; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010859 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010859
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionEncodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).
Genome locationchr04:31485045..31486497
RNA-Seq ExpressionIVF0010859
SyntenyIVF0010859
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137753.1 uncharacterized protein LOC101220657 isoform X1 [Cucumis sativus]3.08e-6086.89Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKAS-QNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLS
        MSEKK SD SSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSS   FK S Q+SEVGGKS A+SY PKTEG+SKYKECKNGSTSSRE+GSFYQEQRTNPCHLS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKAS-QNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLS

Query:  SSIYYGGQDIYTDQNPGTGFNS
        SSIYYGGQD+YT QNP TGFNS
Subjt:  SSIYYGGQDIYTDQNPGTGFNS

XP_008442495.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X1 [Cucumis melo]4.03e-7799.19Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

XP_008442497.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X2 [Cucumis melo]1.52e-7498.37Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKT GSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

XP_016899678.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X3 [Cucumis melo]3.35e-7396.75Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFK   NSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

XP_016899679.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486348 isoform X4 [Cucumis melo]1.26e-7095.93Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFK   NSEVGGKSHAVSYSPKT GSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B5B7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X11.9e-5899.19Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

A0A1S3B5T7 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X21.4e-5698.37Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKT GSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

A0A1S4DUM2 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X41.4e-5395.93Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFK   NSEVGGKSHAVSYSPKT GSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

A0A1S4DUN5 uncharacterized protein LOC103486348 isoform X32.0e-5596.75Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFK   NSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

A0A5D3DN19 Uncharacterized protein1.9e-5899.19Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
        MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSS

Query:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV
        SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSS+
Subjt:  SIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39855.1 unknown protein2.1e-0436.67Show/hide
Query:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKT--EGSSKYKEC------KNGSTSSREVGSFYQEQR
        M +KK+  GSS S           SS S +HIFGP  S S SS        +     AV+    T   G++KY+        + G  S  +    YQ + 
Subjt:  MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKT--EGSSKYKEC------KNGSTSSREVGSFYQEQR

Query:  TN-PCHLSSSIYYGGQDIYT
        T  PC+LSSSIYYGGQD Y+
Subjt:  TN-PCHLSSSIYYGGQDIYT

AT3G55646.1 unknown protein2.9e-0638.68Show/hide
Query:  TSSLSS-NHIFGPVFSSSSSS---------FKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYK--ECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDIYT
        +SSLSS +HIFGP  SSSSSS         F      ++G +    S      G  KY+    K   ++ +E  S+Y E+   PCHLSSS+YYGGQ+ Y+
Subjt:  TSSLSS-NHIFGPVFSSSSSS---------FKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYK--ECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDIYT

Query:  DQNPGT
             T
Subjt:  DQNPGT

AT5G02020.1 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).3.8e-0638.26Show/hide
Query:  EKKASDG---SSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSSSSF---KASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNP
        +KKAS     SS S TS+LFG R+  SS SS+ I G +F   S         Q +  GG      ++ KT  +    + +N          + Q+QR  P
Subjt:  EKKASDG---SSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSSSSF---KASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNP

Query:  CHLSSSIYYGGQDIY
        CHLSSSIYYGG D+Y
Subjt:  CHLSSSIYYGGQDIY

AT5G02020.2 Encodes a protein involved in salt tolerance, names SIS (Salt Induced Serine rich).9.9e-0736.92Show/hide
Query:  EKKASDG---SSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSSSSF---KASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNP
        +KKAS     SS S TS+LFG R+  SS SS+ I G +F   S         Q +  GG      ++ KT  +    + +N          + Q+QR  P
Subjt:  EKKASDG---SSFSFTSDLFGIRDT-SSLSSNHIFGPVFSSSSSSF---KASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNP

Query:  CHLSSSIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSVSV
        CHLSSSIYYGG D+Y      T  NS+V +
Subjt:  CHLSSSIYYGGQDIYTDQNPGTGFNSSVSV

AT5G59080.1 unknown protein2.9e-0637.38Show/hide
Query:  ASDGSSFSFTSDLFGIRDTS-SLSSNHIFGPVF-SSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSSSIY
        +S  +S SFT++LFG +D S   SS+ IF  +F   S  S +   NS                        K+GS + R      QE R  PCHLSSS+Y
Subjt:  ASDGSSFSFTSDLFGIRDTS-SLSSNHIFGPVF-SSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSSSIY

Query:  YGGQDIY
        YGGQD+Y
Subjt:  YGGQDIY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGAGAAGAAAGCATCTGATGGCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTCGGGATCAGAGACACTTCTTCGCTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCAAGGCCTCCCAGAACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACATGCTGTTTCGTACTCCCCCAAAACTGAAGGCAGTTCCAAATATAAGGAAT
GCAAGAATGGGAGCACATCAAGCAGAGAGGTGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGCGGTCAGGATATCTAT
ACTGATCAAAATCCGGGAACTGGGTTCAACTCTTCTGTGAGTGTTGCATTATTTTCTGTCAAAATTATCCGTTGTTTGTTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGAGAAGAAAGCATCTGATGGCTCATCTTTTTCCTTCACTTCTGATCTCTTCGGGATCAGAGACACTTCTTCGCTCTCTTCTAATCACATTTTTGGCCCTGTTTT
CTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCAAGGCCTCCCAGAACTCCGAAGTCGGTGGTAAATCACATGCTGTTTCGTACTCCCCCAAAACTGAAGGCAGTTCCAAATATAAGGAAT
GCAAGAATGGGAGCACATCAAGCAGAGAGGTGGGTTCGTTTTATCAAGAACAGAGAACAAACCCATGTCATCTTAGTTCTTCAATCTACTATGGCGGTCAGGATATCTAT
ACTGATCAAAATCCGGGAACTGGGTTCAACTCTTCTGTGAGTGTTGCATTATTTTCTGTCAAAATTATCCGTTGTTTGTTCTGAACAATAATCTTCTATGTTGCCAGTTG
AAGAGAGATGGGGGAGAAGATGATTCTGGTGGTGCTTCCAGAGGAAATTGGTGGCAAGGGTCTCTTTACTATTAAGAATCTCACCCTGCCATCAAGGTTTTACTACAAAT
CCTTTGGTTAACAGCAAATCTTAAGCTCAAAATGCAAGTTAAATTAGCTATTTGATCCTTTTATTCACATGCTCTTTTGCAGATGCAAGATACATTCTATTACCATTAAT
ATAATATATGGAGATCAATTATACAGGATTTTACCAGCCAAAATGATAGTCAGGACGTCTAATTTTAAAGTTAGAGAGGTTCAAAATTTTATACGTAACATTTGTGGATG
TTACACTATCATGATATTGGTTATTAACATCATTCCAGCAAAGAACTAGAATGTTGTTTATCAAGTTGTATTTGAAGTCTGTATATAATATATATATATATATATATTTG
GTAAGAAATGGATATGAAGACGAGGGAATCTGGAATTGTTTGCGCATAAGATATAGTCTTATCCTTATCTTCATATACCCTCATCTCAGCTTTTCTTATACTTTAATGAC
TTTATCCATTGTATAATTCTCAGATGTTTCTTCTATTGGTGTAAATGTGCATAAATGTGTTTTGAGGTAATTTACCAACATCAGCATATACATTCTTTTAAAGTAAAAAA
GGTTGCGTTTTGAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSEKKASDGSSFSFTSDLFGIRDTSSLSSNHIFGPVFSSSSSSFKASQNSEVGGKSHAVSYSPKTEGSSKYKECKNGSTSSREVGSFYQEQRTNPCHLSSSIYYGGQDIY
TDQNPGTGFNSSVSVALFSVKIIRCLF