; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010615 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010615
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionNAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic
Genome locationtig00001495:218..2465
RNA-Seq ExpressionIVF0010615
SyntenyIVF0010615
Gene Ontology termsGO:0019684 - photosynthesis, light reaction (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016655 - oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, quinone or similar compound as acceptor (molecular function)
GO:0048038 - quinone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001694 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1/F420H2 oxidoreductase subunit H
IPR018086 - NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit 1, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ASY96384.1 NADH dehydrogenase subunit 1 [Cucumis melo subsp. agrestis]4.78e-22190.93Show/hide
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YP_004841840.1 NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit 1 [Cucumis melo subsp. melo]1.13e-22191.46Show/hide
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A0A6M8Y6K2 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic1.1e-17391.46Show/hide
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A0A390 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic3.2e-15781.82Show/hide
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Q09FZ1 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic1.9e-15782.37Show/hide
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Subjt:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK

Query:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV
        YGFWGWNLWRQPIGF +FLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGW++SIPYI   ELFEINKV  V
Subjt:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV

Query:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
        FG TI IFITLAK YLFLFISI TRWTLPR+R+DQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTS QLFSL
Subjt:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL

Q0ZIW3 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic3.8e-15882.37Show/hide
Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSM
        MIIDT +VQDINSFSRLE+LKE YGI+W+LVPI T VLGITIGVL IVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSM

Query:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK
        GPSIAVISILLSY +IPFG  LVL+DL IGVFLWIAISS                     GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL          EAQSK
Subjt:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK

Query:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV
        YGFWGWNLWRQPIGF++FLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWD+SIPYI   E FEINK  EV
Subjt:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV

Query:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
        FG TI IFITLAKTYLFLFI I TRWTLPRLR+DQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTS QL SL
Subjt:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL

Q1KXQ8 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic7.2e-15782.64Show/hide
Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSM
        MIIDT++VQ INSFSRLE LKE YGI+WVL+PI T VLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSM

Query:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK
        GPSIAVISILLSY VIPFGYRLVLADL IGVFLWIAISS                     GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL          EAQSK
Subjt:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK

Query:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV
        YGFWGWNLWRQPIGF++FLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGW++SIPYI   ELF+I K   V
Subjt:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV

Query:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
        FG  I IFITLAKTYLFLFI IATRWTLPRLR+DQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTS QL SL
Subjt:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL

Q2QD36 NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 1, chloroplastic3.4e-17590.91Show/hide
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        MIIDTSQVQDI+SFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFS+
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Query:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK
        GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS                     GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL          EAQSK
Subjt:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK

Query:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV
        YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV
Subjt:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV

Query:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
        FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
Subjt:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G07785.1 NADH dehydrogenase family protein3.8e-1244.05Show/hide
Query:  AGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS
        A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF M P    +  L++ +V+PF Y +VL+D  IG+    AISS
Subjt:  AGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS

ATCG01100.1 NADH dehydrogenase family protein5.1e-15078.51Show/hide
Query:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSM
        MII  + VQ INSF +LE LKE YG++W+ VPI + VLGI  GVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLG+LQALADGTKLLFKENL PSRG+T LFS+
Subjt:  MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSM

Query:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK
        GPSIAVISILLSYSVIPF   LVLADL IG+FLWIAISS                     GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL          EAQSK
Subjt:  GPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL----------EAQSK

Query:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV
        YGFWGWNLWRQPIGF+IFLISSLAECERLPFDLPEAEEEL+AGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLL+SSLFVTVLYLGGW+ISIPYI   ELF+ +   ++
Subjt:  YGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEV

Query:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
        FG TI IFITLAKTYLFLF+SIATRWTLPRLR+DQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL
Subjt:  FGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLFSL

ATMG00516.1 NADH dehydrogenase 1C1.1e-4036.92Show/hide
Query:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLA
        ++ VP  IL  +L + +GV  +V  ER++ A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF M P    +  L++ +V+PF Y +VL+
Subjt:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLA

Query:  DLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECER
        D  IG+    AISS                      LR+AAQ +SYE+ + L ++++ +       S+       +W      P+  V+FLIS LAE  R
Subjt:  DLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECER

Query:  LPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTL
         PFDLPEAE E VAGY  EYS +   LF++  Y N+++ S   T+ + GGW    P IL   +F+     ++ G   SI+ ++ K  LFLF+ I  R   
Subjt:  LPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTL

Query:  PRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLL
        PR R DQL+ LG K  LP+SL  ++
Subjt:  PRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLL

ATMG01120.1 NADH dehydrogenase 1B1.1e-4036.92Show/hide
Query:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLA
        ++ VP  IL  +L + +GV  +V  ER++ A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF M P    +  L++ +V+PF Y +VL+
Subjt:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLA

Query:  DLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECER
        D  IG+    AISS                      LR+AAQ +SYE+ + L ++++ +       S+       +W      P+  V+FLIS LAE  R
Subjt:  DLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECER

Query:  LPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTL
         PFDLPEAE E VAGY  EYS +   LF++  Y N+++ S   T+ + GGW    P IL   +F+     ++ G   SI+ ++ K  LFLF+ I  R   
Subjt:  LPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTL

Query:  PRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLL
        PR R DQL+ LG K  LP+SL  ++
Subjt:  PRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLL

ATMG01275.1 NADH dehydrogenase 1A1.1e-4036.92Show/hide
Query:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLA
        ++ VP  IL  +L + +GV  +V  ER++ A +Q+R GP+  G  G+LQ LADG+KL+ KE + PS  +  LF M P    +  L++ +V+PF Y +VL+
Subjt:  WVLVP--ILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISILLSYSVIPFGYRLVLA

Query:  DLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECER
        D  IG+    AISS                      LR+AAQ +SYE+ + L ++++ +       S+       +W      P+  V+FLIS LAE  R
Subjt:  DLPIGVFLWIAISS---------------------GLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLL---EAQSKYGFWGWNLWRQ----PIGFVIFLISSLAECER

Query:  LPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTL
         PFDLPEAE E VAGY  EYS +   LF++  Y N+++ S   T+ + GGW    P IL   +F+     ++ G   SI+ ++ K  LFLF+ I  R   
Subjt:  LPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGIKFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTL

Query:  PRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLL
        PR R DQL+ LG K  LP+SL  ++
Subjt:  PRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAATTGATACATCACAAGTCCAAGATATCAATTCTTTTTCGAGATTGGAATTCTTAAAAGAATTCTATGGAATTCTATGGGTACTTGTCCCTATTTTGACTACTGT
ATTGGGAATCACAATAGGCGTACTAGTAATTGTATGGTTAGAAAGAGAAATATCCGCAGGAATACAACAACGGATTGGACCTGAATATGCTGGTCCTTTGGGAGTTCTTC
AAGCTTTAGCAGATGGTACAAAACTACTTTTTAAAGAAAATCTGCTTCCATCTAGAGGTGATACTCGCTTATTCAGTATGGGACCATCCATAGCAGTCATATCAATTTTA
CTAAGCTATTCAGTAATTCCTTTTGGTTATCGCCTTGTTTTAGCCGATCTACCTATCGGTGTTTTTTTATGGATTGCCATTTCAAGTGGTCTACGAGCTGCTGCTCAATC
AATTAGTTATGAAATACCATTAACTCTATGTGTATTATCAATATCTCTACTTGAGGCTCAATCAAAATATGGTTTTTGGGGTTGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGGT
TTGTTATTTTTCTAATTTCTTCCTTAGCAGAATGCGAGAGATTACCTTTTGATTTACCAGAAGCAGAAGAAGAATTAGTAGCGGGTTATCAAACTGAGTATTCAGGTATA
AAATTTGGTTTATTTTATGTTGCTTCCTATCTAAATCTATTAGTTTCTTCGTTATTTGTAACTGTTCTTTACTTGGGTGGTTGGGATATCTCTATTCCATACATATTAGG
TTATGAACTATTTGAAATAAATAAAGTGTATGAAGTCTTTGGAATGACAATTAGTATCTTTATTACATTAGCGAAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTATAGCAACAA
GATGGACTTTACCCCGACTAAGAATAGATCAACTATTAAATCTTGGATGGAAATTTCTTTTACCTATATCTCTCGGTAATCTATTATTAACAACATCTTTTCAACTCTTT
TCATTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATAATTGATACATCACAAGTCCAAGATATCAATTCTTTTTCGAGATTGGAATTCTTAAAAGAATTCTATGGAATTCTATGGGTACTTGTCCCTATTTTGACTACTGT
ATTGGGAATCACAATAGGCGTACTAGTAATTGTATGGTTAGAAAGAGAAATATCCGCAGGAATACAACAACGGATTGGACCTGAATATGCTGGTCCTTTGGGAGTTCTTC
AAGCTTTAGCAGATGGTACAAAACTACTTTTTAAAGAAAATCTGCTTCCATCTAGAGGTGATACTCGCTTATTCAGTATGGGACCATCCATAGCAGTCATATCAATTTTA
CTAAGCTATTCAGTAATTCCTTTTGGTTATCGCCTTGTTTTAGCCGATCTACCTATCGGTGTTTTTTTATGGATTGCCATTTCAAGTGGTCTACGAGCTGCTGCTCAATC
AATTAGTTATGAAATACCATTAACTCTATGTGTATTATCAATATCTCTACTTGAGGCTCAATCAAAATATGGTTTTTGGGGTTGGAATTTGTGGCGTCAACCTATAGGGT
TTGTTATTTTTCTAATTTCTTCCTTAGCAGAATGCGAGAGATTACCTTTTGATTTACCAGAAGCAGAAGAAGAATTAGTAGCGGGTTATCAAACTGAGTATTCAGGTATA
AAATTTGGTTTATTTTATGTTGCTTCCTATCTAAATCTATTAGTTTCTTCGTTATTTGTAACTGTTCTTTACTTGGGTGGTTGGGATATCTCTATTCCATACATATTAGG
TTATGAACTATTTGAAATAAATAAAGTGTATGAAGTCTTTGGAATGACAATTAGTATCTTTATTACATTAGCGAAAACTTATTTGTTCTTGTTCATTTCTATAGCAACAA
GATGGACTTTACCCCGACTAAGAATAGATCAACTATTAAATCTTGGATGGAAATTTCTTTTACCTATATCTCTCGGTAATCTATTATTAACAACATCTTTTCAACTCTTT
TCATTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIIDTSQVQDINSFSRLEFLKEFYGILWVLVPILTTVLGITIGVLVIVWLEREISAGIQQRIGPEYAGPLGVLQALADGTKLLFKENLLPSRGDTRLFSMGPSIAVISIL
LSYSVIPFGYRLVLADLPIGVFLWIAISSGLRAAAQSISYEIPLTLCVLSISLLEAQSKYGFWGWNLWRQPIGFVIFLISSLAECERLPFDLPEAEEELVAGYQTEYSGI
KFGLFYVASYLNLLVSSLFVTVLYLGGWDISIPYILGYELFEINKVYEVFGMTISIFITLAKTYLFLFISIATRWTLPRLRIDQLLNLGWKFLLPISLGNLLLTTSFQLF
SL