; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0011101 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0011101
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionActin cytoskeleton-regulatory complex protein pan1
Genome locationchr08:24180763..24183800
RNA-Seq ExpressionIVF0011101
SyntenyIVF0011101
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KXX4 Uncharacterized protein1.3e-21796.3Show/hide
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A0A5D3C4F3 Actin cytoskeleton-regulatory complex protein pan11.1e-227100Show/hide
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A0A6J1IM16 uncharacterized protein LOC1114782444.4e-16578.98Show/hide
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No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30050.1 unknown protein9.5e-8052.54Show/hide
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        MAYRRRQ ITRASTFKE+I++   + DH  +           S S SS SSLAAQAIRA      SS +  F                       KSES+
Subjt:  MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDEFDHNSI-----------SSSSSSSSSLAAQAIRASATHHDSSHSSAFAGASSNFSPGHMRSKSFAGENVFKSESK

Query:  SGFWGVLARKAKAILEEDDIAIEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKL
         GFWG+LA+KAK+ILE+++                   Q+  Q  N    +  NP IRK +D I+TSLN +GD+FEKA+ EGRTIV +            
Subjt:  SGFWGVLARKAKAILEEDDIAIEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKL

Query:  QIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSP--EPNMQTH-HETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNR-A
        QIR+KG++   L  + NN + Q +  S   +P  Q +  E+QLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKT+KADLAFAKERC+QLEEENK LR+NR+KG+N  A
Subjt:  QIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSP--EPNMQTH-HETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNR-A

Query:  DDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLS---------NSVSPRSPTSPSSPMEV
        DDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVY+DEG+EEV EV     +P IT+TLS          S+SP SP+SP+SP  +
Subjt:  DDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLS---------NSVSPRSPTSPSSPMEV

Query:  LPAVPPPPIQSKQ
          +    PI  +Q
Subjt:  LPAVPPPPIQSKQ

AT2G30530.1 unknown protein9.2e-7553.04Show/hide
Query:  KEEIHYPSDEFDHNSISS------SSSSSSSLAAQAIRASATHHDSSHSSAFAGASSNFSPGHMRSKSFAGENVFK---SESKSGFWGVLARKAKAILEE
        KE +  P+    ++S SS      SSS++SSLAA+AIRAS+ H DSS SSA++  SS   P   +  + A E       +E K GFWG LA KAKA L+E
Subjt:  KEEIHYPSDEFDHNSISS------SSSSSSSLAAQAIRASATHHDSSHSSAFAGASSNFSPGHMRSKSFAGENVFK---SESKSGFWGVLARKAKAILEE

Query:  DD-IAIEEEPSRFQ---PINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLY
        DD   + + P R +   P  T++ ++E  Q+     +K++NP++++ LDAI++SLN +G T      EG T VEN+TA IIQETRK +I+KK        
Subjt:  DD-IAIEEEPSRFQ---PINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLY

Query:  PAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKA
        P++    Q P IQ+         E QLKASRDVAMA AAKAKLLLRELK +K+DLAFAK+RCAQLEEENK+LRENR       DDDL+RLQLETLLAEKA
Subjt:  PAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKA

Query:  RLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLSNSVSP
        RLAHENSIY REN +LR +VEYHQLTMQDVVY DE  EEVTEVYPI+ S  ++ +  NS +P
Subjt:  RLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLSNSVSP

AT4G02800.1 unknown protein1.4e-2735.43Show/hide
Query:  DIAIEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVE----------NKTADIIQETRKLQIRKKGNN
        D+ +EE     +P+  +       +S      K D+  + KG D++S +L+ L    + A    R + +          N  AD IQ  +K +  ++   
Subjt:  DIAIEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVE----------NKTADIIQETRKLQIRKKGNN

Query:  TEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETL
        ++G      +  +Q    S E   +      +K ++++A++ AAKA  L RELKTIK+DL+F +ERC  LEEENK LR+   KG    +DDL+RLQLE L
Subjt:  TEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETL

Query:  LAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTS
        LAEKARLA+EN+   REN+ L ++VEYHQ+T QD   L    E+V + + +  S
Subjt:  LAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTS

AT5G01970.1 unknown protein7.0e-8352.99Show/hide
Query:  MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDEFDHNSISSSSSSSSSLAAQAIRASATHHDSSHSSAFAGASSNFSPGHMRSKSFAGENVFKSESKSGFWGVLARKA
        MAYRRRQ I + +TFKEE+    D     SI++    S                         A S+ +    RSK+F  E         G WGV+A+KA
Subjt:  MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDEFDHNSISSSSSSSSSLAAQAIRASATHHDSSHSSAFAGASSNFSPGHMRSKSFAGENVFKSESKSGFWGVLARKA

Query:  KAILEED---DIAIEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKG--
        K+++E+D   D +     SRF  ++                KK DNP +R+GLD +++SLNQ+GDTFEKA+ +GRT+VENKTADIIQETRKLQ R++G  
Subjt:  KAILEED---DIAIEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKG--

Query:  --NNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTH---HETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRE-NREKGDNRADDDL
          +  +     V++ W+    +SPE  MQ +   HETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKT+KADLAFAKERCAQLEEENK LRE +REKG N AD+DL
Subjt:  --NNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPNMQTH---HETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRE-NREKGDNRADDDL

Query:  IRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLSNSVSPRSPTSPSSPM
        IRLQLE+LLAEKARLAHENS+YARENRFLREIVEYHQLTMQDVVY+DEG EEVT+V     SP ++  +++S + RS + PS  M
Subjt:  IRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQDVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLSNSVSPRSPTSPSSPM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTATAGGAGGAGACAAGCAATCACCAGAGCTTCTACTTTCAAAGAAGAGATCCATTATCCTTCTGACGAATTTGATCACAATTCCATCTCTTCTTCCTCCTCTTC
CTCTTCTTCTCTTGCTGCCCAAGCGATCCGAGCTTCTGCTACTCATCATGATTCTTCTCATTCCTCTGCCTTTGCCGGTGCTTCCTCCAACTTTTCCCCTGGCCATATGC
GATCCAAGAGTTTTGCTGGTGAGAATGTATTCAAAAGTGAGTCAAAATCCGGGTTTTGGGGTGTTCTGGCTCGGAAAGCTAAGGCCATTCTTGAAGAAGATGATATAGCC
ATAGAAGAGGAACCAAGTAGGTTCCAGCCCATTAATACCTCAAACCGTAGCCAGGAGCCATGTCAGTCAACAAATTGCGACTCAAAGAAAACGGACAATCCGGCAATACG
GAAGGGTTTGGATGCAATCTCAACTTCGCTTAATCAACTTGGGGACACATTTGAAAAGGCATACGGGGAAGGTCGCACAATTGTGGAAAATAAGACTGCAGACATAATTC
AAGAAACTCGCAAACTGCAGATTAGGAAAAAGGGCAATAATACTGAAGGGTTATACCCTGCTGTGAATAATCAATGGCAGCAACCGAATATACAATCTCCAGAACCAAAT
ATGCAAACACATCATGAAACTCAACTGAAGGCATCTCGAGACGTTGCGATGGCAACAGCTGCCAAGGCCAAACTGTTACTTCGGGAGCTGAAAACCATTAAAGCAGATCT
GGCTTTTGCTAAAGAAAGATGTGCACAACTAGAGGAAGAAAACAAAATTCTCAGGGAAAATCGGGAGAAGGGAGATAATCGTGCAGATGATGACTTGATTCGGCTTCAAT
TAGAGACTCTTTTGGCTGAGAAAGCACGTTTGGCGCATGAGAATTCAATATATGCCAGGGAGAACCGTTTCTTAAGGGAAATTGTGGAGTACCATCAACTGACAATGCAA
GATGTGGTCTATTTAGATGAAGGAATGGAAGAAGTTACAGAAGTTTATCCCATATCCACCTCTCCAGAGATCACCAAAACGCTTTCTAATTCTGTTTCCCCACGCTCCCC
AACCTCACCTTCTTCACCCATGGAAGTTCTTCCTGCTGTTCCTCCTCCTCCTATTCAATCTAAACAAGATAAGGATCATCATGACAAAGACAGTGATGAACACCCAACTT
CCAGTACTACATTTTCTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTACTAAAACAAAACCCTTGCCTTCTACTACTTCTTCTTCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTATAGGAGGAGACAAGCAATCACCAGAGCTTCTACTTTCAAAGAAGAGATCCATTATCCTTCTGACGAATTTGATCACAATTCCATCTCTTCTTCCTCCTCTTC
CTCTTCTTCTCTTGCTGCCCAAGCGATCCGAGCTTCTGCTACTCATCATGATTCTTCTCATTCCTCTGCCTTTGCCGGTGCTTCCTCCAACTTTTCCCCTGGCCATATGC
GATCCAAGAGTTTTGCTGGTGAGAATGTATTCAAAAGTGAGTCAAAATCCGGGTTTTGGGGTGTTCTGGCTCGGAAAGCTAAGGCCATTCTTGAAGAAGATGATATAGCC
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ATGCAAACACATCATGAAACTCAACTGAAGGCATCTCGAGACGTTGCGATGGCAACAGCTGCCAAGGCCAAACTGTTACTTCGGGAGCTGAAAACCATTAAAGCAGATCT
GGCTTTTGCTAAAGAAAGATGTGCACAACTAGAGGAAGAAAACAAAATTCTCAGGGAAAATCGGGAGAAGGGAGATAATCGTGCAGATGATGACTTGATTCGGCTTCAAT
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CCAGTACTACATTTTCTGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGTACTAAAACAAAACCCTTGCCTTCTACTACTTCTTCTTCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYRRRQAITRASTFKEEIHYPSDEFDHNSISSSSSSSSSLAAQAIRASATHHDSSHSSAFAGASSNFSPGHMRSKSFAGENVFKSESKSGFWGVLARKAKAILEEDDIA
IEEEPSRFQPINTSNRSQEPCQSTNCDSKKTDNPAIRKGLDAISTSLNQLGDTFEKAYGEGRTIVENKTADIIQETRKLQIRKKGNNTEGLYPAVNNQWQQPNIQSPEPN
MQTHHETQLKASRDVAMATAAKAKLLLRELKTIKADLAFAKERCAQLEEENKILRENREKGDNRADDDLIRLQLETLLAEKARLAHENSIYARENRFLREIVEYHQLTMQ
DVVYLDEGMEEVTEVYPISTSPEITKTLSNSVSPRSPTSPSSPMEVLPAVPPPPIQSKQDKDHHDKDSDEHPTSSTTFSEEEEEEEEEGTKTKPLPSTTSSS