; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0010888 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0010888
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionSerine-rich protein-related
Genome locationchr02:12500723..12501427
RNA-Seq ExpressionIVF0010888
SyntenyIVF0010888
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8653030.1 hypothetical protein Csa_019924 [Cucumis sativus]1.11e-4783.33Show/hide
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TYK10353.1 Serine-rich protein-related [Cucumis melo var. makuwa]1.78e-54100Show/hide
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XP_008443918.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487396 [Cucumis melo]3.90e-68100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYY6 Uncharacterized protein1.5e-4283.64Show/hide
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A0A1S3B8Q0 uncharacterized protein LOC1034873964.2e-50100Show/hide
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A0A5A7U6S1 Serine-rich protein-related4.2e-50100Show/hide
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A0A5D3CER3 Serine-rich protein-related1.2e-39100Show/hide
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A0A6J1EG01 uncharacterized protein LOC1114339806.8e-3270.54Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G13227.1 serine-rich protein-related1.2e-0444.44Show/hide
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related5.5e-1038.04Show/hide
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related2.1e-0941.18Show/hide
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        RKCLCSPTTHPGSFRCSFH R  H+ S T +SS+ +                  +LA  N+L            R+    + KPSS    RR  F PR S
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        RF
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related3.6e-0934.55Show/hide
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        PR SR   M+
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related3.6e-0934.55Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTCAAAATCTGGATCCTCCACTCACAAATTCCCGTCCACCGCCGGTTCACGGAAGTGTCTCTGTTCTCCTACCACCCATCCCGGCTCTTTCCGCTGCAGTTTTCA
CCGCACCCGCCACAAGATCTCTTCCACTAGGTCTTCATCTTCTGCGGAGTTGGAGCTTGCCAAGGCTAATGCCTTGAGAGCATTTCTGCTCCAGATGATTAAGCCGTCCA
GTAACGATGTTCAACGCCGGAGGAATTTTCATCCTCGACCTTCCAGGTTTTGTTTGATGAACGATCATGGAACTGGATTGACTGTTTCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGAAAAAACCTCAAACTCCAAAACACCAATCTTGTTCCACACAGTTTTCCCTAAAAATCAGTCCACGAGAAAGAATTAATCACTCCCAAATTTTCAATTCAATGGCCT
CAAAATCTGGATCCTCCACTCACAAATTCCCGTCCACCGCCGGTTCACGGAAGTGTCTCTGTTCTCCTACCACCCATCCCGGCTCTTTCCGCTGCAGTTTTCACCGCACC
CGCCACAAGATCTCTTCCACTAGGTCTTCATCTTCTGCGGAGTTGGAGCTTGCCAAGGCTAATGCCTTGAGAGCATTTCTGCTCCAGATGATTAAGCCGTCCAGTAACGA
TGTTCAACGCCGGAGGAATTTTCATCCTCGACCTTCCAGGTTTTGTTTGATGAACGATCATGGAACTGGATTGACTGTTTCTTGAAATCCATTTTTTTAGTTGGTTAATC
AGTCGTACGTACGTAGTAGATCTGGATATGTCTGTTTTTGTTCGTGATTTCGATCTTCTTCCGTCGCTGAATTTCCAGATGAGTTTGTAGATACAGTACTCCGTTTGTGT
ACAGATCATTTCGAGAGGGCATTGGATCGATCTTGATGACTCTACAAGTCTTTCTTGAAATAGAATTAGTTTCTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTGCATCTTTT
CCTTTGTTTCTTCTTCTCTGATTCTTGCAACTGGAAAATGCAAGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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