| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAE8651124.1 hypothetical protein Csa_000954 [Cucumis sativus] | 8.76e-136 | 96.68 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFV-DAADAADAKYELD
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFV DAADAADAKYELD
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFV-DAADAADAKYELD
Query: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRS
GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSYSRSP DPRGRSYSRS
Subjt: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRS
Query: RSRSYSRSYSR
RSRSYSRSYSR
Subjt: RSRSYSRSYSR
|
|
| XP_008443002.1 PREDICTED: serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 [Cucumis melo] | 7.11e-143 | 100 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| XP_011652066.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.39e-137 | 97.14 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSYSRSP DPRGRSYSRSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| XP_011652068.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.09e-137 | 97.14 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSYSRSP DPRGRSYSRSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| XP_031739397.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 [Cucumis sativus] | 7.60e-136 | 96.68 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFV-DAADAADAKYELD
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFV DAADAADAKYELD
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFV-DAADAADAKYELD
Query: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRS
GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSYSRSP DPRGRSYSRS
Subjt: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRS
Query: RSRSYSRSYSR
RSRSYSRSYSR
Subjt: RSRSYSRSYSR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LGW4 RRM domain-containing protein | 2.2e-106 | 97.14 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPR RGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYS RHSPLRYS+SPHYDRKYSR PEYYSPARSRRYSRSPRG RYREQSYSRSP DPRGRSYSRSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| A0A1S3B7U0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 2.5e-110 | 100 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSRSR
Query: SRSYSRSYSR
SRSYSRSYSR
Subjt: SRSYSRSYSR
|
|
| A0A6J1DCY5 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 1.2e-96 | 91.04 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRR+RSPSPR RGGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD ADA DAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSR
QVLLG ELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSY+Y R SPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPA+S RYSR SPR RRYRE+SY RSPYD RGRSYSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSR
Query: SRSRSYSRSYSR
SRSRSYSRSY R
Subjt: SRSRSYSRSYSR
|
|
| A0A6J1KYI3 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X3 | 6.1e-88 | 84.91 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRR RS SPR GGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFG+FGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++D ADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSR
QVLLG ELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSRGRSYSY R SPL+YS+SP + RKYSRSPEYYSPARSRRYSR SPR + +RE+SYSRSPY+ R R YSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSR
Query: SRSRSYSRSYSR
SRSRS SRSYSR
Subjt: SRSRSYSRSYSR
|
|
| A0A6J1L0E4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 isoform X2 | 6.1e-88 | 84.91 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
MRGRSYSYSPSPPRSYGRR RS SPR GGR RDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFG+FGPLKDIYLPRDYYSG+PRGFGFVQ++D ADAADAKYELDG
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDG
Query: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSR
QVLLG ELTVVFAEENRKRPE+MRARDSSRGRSYSY R SPL+YS+SP + RKYSRSPEYYSPARSRRYSR SPR + +RE+SYSRSPY+ R R YSR
Subjt: QVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRYREQSYSRSPYDPRGRSYSR
Query: SRSRSYSRSYSR
SRSRS SRSYSR
Subjt: SRSRSYSRSYSR
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O75494 Serine/arginine-rich splicing factor 10 | 4.1e-25 | 42.86 | Show/hide |
Query: TSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSY
TSL VRN+ D R EDLR FGR+GP+ D+Y+P D+Y+ PRGF +VQF D DA DA + LD + + G ++ + FA+ +RK P +M+A++ S S
Subjt: TSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSY
Query: SRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEY-------YSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYS-RSPYDPRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
+ R SRS Y+R+ SRS + YSP SR P GR R +S+S + R RS+SRS+S S SRS S+
Subjt: SRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEY-------YSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYS-RSPYDPRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.3e-31 | 47.7 | Show/hide |
Query: RGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGG----RRRDLPTS----------LLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD
R RS SYSP P R RSP PR R G R R+ P+S LL+RNL D RP DLR F RFGPLKDIYLPR+YY+GEPRGFGFV++
Subjt: RGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSRGG----RRRDLPTS----------LLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVD
Query: AADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSR--RHSPLRYSRS-------PHYDRKYS--RSPEYYSP-ARSRRYSRSPR
A DAA+A ++ +V+ G E+ +VFAEENRK P+EMR + + GR Y R SP R RS P + ++S R + YSP RSR SRSP
Subjt: AADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSR--RHSPLRYSRS-------PHYDRKYS--RSPEYYSP-ARSRRYSRSPR
Query: GRRYRE--QSYSRSPYDP------RGRSYSRSRSRSYSR
R RE RSP + R R SRSRSRS SR
Subjt: GRRYRE--QSYSRSPYDP------RGRSYSRSRSRSYSR
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 7.0e-33 | 47.3 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
MR S Y P R YG R RSP P GGRR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVDA D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
Query: AADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPY-
A +A+ ++ + G E+TVV A E+RKRPEEMR + +R R S SR S R SRS R SRSP S +RS RYR +SYS +P
Subjt: AADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPY-
Query: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
PRG RSYS Y
Subjt: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 1.3e-55 | 63.18 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R G R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+D ADAA+AK+++
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
Query: DGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSP--YD
DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMR RD + RR SP RYSRSP R SRS Y SP R SR SP+ RRY +E+SYSRSP
Subjt: DGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSP--YD
Query: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
R RS S R +S+SRS R
Subjt: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 2.0e-56 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
Query: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPYD--
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY +SYSRSP
Subjt: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPYD--
Query: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
RGRS + R +SRS S S R
Subjt: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.4e-57 | 64.41 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
Query: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPYD--
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY +SYSRSP
Subjt: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPYD--
Query: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
RGRS + R +SRS S S R
Subjt: PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 1.1e-57 | 64.06 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGFVQF+D ADAADAK+ +D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYELD
Query: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPYDPR
G +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ GR + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY +SYSRSP
Subjt: GQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSPYDPR
Query: GRSYSRSRSRSYSRSYS
R S + R SRS S
Subjt: GRSYSRSRSRSYSRSYS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 1.8e-55 | 60.68 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG------------EPRGFGFVQFVD
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R GGR RDLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G +PRGFGFVQF+D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR-GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSG------------EPRGFGFVQFVD
Query: AADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-R
ADAADAK+ +DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMRAR+ G + RR P YSRS P R SRS +YYSP R + R SPR RY
Subjt: AADAADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRS----PHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-R
Query: EQSYSRSPYD--PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
+SYSRSP RGRS + R +SRS S S R
Subjt: EQSYSRSPYD--PRGRSYS--RSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 9.4e-57 | 63.18 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
MRGR SY+PSPPR YGRR RSPSPR R G R DLPTSLLVRNLRHDCR EDLR F +FGP+KDIYLPRDYY+G+PRGFGF+QF+D ADAA+AK+++
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSPRSR--GGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAADAADAKYEL
Query: DGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSP--YD
DG +LLG ELTVVFAEENRK+P EMR RD + RR SP RYSRSP R SRS Y SP R SR SP+ RRY +E+SYSRSP
Subjt: DGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSP---HYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSR--SPRGRRY-REQSYSRSP--YD
Query: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
R RS S R +S+SRS R
Subjt: PRGRSYSRSRSRSYSRSYSR
|
|
| AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 30 | 5.0e-34 | 47.3 | Show/hide |
Query: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
MR S Y P R YG R RSP P GGRR SLLVRN+ DCRPE+LR F RFGP++D+Y+PRDYYSG+PRGF FV+FVDA D
Subjt: MRGRSYSYSPSPPRSYGRRYRSPSP----------RSRGGRRRDLPTSLLVRNLRHDCRPEDLRGLFGRFGPLKDIYLPRDYYSGEPRGFGFVQFVDAAD
Query: AADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPY-
A +A+ ++ + G E+TVV A E+RKRPEEMR + +R R S SR S R SRS R SRSP S +RS RYR +SYS +P
Subjt: AADAKYELDGQVLLGHELTVVFAEENRKRPEEMRARDSSRGRSYSYSRRHSPLRYSRSPHYDRKYSRSPEYYSPARSRRYSRSPRGRRYREQSYSRSPY-
Query: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
PRG RSYS Y
Subjt: ---DPRGRSYSRSRSRSYSRSY
|
|
