGATGCCGCCGTCGACGGCGGATTGTGAAGAGGAGGCGGCGATGT
CGAGCCCTAACAGTACGGTGTCGAGTGTGAGTGGAAAACGTAGCGAACGTGAGATGAACGGTGAAGATCTGGATGGGGATAGAGCTTGTTCGAGAGGGATTAGTGATGAA
GAAGACGGTGAAACTTCTAGAAAAAAGCTTCGGCTTACTAAAGATCAGTCCGCCGTTTTGGAAGAAAGCTTCAAAGAACATAATACTCTCAATCCGAAGCAAAAGTTGGC
GTTGGCGAAACAATTGGGTCTCCGGCCGAGACAAGTCGAAGTTTGGTTCCAAAATAGAAGAGCAAGGACAAAGTTGAAGCAAACGGAAGTAGATTGCGAATTCCTAAAGA
GATGTTGTGAGAATCTAACGGAGGAGAATAGACGGTTGCAAAAAGAAGTACAAGAACTGAGAGCACTCAAACTTTCCCCACAATTCTACATGCACATGACCCCACCCACC
ACCCTCACCATGTGCCCCTCATGTGAGCGTGTCGCCGTCCCACCCTCCACATCGGCCCCCCAGCCCACCCTCACGCGAATGCCCCAGGCCCAACCTCAGGCCCATCACCC
TCGCCCTATCCACCACATCAATCCCTGGGCCTCCCCCATACCCACCCGGCCCTTCAACGCCCTTCACCCTCGCTCGTAAATACTCCTCGGGCCCATGTCTTCTTATTAAT
TAGGGGTTGAGTTAGTTCTTAGATTTTTCTTTTTCTTTTGTCTTAGCGGCAACAAAGCAAATACCCTTTTTTCTCTTTCTTTGTAATATTTAGGGGAGAGGAAAAGAATT
ATATTGTATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIPSKHHNLGLTLGLSVDSPPLHLNSWTNDASSDRTSETGRSLLRGIDVNRMPPSTADCEEEAAMSSPNSTVSSVSGKRSEREMNGEDLDGDRACSRGISDEEDGETSRK
KLRLTKDQSAVLEESFKEHNTLNPKQKLALAKQLGLRPRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKRCCENLTEENRRLQKEVQELRALKLSPQFYMHMTPPTTLTMCPSC
ERVAVPPSTSAPQPTLTRMPQAQPQAHHPRPIHHINPWASPIPTRPFNALHPRS