; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010774 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010774
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description40S ribosomal protein S14
Genome locationchr04:29705364..29706788
RNA-Seq ExpressionIVF0010774
SyntenyIVF0010774
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0048027 - mRNA 5'-UTR binding (molecular function)
GO:0070181 - small ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAF5181185.1 30S ribosomal protein S11 [Thalictrum thalictroides]1.02e-8694.89Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQS
        MSR+K REPK ETVTLGP+VREGEHVFGHVTDLSGRET+VRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQS
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQS

Query:  ALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        ALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  ALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

PIA28209.1 hypothetical protein AQUCO_07200094v1 [Aquilegia coerulea]2.91e-8694.16Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQS
        MS++K REPK ETVTLGP+VREGEHVFGHVTDLSGRET+VRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQS
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQS

Query:  ALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        ALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  ALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

XP_004149195.1 40S ribosomal protein S14-2 [Cucumis sativus]7.80e-8791.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

XP_022946789.1 40S ribosomal protein S14-2-like [Cucurbita moschata]1.11e-8690.67Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMR+GRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

XP_038903512.1 40S ribosomal protein S14-2-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.24e-8690.67Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGR+EDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP6 Uncharacterized protein7.3e-6691.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

A0A1S3B682 40S ribosomal protein S14-27.3e-6691.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

A0A5D3DNR5 40S ribosomal protein S14-2-like7.3e-6691.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

A0A6J1F6L2 40S ribosomal protein S14-27.3e-6691.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

A0A6J1J4Y9 40S ribosomal protein S14-27.3e-6691.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P19950 40S ribosomal protein S141.5e-6386.67Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MSRRKTREPKEE V LGP VREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITALHIKLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTP+PTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

P19951 40S ribosomal protein S142.5e-6386.49Show/hide
Query:  RRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGN
        R+KTREPKEE V LGPAVREGEHVFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLA+QDV+QRCKELGITALHIKLRATGGN
Subjt:  RRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGN

Query:  KTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        KTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTP+PTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  KTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

P42036 40S ribosomal protein S14-32.3e-6485.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK E VTLGPAVREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

Q9CAX6 40S ribosomal protein S14-21.3e-6485.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK ETVTLGP+VREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

Q9SIH0 40S ribosomal protein S14-11.1e-6384Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK + VTLGP+VREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein8.0e-6584Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK + VTLGP+VREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein9.4e-6685.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK ETVTLGP+VREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein1.6e-6585.33Show/hide
Query:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG
        MS+RKT+EPK E VTLGPAVREGE VFG             HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDV+QRCKELGITA+H+KLRATG
Subjt:  MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFG-------------HVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATG

Query:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
        GNKTKTPGPGAQSALRALARSGM+IGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL
Subjt:  GNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

ATCG00750.1 ribosomal protein S112.4e-0530.77Show/hide
Query:  VTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRK
        VTD+ GR       G    +  R   +P+AA  AA +  +   + G+    +++        K PG G  +ALRA+ RSG+ +  + DVTP+P +  R  
Subjt:  VTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQSALRALARSGMRIGRIEDVTPIPTDSTRRK

Query:  GGRR
          RR
Subjt:  GGRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGAGAAGGAAGACTAGAGAGCCTAAGGAGGAAACTGTCACTCTTGGCCCTGCTGTTCGTGAAGGAGAGCATGTCTTTGGTCATGTGACCGATCTGTCTGGTCGGGA
AACACTTGTTCGCATCACTGGTGGTATGAAGGTGAAAGCTGATAGAGATGAATCGTCGCCTTATGCTGCCATGCTTGCTGCCCAAGACGTTTCTCAAAGATGCAAGGAAC
TTGGCATCACTGCTTTACACATAAAGCTTCGGGCTACTGGTGGAAATAAAACCAAAACTCCTGGACCTGGTGCTCAATCAGCTCTTAGAGCCCTTGCACGTTCAGGCATG
AGGATCGGTCGTATAGAGGATGTAACTCCAATACCTACCGACAGCACTCGAAGAAAGGGTGGAAGGAGAGGAAGAAGACTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGAGAAGGAAGACTAGAGAGCCTAAGGAGGAAACTGTCACTCTTGGCCCTGCTGTTCGTGAAGGAGAGCATGTCTTTGGTCATGTGACCGATCTGTCTGGTCGGGA
AACACTTGTTCGCATCACTGGTGGTATGAAGGTGAAAGCTGATAGAGATGAATCGTCGCCTTATGCTGCCATGCTTGCTGCCCAAGACGTTTCTCAAAGATGCAAGGAAC
TTGGCATCACTGCTTTACACATAAAGCTTCGGGCTACTGGTGGAAATAAAACCAAAACTCCTGGACCTGGTGCTCAATCAGCTCTTAGAGCCCTTGCACGTTCAGGCATG
AGGATCGGTCGTATAGAGGATGTAACTCCAATACCTACCGACAGCACTCGAAGAAAGGGTGGAAGGAGAGGAAGAAGACTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSRRKTREPKEETVTLGPAVREGEHVFGHVTDLSGRETLVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGITALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQSALRALARSGM
RIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL